TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ Kit
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TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ Kit

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El kit de expresión génica TaqMan™ Cells-to-CT™ permite realizar análisis de expresión directamente de las células cultivadas sin necesidad deMás información
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AM1728100 reacciones
AM1729400 reacciones
439900240 reacciones
Número de catálogo AM1728
Precio (MXN)
-
N.º de reacciones:
100 reacciones
El kit de expresión génica TaqMan™ Cells-to-CT™ permite realizar análisis de expresión directamente de las células cultivadas sin necesidad de purificar el ARN. Este kit permite ahorrar tiempo y ofrece un flujo de trabajo sencillo que puede utilizarse con unas pocas muestras o incorporarse fácilmente a aplicaciones automatizadas de alto rendimiento.

El kit de expresión génica TaqMan™ Cells-to-CT consiste en:

• Completo: el flujo de trabajo optimizado incluye reactivos de lisis celular con eliminación de ADNg, mezcla de enzimas de RT, tampón, y nueva mezcla maestra de expresión génica TaqMan™
• Rápido: preparación de muestras en 7 minutos, lo que incluye el tratamiento ADNasa a temperatura ambiente
•Sencillo: lise las muestras en un tubo o directamente en una placa de cultivo
• Sólido: realice análisis de expresión génica de entre 10–100.000 células por muestra; los resultados son equivalentes a los que se obtienen con ARN purificado
• Eficaz: contiene reactivos suficientes para generar 500 resultados de PCR en tiempo real a partir de 100 muestras iniciales

Con un método único para lisar células cultivadas, al tiempo que elimina el ADN genómico y preserva la integridad del ARN, el kit de expresión génica TaqMan™ Cells-to-CT™ contiene reactivos de transcripción inversa (RT) para la síntesis de ADNc y la mezcla maestra de expresión génica TaqMan™ para el análisis de PCR en tiempo real. Los conjuntos Taqman™ de cebador⁄sondas se venden por separado.

Preparación de muestras sencilla en 7 minutos: parte de un flujo de trabajo completo
Ya sea que se utilicen placas o tubos, el kit Taqman™ de expresión génica Cell-to-CT™, que utiliza el sencillo procedimiento de preparación de muestras de 7 minutos descrito (consulte la figura), está diseñado para 10–100.000 muestras⁄células cultivadas. Las células se lavan en PBS y se lisan en la solución durante 5 minutos a temperatura ambiente; el tratamiento de ADNasa se puede realizar simultáneamente. Para finalizar la lisis, las células se deben someter a un proceso de incubación de 2 minutos con solución de parada a temperatura ambiente. Los lisados ya están listos para la transcripción inversa o el almacenamiento a –20 °C. Puesto que las muestras se pueden procesar directamente en pocillos de cultivo (96 o 384 pocillos), la manipulación de las muestras y la posibilidad de pérdida de las muestras o de error de transferencia se reducen al mínimo, lo que permite disfrutar de un procesamiento de alto rendimiento rápido. A diferencia de los antiguos protocolos de aislamiento de ARN compuestos por varios pasos, con este kit no es necesario llevar a cabo ningún paso de calentamiento, lavado o centrifugación. El kit simplifica enormemente un laborioso proceso de 30–60 minutos y lo reduce a 7 minutos.

El flujo de trabajo del kit TaqMan™ para la expresión génica Cells-to-CT™ TaqMan permite una evaluación insuperable de la expresión génica con cualquiera de los >700.000 ensayos de expresión génica TaqMan™. La especificidad de este kit ha sido ampliamente probada con una gran selección de ensayos de expresión génica TaqMan™ y muestra un rendimiento equivalente al obtenido con ARN purificado (consulte la figura).

Logre un rendimiento y una sensibilidad inigualables
A diferencia de algunos kits de la competencia que limitan la cantidad de lisado en la reacción de RT al 5 %, el kit TaqMan™ de expresión génica Cells-to-CT™ puede acomodar el 45 % del volumen total de reacción de RT como lisado celular. Además, el ADNc puede constituir hasta el 45 % del volumen de la reacción de PCR en tiempo real. El elevado volumen de lisados en la reacción de RT optimizada, junto con el elevado volumen de ADNc que se obtiene en la posterior PCR en tiempo real con la mezcla maestra para expresión génica TaqMan™, producen una sensibilidad máxima. La mezcla maestra amplifica el objetivo de forma precisa y exacta, permitiendo la detección de pequeñas cantidades de objetivo, como transcripciones expresadas a niveles bajos.

La capacidad de detectar cantidades objetivo limitadas se probó mezclando un número constante de células humanas con varios números de células de ratón. Las mezclas de células se prepararon con el kit de expresión génica TaqMan™ Cells-to-CT™ y se analizaron para detectar un gen específico de ratón y un gen específico de humano. Los datos comparativos se generaron de la misma forma con ARN purificado mediante la metodología tradicional. Los datos muestran que solo se podía detectar ARN de 10 células de ratón en un fondo de ARN de 10.000 células humanas (ver figura). La capacidad del kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ para detectar transcripciones de baja abundancia relativa era equivalente a la del ARN purificado; a niveles bajos, era superior.

Además, el rendimiento del kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ se comparó con los kits de lisado de la competencia y con el ARN purificado. Para ello, se examinaron de 100 a 100 000 células⁄reacciones de lisis. La sensibilidad del protocolo del kit TaqMan Cells-to-CT fue equivalente a la que se obtuvo con el ARN purificado y superior a la de los lisados de la competencia (ver figura).La sensibilidad del protocolo del kit TaqMan™ Cells-to-CT™ fue equivalente a la que se obtuvo con el ARN purificado y superior a la de los lisados de la competencia (ver figura). Además, la falta de inhibición a altos insumos celulares y la baja variación entre réplicas técnicas demuestran la fiabilidad de este enfoque para estudios de expresión génica mediante células cultivadas.

Rendimiento probado y probado en conjunto
Todos los componentes del kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ se han optimizado para ofrecer un rendimiento uniforme y fiable. Esto elimina las conjeturas asociadas con la preparación de muestras separadas, la RT y los kits de PCR en tiempo real. Y el kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ se ha validado con ensayos de expresión génica TaqMan™ para ofrecer una mayor garantía de calidad.

Producto accesorio
El kit de control TaqMan™ Cells-to-CT™ se ha diseñado para su uso con el kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™. Este kit contiene un control endógeno (ACTB) para normalizar la variabilidad de la carga de muestras y un control artificial XenoRNA™ y el correspondiente ensayo de expresión génica TaqMan™ para controlar los efectos de la inhibición de PCR.
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Para utilizar con (equipo)Sistema 7000, Sistema 7300, Sistema 7500, Sistema 7900HT, Sistema de PCR en tiempo real rápido StepOnePlus™ de Applied Biosystems, StepOne™, Modo estándar, StepOnePlus™, Modo estándar, Sistemas QuantStudio 6 y 7 Pro, Sistema QuantStudio 7 Flex, Sistemas QuantStudio 3 y 5, Sistema QuantStudio 12k Flex, Sistema QuantStudio 6 Flex
FormatoTubo
Características ecológicasMenos recursos utilizados y menos residuos, menos peligroso
N.º de reacciones100 reacciones
Colorante de referencia pasivaROX (premezclado)
PolimerasaADN polimerasa
Línea de productosAmbion, Cells-to-CT, TaqMan
Tipo de productoKit de expresión génica de células a C
Grado de pureza o calidadUP (ultrapura)
Cantidad100 reactions
Tipo de reactivoLisis celular
Transcriptasa inversaM-MLV
Tipo de muestraCelda
Condiciones de envíoHielo seco
Suficiente para100 reacciones
Método de detecciónSonda de cebado
GC-Rich PCR PerformanceAlto
Método de PCRRT-qPCR de 2 paso
Velocidad de reacciónEstándar
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
Contiene:
• Solución de parada: Tubo de 500 µl
• ADNasa I: tubo de 55 µl
• Mezcla de enzimas 20X RT: Tubo de solución de lisis de 275 µl
•: Frasco de 5,5 ml
• Tampón de RT 2X: Frasco de 5,5 ml
• Mezcla maestra de expresión génica TaqMan™ Frasco de 5 m

Almacenar la solución de parada, la ADNasa I y la mezcla de enzimas de RT 20X a -20 °C.
Almacenar la solución de lisis, el tampón de RT 2X y la mezcla maestra de expresión génica TaqMan™ a 4 °C.

Preguntas frecuentes

I'm seeing PCR products in the minus-RT control after performing my Cells-to-CT experiment. What does this mean?

If PCR products are seen in the minus-RT control reaction, but not in the no-template control, it indicates that genomic DNA remains in the sample and that genomic DNA was amplified in real-time PCR. Please follow the suggestions below:

- Ensure the DNase I is mixed thoroughly into the Lysis Solution.
- Use fewer cells per lysis reaction.
- Lyse cells using Lysis Solution that is at room temperature, and make sure that the lysis reaction occurs at room temperature.
You can also try increasing the incubation time of the lysis reaction to 8 minutes and/or using Lysis Solution that has been warmed up to 25 degrees C for cell lysis.

I'm getting PCR products in the no-template PCR control when performing a Cells-to-CT experiment. What could cause this?

PCR products in the no-template PCR control indicate that the sample is contaminated with DNA. More stringent steps need to be taken to control contamination.

I'm getting no PCR product or unexpected PCR products after performing a Cells-to-CT experiment. What could be the cause of this?

Please review the following possibilities and suggestions:

- A problem with adding or mixing the Stop Solution: ensure that the Stop Solution was added directly to the lysate, as components of the Lysis Solution may inhibit RT-PCR if not fully inactivated.
- The RNA was degraded: keep cells in PBS on ice before starting the cell lysis procedure.
- RNase in the sample was not completely inactivated: Too many cells could have been used or too much PBS left on the cells, diluting the lysis solution.
- The lysates sat too long before going to room temperature: Do not allow lysates to sit longer than 20 minutes at room temperature once the Stop Solution has been added.
- The sample does not contain the target RNA: Verify that the procedure is working by using the XenoRNA Control in the sample. Also check that your PCR primers can amplify your target under the PCR conditions you are using.

I ran out of stop solution for my Cells-to-CT experiment. Can I purchase it separately?

Yes, it is available in 1 mL aliquots (Cat. No. 4402960).

I have genomic DNA contamination in my Cells-to-CT reaction. How do I get rid of it?

1. Ensure that all medium is removed from the wells.
2. Wash with an equal volume of room temperature 1X PBS after the medium is removed.
3. Ensure that the reaction happens at room temperature (the lysis reaction may not reach room temperature if the plate is on ice, if the plate was quickly moved to the bench, or if a cold lysis solution was added).
4. Warm lysis solution to room temperature before adding to cells.
5. Allow the lysis reaction to proceed for 8 minutes at 25 degrees C.

Citations & References (3)

Citations & References
Abstract
Genome-wide siRNA-based functional genomics of pigmentation identifies novel genes and pathways that impact melanogenesis in human cells.
Authors:Ganesan AK, Ho H, Bodemann B, Petersen S, Aruri J, Koshy S, Richardson Z, Le LQ, Krasieva T, Roth MG, Farmer P, White MA,
Journal:PLoS Genet
PubMed ID:19057677
'Melanin protects the skin and eyes from the harmful effects of UV irradiation, protects neural cells from toxic insults, and is required for sound conduction in the inner ear. Aberrant regulation of melanogenesis underlies skin disorders (melasma and vitiligo), neurologic disorders (Parkinson''s disease), auditory disorders (Waardenburg''s syndrome), and opthalmologic disorders ... More
N-methylpurine DNA glycosylase and DNA polymerase beta modulate BER inhibitor potentiation of glioma cells to temozolomide.
Authors:Tang JB, Svilar D, Trivedi RN, Wang XH, Goellner EM, Moore B, Hamilton RL, Banze LA, Brown AR, Sobol RW,
Journal:Neuro Oncol
PubMed ID:21377995
'Temozolomide (TMZ) is the preferred chemotherapeutic agent in the treatment of glioma following surgical resection and/or radiation. Resistance to TMZ is attributed to efficient repair and/or tolerance of TMZ-induced DNA lesions. The majority of the TMZ-induced DNA base adducts are repaired by the base excision repair (BER) pathway and therefore ... More
Accurate RT-qPCR gene expression analysis on cell culture lysates.
Authors:Van Peer G, Mestdagh P, Vandesompele J,
Journal:Sci Rep
PubMed ID:22355736
'Gene expression quantification on cultured cells using the reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) typically involves an RNA purification step that limits sample processing throughput and precludes parallel analysis of large numbers of samples. An approach in which cDNA synthesis is carried out on crude cell lysates instead of ... More