Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning Kit for Sequencing, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli
Zero Blunt&trade; TOPO&trade; PCR Cloning Kit for Sequencing, with One Shot&trade; TOP10 Chemically Competent <i>E. coli</i>
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Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning Kit for Sequencing, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli

El Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning para secuenciación proporciona una estrategia de clonación de gran eficacia, de 5 minutos yMás información
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Precio (MXN)
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El Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning para secuenciación proporciona una estrategia de clonación de gran eficacia, de 5 minutos y de un solo paso para la inserción directa de productos de PCR de extremos romos amplificados con polimerasas de corrección en un vector plasmídico para secuenciación. Cada kit utiliza el vector pCR™4Blunt-TOPO™ (véase la figura) con sitios de primers de secuenciación especialmente diseñados que devuelven más secuencia de inserto y menos secuencia de vector de cada reacción. Estos kits incluyen todo lo necesario para clonar y seleccionar vectores recombinantes que contienen los fragmentos de PCR que elija.

Vector pCR™4Blunt-TOPO™: optimizado para secuenciación
Hemos eliminado gran parte del sitio de clonación múltiple del vector pCR™4Blunt-TOPO™ para acortar la distancia entre los sitios de primers de secuenciación y el sitio del inserto a tan solo 33 bp. De este modo, las reacciones de secuenciación proporcionan menos secuencia de vector y más secuencia de inserto. El vector pCR™4Blunt™ TOPO tiene sitios para 4 primers de secuenciación comunes: M13 directo, M13 inverso, T7 y T3. Los kits incluyen una alícuota de cada uno.

Manipulación y selección de clones pCR™4Blunt-TOPO™
El vector pCR™4Blunt-TOPO™ contiene marcadores de resistencia de ampicilina y kanamicina y la fusión de genes LacZα-ccdB para selección positiva. El sitio de clonación múltiple minimizado del vector aún incluye sitios EcoRI de flanqueo para la escisión simplificada de productos de PCR clonados y un único sitio Sse8387I para la generación de eliminaciones anidadas antes de la secuenciación. Los promotores de T7 y T3 están también presentes para la transcripción in vitro.

Clonación simplificada basada en TOPO™
Mediante la tecnología de clonación TOPO™, no hay necesidad de emplear primers de PCR que contengan secuencias específicas, procedimientos posteriores a la PCR, preparación de vectores u otros pasos de manipulación de ADN que consumen mucho tiempo. Solo tiene que añadir su reacción de PCR directamente al vector cargado con la topoisomerasa suministrado, incubar 5 minutos y transformar las células competentes de E. coli proporcionadas.

Clonación eficiente
Con hasta un 95 % de los clones con el inserto deseado, podrá sondear menor cantidad de clones y ahorrar tiempo y dinero. El vector pCR™4Blunt-TOPO™ utilizado en este kit se suministra sin salientes para una ligadura eficaz de productos de PCR creados por polimerasas de corrección termoestables que dejan productos de PCR con extremo romo.

La referencia en clonación
En el campo de la clonación, la tecnología de clonación TOPO™ ha sido un socio fiable durante más de diez años para miles de científicos. Rápida, fácil de usar y eficiente, la clonación TOPO™ se ha aplicado a muchos vectores distintos para multitud de aplicaciones.

Kit Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning para secuenciación: formatos del kit
El kit Zero Blunt™ TOPO™ PCR Cloning para secuenciación se puede adquirir con una variedad de células competentes que ofrecen diferentes ventajas en función de sus necesidades:

• Clonación general: Células TOP10 (n.º de cat. K2875-J10, K2875-20, K2875-40)
• Clonación de alta eficiencia: Células TOP10 Electrocomp™ (n.º de cat. K2880-20, K2880-40)
• Clonación general, resistencia T1 bacteriófaga: DH5α-T1R (n.º de cat. K2895-20)
• Crecimiento rápido: E. Coli Mach1™-T1R químicamente competente (n.º de cat. K2835-20)

Enlaces relacionados

Creación de vectores personalizados y servicios de clonación
Guía de selección del kit de purificación de ADN plasmídico
Reactivos, instrumentos y suministros de PCR
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Cepa bacteriana o de levaduraTOP10
Tipo de célulaQuímicamente competente
Método de clonaciónBlunt TOPO™
Para utilizar con (aplicación)Biología de la cromatina
Línea de productosOne Shot
Tipo de productoKit de clonación de PCR
PromotorT7, T3
Cantidad50 reacciones
VectorVectores de clonación de ADN romos
FormatoKit
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
Caja 1:
• Vector pCR™4Blunt-TOPO™ activado con la topoisomerasa I
• Solución salina
• dNTP
• Plantilla de control
• Primers directos T3, T7, M13 e inversos M13
• Primers de PCR de control
• Agua estéril

Almacenar entre -5 y -30 °C.
Todos los reactivos son estables durante 6 meses si se almacenan adecuadamente.

Caja 2:
E. coli químicamente competente One Shot™ o Electrocomp™
• Medio S.O.C.
• Plásmido de control superhelicoidal pUC19

Almacenar a entre -68 y -85 °C.

Preguntas frecuentes

What is the best molar ratio of PCR product:vector to use for TOPO TA cloning? Is there an equation to calculate the quantity to use?

We suggest starting with a molar ratio of 1:1 (insert:vector), with a range of 0.5:1 to 2:1. The quantity used in a TOPO cloning reaction is typically 5-10 ng of a 2 kb PCR product.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 (insert:vector ratio)

What is the best ratio of insert:vector to use for cloning? Is there an equation to calculate this?

The optimal ratio is 1:1 insert to vector. Optimization can be done using a ratio of 0.5-2 molecules of insert for every molecule of the vector.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio

I'm seeing a lot of vector-only colonies when I try to perform a negative control reaction using vector only (no insert) for a TOPO reaction. Is my TOPO vector re-ligating?

Using the vector only for transformation is not a recommended negative control. The process of TOPO-adaptation is not a 100% process, therefore, there will be “vector only” present in your mix, and colonies will be obtained.

I'm trying to clone in my phosphorylated PCR product into a TOPO vector, and I'm getting no colonies. However, when I clone the same product into a TA vector, everything works perfectly. Why is this?

Phosphorylated products can be TA cloned but not TOPO cloned. This is because the necessary phosphate group is contained within the topoisomerase-DNA intermediate complex of the vector. TOPO vectors have a 3' phosphate to which topoisomerase is covalently bound and a 5' phosphate. Non-TOPO linear vectors (TA and Blunt) have a 3' OH and a 5' phosphate. Phosphorylated products should be phosphatased (CIP) before TOPO cloning.

I'm able to get a lot of colonies, however, none contain my insert of interest. What should I do?

You may be cloning in an artifact. TA and TOPO Cloning are very efficient for small fragments (< 100 bp) present in certain PCR reactions. Gel-purify your PCR product using either a silica-based DNA purification system or electroelution. Be sure that all solutions are free of nucleases (avoid communal ethidium bromide baths, for example.)

Citations & References (4)

Citations & References
Abstract
Expression of human NAA11 (ARD1B) gene is tissue-specific and is regulated by DNA methylation.
Authors:Pang AL, Clark J, Chan WY, Rennert OM
Journal:Epigenetics
PubMed ID:22048246
'NAA10 gene encodes the catalytic subunit of N(alpha)-acetyltransferase NatA that catalyzes the acetylation of the N-termini of many eukaryotic proteins. A homologous gene called NAA11 is also present in mammalian cells. hNaa10p and hNaa11p are reported to be co-expressed in human cell cultures. In mouse tissues, however, Naa11 transcripts can ... More
Construction and testing of engineered zinc-finger proteins for sequence-specific modification of mtDNA.
Authors:Minczuk M, Kolasinska-Zwierz P, Murphy MP, Papworth MA
Journal:Nat Protoc
PubMed ID:20134433
Engineered zinc-finger proteins (ZFPs) are hybrid proteins developed to direct various effector domains (EDs) of choice to predetermined DNA sequences. They are used to alter gene expression and to modify DNA in a sequence-specific manner in vivo and in vitro. Until now, ZFPs have mostly been used to target DNA ... More
Quantification of adenosine-to-inosine editing of microRNAs using a conventional method.
Authors:Kawahara Y
Journal:Nat Protoc
PubMed ID:22743833
In this protocol, I describe a method for measuring the frequency of adenosine-to-inosine RNA editing of primary, precursor and mature forms of specific microRNAs (miRNAs) derived from the same source. The procedure involves reverse transcription (RT)-PCR amplification of regions containing the editing sites followed by subcloning of the PCR products ... More
Glycosylation of wall teichoic acid in Staphylococcus aureus by TarM.
Authors:Xia G, Maier L, Sanchez-Carballo P, Li M, Otto M, Holst O, Peschel A
Journal:J Biol Chem
PubMed ID:20185825
Wall teichoic acid (WTA) glycopolymers are major constituents of cell envelopes in Staphylococcus aureus and related gram-positive bacteria with important roles in cell wall maintenance, susceptibility to antimicrobial molecules, biofilm formation, and host interaction. Most S. aureus strains express polyribitol phosphate WTA substituted with D-alanine and N-acetylglucosamine (GlcNAc). WTA sugar ... More