Electron Transfer Dissociation(ETD)

Thermo Scientific™ Electron Transfer Dissociation(ETD) 옵션을 사용하여 단백질 및 그 전사후 변형(PTM)의 분석을 향상시킬 수 있습니다. 펩타이드 백본에서 약하게 결합된 변형을 쪼개는 CID와 달리, ETD는 서열 독립적 방식으로 펩타이드 백본을 따라 단편화를 유도하여 펩타이드 사슬에 연결된 불안정한modification을 분리합니다. 그러면 변형 사이트 식별이 매우 간단해집니다. ETD는 기본적으로 CID에서 생성되는 b형 및 y형 이온을 보완하는 c형 및 z형 단편 이온을 생성하여 서열 적용 범위 및 단백질 ID를 확대합니다.

ETD(Electron transfer dissociation)는 전사후 변형 단백질의 분석에 매우 유용한 도구입니다. ETD 기능은 다수의 Thermo Scientific™ 이온 트랩 및 Orbitrap™ 질량 분석기에 추가할 수 있습니다. Thermo Scientific™ Proteome Discoverer™ 소프트웨어는 사용자가 ETD에서 제공하는 정보를 최대로 활용할 수 있게 도와주는 독자적인 기능을 포함하고 있습니다.

• ETD는 불안정한 PTM을 보존하여 펩타이드 서열분석과 변형 사이트를 간단하게 규명 가능
• 탑다운 분석의 경우, 변형 없는 단백질로부터의 스펙트럼을 크게 단순화하는 양자 전달 반응(PTR)과 ETD를 결합 가능
• 저질량 동중원소 질량 태그를 포함하는 워크플로우의 경우, 정상적인 로우 메스 컷오프를 배제하는pulsed-Q dissociation (PQD)와 ETD를 결합 가능
• ETD는 대부분의 Thermo Scientific LTQ 시리즈 이온 트랩 및 하이브리드 이온 트랩-Orbitrap 질량 분석기에 추가 가능
• Proteome Discoverer 소프트웨어는 ETD 스펙트럼에 특별히 최적화된 특허 받은 Z-Core 데이터베이스 검색 알고리즘을 탑재
• Proteome Discoverer 소프트웨어는 상호보완적 CID 및 ETD 결과를 용이하게 병합하여 단백질 서열 적용 범위를 최대화할 수 있음