RiboMinus™ Transcriptome Isolation Kit, yeast

Los kits de aislamiento de transcriptoma RiboMinus™ son sistemas de purificación novedosos que enriquecen todo el espectro de transcripciones deMás información

Número de catálogo	Cantidad
K155003	12 reacciones

Número de catálogo K155003

Precio (MXN)

Cantidad:

12 reacciones

Los kits de aislamiento de transcriptoma RiboMinus™ son sistemas de purificación novedosos que enriquecen todo el espectro de transcripciones de ARN al reducir las moléculas grandes de ARN ribosomal en una muestra de ARN total. Estos kits utilizan una sonda de ácido nucleico bloqueado (LNA) etiquetada con biotinas de 5 µ, específica para ARNr grandes para eliminar del 95 al 98 % de las moléculas de ARNr del ARN total de humano, ratón, bacterias o levaduras (figura 1). Esta eliminación aumenta la representación de las especies de transcripción de ARN, lo cual incluye ARN procesado previamente de cola sin poli(A), ARNt pequeños, ARNip, ARNip, microARN, ARNm fragmentado y otros ARN reguladores que no se pueden purificar a través de métodos de selección poli(A). Los kits de aislamiento de transcriptoma RiboMinus™ permiten:

• Análisis exhaustivo de todo el transcriptoma sin contaminación ni interferencias de ARNr
• Colección más completa de elementos transcritos del genoma, sin dependencia de los métodos de purificación poli(A)

• Análisis de micromatrices más limpio y claro gracias a las relaciones señal-fondo más altas (figura 2)

El ARN purificado está concentrado y es adecuado para numerosas aplicaciones posteriores, incluyendo el análisis de micromatrices (figura 2), construcción de bibliotecas y qRT-PCR.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Especificaciones

Tipo de producto finalARN de transcriptoma

Para utilizar con (aplicación)Análisis de micromatrices, PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR), PCR de transcriptasa inversa (RT-PCR), técnica Northern, construcción de bibliotecas de ADNc

FormularioGránulo magnético

Compatibilidad de alto rendimientoNo compatible con alto rendimiento (manual)

N.º de reacciones12 reactions

Línea de productosRiboMinus

Tiempo de purificación1,25 h

Cantidad12 reacciones

Cantidad de material de partidaHasta 10 µg de ARN total

Tipo de sistemaRiboMinus

Producción1 µg

Isolation TechnologyGránulo magnético

Tipo de muestraARN total (levadura)

TargetARN de transcriptoma

Unit SizeEach

Contenido y almacenamiento

Los kits de aislamiento RiboMinus™ incluyen gránulos magnéticos RiboMinus™, sondas de bacterias o levaduras de humano/ratón RiboMinus™ y tampón de hibridación. El módulo de concentración opcional RiboMinus™ contiene cartuchos de centrifugación, tubos de lavado, tubos de recuperación, tampón de unión, tampón de lavado y agua sin ARNasa (tratada con DEPC). Almacene los módulos de aislamiento a +4 °C y el módulo de concentración a temperatura ambiente. Se garantiza la estabilidad de todos los reactivos durante 6 meses si se almacenan correctamente.

Preguntas frecuentes

What is the best way to analyze RNA that I've isolated using a RiboMinus kit?

The purified RNA is easily quantitated using UV absorbance at 260 nm or a Quant-iT RNA Assay Kit. To verify rRNA depletion, electrophorese your sample on an agarose gel or use an Agilent 2100 Bioanalyzer. Agarose gel electrophoresis should show depletion of 18S and 28S rRNA bands compared to a control sample. Absence of contaminating DNA and RNA degradation may also be confirmed by agarose gel electrophoresis. The efficiency of rRNA depletion in the purified RNA, RNA degradation, and RNA concentration can also be analyzed using a bioanalyzer.

What species have you tested with your RiboMinus Eukaryote Kit for RNA-Seq?

With regard to species specificity, the following organisms have 0 mismatches for the LSU/SSU probes (LSU (28S) / SSU (18S) Probe perfect matches). This means the probes will remove the 18S and 28S sequences from the following species.

- Species from the Land: Human, mouse, rat, frog, rabbit, cow, pig, chicken, Drosophila,* Caenorhabditis elegans, midge, mosquito, yeast (Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe)
- Species from the Sea: Sea squirt, coelacanth, lancelet, eel, salmon, sturgeon, ratfish, lamprey, brown plankton, zooplankton
- Plants: Arabidopsis thaliana, Brassica napus, rice, tomato, Humulus lupulus, Zea mays, wheat, soybean, pine, aspen

* The 28S and 18S probes in this kit respectively align 100% to the Drosophila 18S and 28S rRNA sequence. However, there are reports suggesting Drosophila (insect) 28S rRNA split into 2 smaller fragments co-migrating with 18S. The exact split site is not identified yet. But based on customer feedback, this kit does not remove the split 28S rRNA completely. We have not tested Drosophila samples with this kit.

The 5S and 5.8S sequences are more divergent, and thus the best probes possible have reduced species breadth:
- 5S: zero to 1 mismatch: human, mouse, rat, frog, chicken, Drosophila, C. elegans, A. thaliana, Z. mays
- 5.8S: zero mismatches: human, mouse, rat

Citations & References (1)

Citations & References

Abstract

At-TAX: a whole genome tiling array resource for developmental expression analysis and transcript identification in Arabidopsis thaliana.

Authors:Laubinger S, Zeller G, Henz SR, Sachsenberg T, Widmer CK, Naouar N, Vuylsteke M, Schölkopf B, Rätsch G, Weigel D,

Journal:Genome Biol

PubMed ID:18613972

Gene expression maps for model organisms, including Arabidopsis thaliana, have typically been created using gene-centric expression arrays. Here, we describe a comprehensive expression atlas, Arabidopsis thaliana Tiling Array Express (At-TAX), which is based on whole-genome tiling arrays. We demonstrate that tiling arrays are accurate tools for gene expression analysis and ... More