BioPrime™ Total FFPE Genomic Labeling System

Los sistemas de etiquetado genómico de FFPE total BioPrime™ son kits completos de etiquetado de ADN genómico diseñados para suMás información

Número de catálogo	Cantidad
A10965011 también denominado A10965-011	30 reacciones

Número de catálogo A10965011

también denominado A10965-011

Precio (MXN)

Cantidad:

30 reacciones

Los sistemas de etiquetado genómico de FFPE total BioPrime™ son kits completos de etiquetado de ADN genómico diseñados para su uso en aplicaciones de hibridación genómica comparativa (aCGH) utilizando muestras integradas en parafina fijadas en formol (FFPE). Los protocolos anteriores requerían grandes cantidades de ADN de muy alta calidad, que a menudo eran difíciles de obtener de materiales FFPE. Con un método de amplificación de cebador aleatoria (RPA), utilizando mezclas de etiquetado específicamente formuladas para muestras FFPE, el sistema de etiquetado genómico FFPE total BioPrime™ genera altas producciones del ADN etiquetado más representativo de la muestra inicial. Se consigue una mayor precisión de las llamadas con una mayor producción del material etiquetado en la matriz, proporcionando llamadas más precisas. El sistema de etiquetado genómico de FFPE total BioPrime™ ofrece a los usuarios las siguientes ventajas:

— Tasa de llamadas mejorada con relaciones señal-ruido más altas de colorantes Alexa Fluor™ 3 y 5
— Limpieza fácil con la purificación PureLink™, elimina la necesidad de pasos complicados de reducción de volumen
— Menor sesgo de canal gracias a la nueva formulación de reacción mejorada para muestras FFPE
— Menos requisitos para el material de entrada utilizando el método enzimático RPA

Este completo kit con todo incluido está optimizado para trabajar con una variedad más amplia de materiales de entrada de muestras sin necesidad de amplificación previa. El fragmento exo-Klenow altamente concentrado de ADN polimerasa I en una reacción limitada de componente permite una producción de ADN consistente y robusta de la entrada de ADN de FFPE genómico. El aCGH BioPrime™ Total para Agilent™ se suministra con purificación PureLink™ que permite una baja elución, eliminando la necesidad de complicados pasos de reducción de volumen. La purificación PureLink™ también reduce el fondo debido al colorante que se encuentra en otros sistemas de purificación. Una mezcla optimizada de nucleótidos marcados con colorantes con nuevos enlazadores dNTP, nuevos colorantes Alexa Fluor™ 3 y 5 de aplicación específica y una química de tampón mejorada reducen la variación de etiquetado y aumentan la señal a ruido en las matrices. Los espectros de excitación y emisión de los colorantes Alexa Fluor™ 3 y 5 son adecuados para escáneres convencionales de dos colores sin necesidad de cambiar los ajustes. Los kits completos se prueban por lotes para garantizar la calidad del rendimiento entre lotes.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Especificaciones

Excitación/emisión650/670, 555/565

Incluye etiqueta o tinteSí

Método de etiquetadoEtiquetado directo

Línea de productosBioPrime

Tipo de productoSistema de etiquetado genómico

Cantidad30 reacciones

Método de detecciónFluorescencia

Tipo de producto finalSondas (ADN etiquetado)

Labeling TargetADN genómico

Etiqueta o tinteAlexa Fluor™ 3, Alexa Fluor™ 5

Tipo de muestraTejido (FFPE)

Unit SizeEach

Contenido y almacenamiento

Contiene mezcla de nucleótidos Alexa Fluor™ 3 FFPE 10X y mezcla de nucleótidos Alexa Fluor™ 5 FFPE 10X, fragmento Exo-Klenow (40 u⁄µl), 5 mm de EDTA, solución de cebadores aleatorios 2.5X, ADN de control (esperma de salmón) y agua tratada con DEPC. Almacenar a -80 °C para el almacenamiento a largo plazo. Las 10X mezclas de nucleótidos pueden almacenarse a + 4 °C durante un máximo de cuatro semanas y deben protegerse de la luz. También contiene columnas de purificación de ADN genómico y tampones de purificación PureLink™. Almacenar a temperatura ambiente. Se garantiza la estabilidad de todos los componentes durante 6 meses si se almacenan correctamente.

Preguntas frecuentes

Why is the selection of a BioPrime Genomic Labeling System so important?

The overall performance of your microarray experiment is driven by numerous factors including the microarray, amplification method, labeling method, hybridization solutions/conditions, blocking and wash methods, as well as performance of the associated hardware systems. In order to achieve the highest confidence in your array results best in class components must be selected for each step. Invitrogen’s BioPrime Total and Cot-1 DNA products are the proven labeling and blocking reagents to increase accuracy, sensitivity, and simplicity.

When using BioPrime Genomic Labeling Systems, why is random primed linear amplification (RPA) so important for these applications?

All of the BioPrime Genomic Labeling systems are based on linear, random primed amplification methods-the best method to maintain accurate representation of copy number. Other methods of amplification may provide inaccurate amplification of starting material which potentially invalidate array results.

What are the differences between Alexa Fluor 3 and 5 used in the BioPrime Genomic Labeling Systems?

Both lines of Alexa Fluor dyes can be used on traditional 2 color scanners with excitation and emission wavelengths optimized for these scanners.  The Alexa Fluor 3 and Alexa Fluor 5 dye conjugated nucleotides have been optimized for DNA Microarray applications and are incorporated with the enzymes used in BioPrime Total Genomic Labeling systems to provide excellent performance when dried down on arrays. Excitation/Emission for Alexa Fluor 3 is 555/565 nm. For Alexa Fluor 5 it is 650/670 nm.

Which BioPrime Genomic Labeling System is right for me?

The BioPrime Total array CGH reagents offer various configurations to allow for optimal performance on arrays based on premier enzymes, primers, dyes and purification systems. For 2 color array CGH and ChIP on Chip experiments Invitrogen recommends the BioPrime Total Genomic Labeling system. The BioPrime Total Genomic Labeling system allows for the lowest starting input material, includes application optimized dye labeled nucleotides with Alexa Fluor 3 and Alexa Fluor 5 dyes, and is the simplest, easiest to use kit in the product family.  For researchers favoring other dyes, BioPrime aCGH Genomic Labeling systems are available without dyes and can be used with your dye of preference to offer superior yield and total dye incorporation due to higher performance enzymes and reagents from Invitrogen. Both BioPrime Total and BioPrime array CGH kits have been successfully used with both oligo and BAC arrays from vendors such as:  Agilent, Perkin Elmer, Signature Genomics, Combimatrix Diagnostics, and BlueGnome. For microarray systems requiring biotin labeling the BioPrime DNA Labeling system includes biotin labeled nucleotides in the kit and has been successfully used in both one and two color microarray experiments. View the Genomic array CGH selection guide.