Para la fragmentación de ARNa antes de la hibridación con matrices de oligonucleótidos. El protocolo es sencillo, rápido y puede completarse en menos de 20 min. Se incluyen suficientes reactivos de Ambion® para 200 reacciones. Muchos protocolos para el uso de ARN amplificado en el análisis de micromatrices recomiendan fragmentar el ARNa antes de la hibridación con una micromatriz de oligonucleótidos. Este paso de fragmentación mejora la cinética de hibridación con los oligonucleótidos en la matriz y puede conducir a una señal mejorada. El protocolo es sencillo. Mezcle el ARNa con el reactivo de fragmentación de ARN Ambion® 10X y caliéntelo a 70 °C durante 15 min. La reacción se detiene mediante la adición de la solución de parada y se coloca en hielo hasta que esté lista para la hibridación con la micromatriz. El tamaño promedio de los fragmentos resultantes será de 60-200 nucleótidos. Se pueden fragmentar hasta 10 µg de ARN en una reacción de 10 µl.