Tecnologías modernas para transferencias de datos LC-MS de alto rendimiento

Por Chris Knowles, director de mercadotecnia de productos: software de cromatografía y espectrometría de masas 10.01.2025

Los flujos de trabajo LC-MS de alta resolución generan archivos enormes que pueden saturar rápidamente los métodos de transferencia tradicionales. El principal reto no es solo el gran volumen de datos o la capacidad de almacenamiento y procesamiento necesaria, sino también la forma en que se recopilan, formatean, estructuran y anotan.

Para hacer frente a este reto, los protocolos avanzados y las plataformas de coordinación deben permitir transferencias seguras, globales y de varios gigabits sin intervención manual.

Este blog explora las tecnologías que facilitan transferencias de datos eficientes y confiables en entornos LC-MS, centrándose en los aceleradores WAN, los dispositivos de transferencia locales, la transmisión nativa en la nube y por qué la plataforma Thermo Scientific Ardia podría ser la opción perfecta para los retos a los que se enfrentan los laboratorios actuales.

Aceleradores WAN

Los aceleradores WAN mejoran el rendimiento de la transferencia de datos en redes de alta latencia y alta pérdida, sustituyendo u optimizando los protocolos de transporte tradicionales.

IBM Aspera FASP utiliza un protocolo basado en UDP para mantener un alto rendimiento, recuperarse automáticamente de la pérdida de paquetes y cifrar todos los datos en movimiento.

Aunque no es un acelerador WAN en el sentido estricto, Globus GridFTP amplía el FTP estándar con características como flujos de datos paralelos, transferencias de terceros y autenticación fuerte, lo que lo hace muy eficaz para mover grandes conjuntos de datos científicos a través de redes globales.

Echa un vistazo a esta publicación de Globus: GridFTP: Una breve historia de la transferencia rápida de archivos

Transferencia local

El objetivo de una solución de transferencia de datos local es detectar nuevos archivos e iniciar transferencias validadas al almacenamiento central sin supervisión manual.

La ventaja principal es que ayuda a integrar amplios conjuntos de datos históricos con las bases de datos actuales, lo que permite utilizar los datos heredados con herramientas modernas, incluida la inteligencia artificial. Esta integración es crucial para aprovechar los datos antiguos, ya que garantiza que se puedan analizar junto con los nuevos datos para descubrir información valiosa y mejorar la reproducibilidad.

Transmisión nativa en la nube

La transmisión nativa en la nube directamente al almacenamiento de objetos, como Amazon S3 (Simple Storage Service) o Microsoft Azure Blob Service, permite que los servicios informáticos comiencen a procesar inmediatamente después de la llegada de los archivos. Los desencadenantes de eventos sin servidor y las políticas de ciclo de vida automatizan aún más el almacenamiento por niveles y el archivo.

Este enfoque no solo acelera el procesamiento de datos, sino que también facilita la integración de diversos conjuntos de datos, lo que garantiza que tanto los datos nuevos como los antiguos se puedan gestionar y analizar de manera eficiente. Al aprovechar la transmisión nativa en la nube, los laboratorios pueden mejorar la accesibilidad y la escalabilidad de los datos, lo que permite aplicaciones avanzadas de análisis e inteligencia artificial/aprendizaje automático.

Sin embargo, es importante tener en cuenta los costos asociados y los riesgos de seguridad de los datos. El almacenamiento y el procesamiento en la nube pueden suponer gastos significativos, y es necesario implementar medidas de seguridad robustas para proteger los datos confidenciales de violaciones y accesos no autorizados.

¿Confiaría en los servicios en la nube para almacenar y gestionar de forma segura sus datos clínicos?

¿Está su laboratorio preparado para trasladar todos sus datos a la nube y pagar una suscripción para disfrutar de las ventajas?

Plataforma Thermo Scientific Ardia

La plataforma Thermo Scientific Ardia ofrece un sólido motor de gestión y organización de datos. Enruta los archivos RAW desde los instrumentos a los nodos de procesamiento y los archiva, registra todas las acciones para que estén listas para su auditoría y se adapta a entornos híbridos.

La plataforma Ardia cuenta con herramientas específicas para LC-MS como servidor físico con tecnologías basadas en la nube para escalar el procesamiento de extremo a extremo y conectar laboratorios de todo el mundo.

Los usuarios de proteómica están obteniendo un gran éxito con esta plataforma como solución integral que aprovecha las últimas tecnologías, incluida la inteligencia artificial para el análisis avanzado de datos y medidas de seguridad robustas para proteger los datos confidenciales.

Más información

Plataforma Thermo Scientific Ardia para proteómica.

No se pierda nuestro webcast bajo demanda: «La computación en la nube en el laboratorio analítico: riesgos estratégicos, retos y oportunidades a tener en cuenta». Regístrese ahora para acceder al webcast y descubrir cómo preparar su laboratorio para el futuro con la tecnología en la nube.

Eche un vistazo a este reciente informe técnico Centralización de los datos analíticos de la espectrometría de masas en el descubrimiento y desarrollo de fármacos | Scientific Computing World

Visítenos en LinkedIn: #ArdiaPlatform #DataManagement #Informatics