El yoduro de propidio (PI) es una contratinción popular cromosómica o nuclear fluorescente rojo. Dado que el yoduro de propidio no penetra en las células vivas, también se suele utilizar para detectar células muertas en una población.

El PI se une al ADN mediante una intercalación entre las bases con poca o ninguna preferencia de secuencia. En solución acuosa, el colorante posee una excitación/emisión de máxima de 493/636 nm. Una vez que el colorante se ha unido, su fluorescencia mejora de 20 a 30 veces, el máximo de excitación de fluorescencia se desplaza ∼30–40 nm hacia el rojo y el máximo de emisión de fluorescencia se desplaza ∼15 nm al azul, dando como resultado una excitación máxima a 535 nm y una emisión de fluorescencia máxima a 617 nm.

El PI se utiliza ampliamente en microscopía de fluorescencia, microscopía de barrido láser confocal, citometría de flujo y fluorometría.

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