Axiom™ Apple Genotyping Array
Axiom™ Apple Genotyping Array
Applied Biosystems™

Axiom™ Apple Genotyping Array

Axiom Apple Genotyping Array (Axiom_Apple480) se ha diseñado a través del programa de diseño de expertos Affymetrix en colaboración conMás información
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Número de catálogo 550573
Precio (MXN)
-
Axiom Apple Genotyping Array (Axiom_Apple480) se ha diseñado a través del programa de diseño de expertos Affymetrix en colaboración con el consorcio FruitBreedomics (www.FruitBreedomics.com). La secuenciación y selección de marcadores fue realizada por expertos de Fondazione Edmund Mach, INRA, Dalhousie University, Wageningen UR, University Di Bologna, and Universita Degli Studi Di Milano.

La matriz de 96 formatos incluye marcadores identificados mediante datos de secuencia del genoma completo de 63 cultivares de Malus domestica y dos muestreos de dobles haploides. En la Tabla 1 se indica el número de cultivares y el país de origen correspondiente utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP.

Axiom Apple Genotyping Array incluye 480 000 marcadores y, junto con el software Analysis Suite de Axiom, supera los retos de genotipado asociados a la poliploidía, la rápida descomposición del desequilibrio de enlaces (LD) y el elevado polimorfismo observado en el genoma de la manzana.

Características destacadas de la matriz
• Diversidad muy elevada
• Incluye marcadores descubiertos en 63 cultivares de M. domestica de todo el mundo• Alta resolución para abordar la rápida descomposición de LD   - 487 249 marcadores en la matriz
   - sesgo hacia variantes comunes con frecuencia de alelos menor (MAF) >0,05
   - Incluye 21 463 marcadores previamente validados: 19 990 marcadores de una matriz de 20 000 manzanas de Fruitbreedomics existente en el mercado y 1473 marcadores identificados mediante genotipado por secuenciación (GBS)
• Ausencia de variantes paralógicas mediante el uso de muestreos de dobles haploides en descubrimiento de SNP

Aplicaciones de Axiom Apple Genotyping Array
• Creación de mapas genéticos de alta resolución
• Mapeo exhaustivo de loci de rasgo cuantitativo
• Estudios de asociación del genoma completo

Productos necesarios
Software GeneChip Command Console
Instrumental GeneTitan Multi-ChannelAxiom Apple Genotipping Array (Axiom_Apple480) se ha diseñado a través del programa de diseño de expertos de Affymetrix en colaboración con el consorcio FruitBreedomics (www.FruitBreedomics.com). La secuenciación y selección de marcadores fue realizada por expertos de Fondazione Edmund Mach, INRA, Dalhousie University, Wageningen UR, University Di Bologna, and Universita - Degli Studi Di Milano.

La matriz de 96 formatos incluye marcadores identificados mediante datos de secuencia del genoma completo de 63 cultivares de Malus domestica y dos muestreos de dobles haploides. En la Tabla 1 se indica el número de cultivares y el país de origen correspondiente utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP.

Axiom Apple Genotyping Array incluye 480 000 marcadores y, junto con el software Analysis Suite de Axiom™, supera los retos de genotipado asociados a la poliploidía, la rápida descomposición del desequilibrio de enlaces (LD) y el elevado polimorfismo observado en el genoma de la manzana.

Características destacadas de la matriz
  • Diversidad muy elevada
  • Incluye marcadores descubiertos en 63 cultivares de M. domestica de todo el mundo
  • Alta resolución para abordar la rápida descomposición de LD
    • 487 249 marcadores en la matriz
    • Sesgo hacia variantes comunes con frecuencia de alelos menor (MAF) >0,05
    • Incluye 21 463 marcadores previamente validados: 19 990 marcadores de una matriz de 20 000 manzanas de Fruitbreedomics existente en el mercado y 1473 marcadores identificados mediante genotipado por secuenciación (GBS)
  • Ausencia de variantes paralógicas mediante el uso de muestreos de dobles haploides en descubrimiento de SNP
Aplicaciones de Axiom Apple Genotyping Array
  • Creación de mapas genéticos de alta resolución
  • Mapeo exhaustivo de loci de rasgo cuantitativo
  • Estudios de asociación del genoma completo

Tabla 1: El país de origen y el número de cultivares utilizados en el proceso de descubrimiento de SNP para Axiom Apple Genotyping Array.
País de origen Número de cultivares
Australia 1
Europa central 39
Canadá 1
Irán 1
Simmental 16
Japón 1
Nueva Zelanda 1
Norte de Europa 4
Rusia 9
Túnez 1
Estados Unidos 5
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
Especificaciones
Para utilizar con (aplicación)Microarray Analysis
Cantidad1 placa
matriz, red, conjuntoGenotyping
Formato96-array Plate
Número de arrays96 matrices
EspecieApple
Unit Size1 plate

Preguntas frecuentes

What is the starting amount of DNA required for Axiom arrays?

All Axiom arrays (except for Axiom Genome-Wide Pan-African Array Set) require a total of 200 ng DNA. The Axiom Genome-Wide Pan-African Array Set requires a total of 300 ng DNA, or 100 ng DNA per array (there are 3 arrays).

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Microarray Analysis Support Center.

What are the sample requirements for Axiom array processing at the Thermo Fisher Scientific Microarray Research Services Laboratory (MRSL)?

For information regarding our in-house MRSL requirements, please contact us via phone at 888-362-2447 (in North America) or via email at BioinformaticsServices@thermofisher.com.

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