Ion 16S™ 宏基因组试剂盒
和Ion Reporter™ 宏基因组工作流程解决方案

采用Ion PGM™系统,无需进行培养处理,即可快速鉴别出病原菌研究样品

采用Ion PGM™系统快速鉴别病原菌研究样品

Ion半导体测序技术通过全基因组和靶向测序细菌16S rRNA基因(16S测序),加速并简化了宏基因组研究过程。由于在测序之前不再需要克隆或培养样品,这也消除了采样过程之中的一个最主要的偏差因素。在Ion PGM™系统上直接测序样品可以快速进行,且由于具有更多的扩增子,您也可以更好地在种属水平区分生物体。

Ion 16S™宏基因组试剂盒

Ion 16S™宏基因组试剂盒可用于在Ion PGM™系统上快速、全面、广泛地研究混合微生物种群。该试剂盒采用了两种引物库来扩增细菌16S rRNA七个高度变异区域(V2、V3、V4、V6、V7、V8和V9)。这两种引物库的组合使得您可以从复杂的混合种群之中通过测序方法鉴别广泛的细菌。

随后,扩增的片段会在Ion PGM™系统上进行测序,并在Ion Reporter™软件中采用宏基因组工作流程进行分析。

Ion 16S ™宏基因组试剂盒的优势包括:

  • 可使用直接的样品作为起始材料,无需培养、混合培养或纯化培养
  • 设计有多个高变区域的引物组合,使您可以在种属水平广泛地检测和鉴别细菌
  • 灵活 – 引物集以两个引物库的形式提供,您可以采用单独的库单独进行分析
  • 引物可采用条码编码处理

详细了解Ion 16S ™宏基因组试剂盒 ›

16s-workflow-CO28956

Ion PGM™系统具有集成、高成本效益、可扩展的 16s rRNA测序工作流程,可从文库快速获得分析结果。在构建文库和制备模板后,采用Ion 314™ Chip v2芯片仅需2.3个钟头即可完成400 bp的测序过程;采用Ion 318™ Chip v2芯片仅需4.4个钟头即可完成400 bp的测序过程.。采用Torrent Suite™软件生成的BAM文件,将会通过Ion Reporter™ 软件16S宏基因组工作流程自动分析、注释和分类。

 

Ion Reporter™ 软件宏基因组工作流程

Ion Reporter™软件同时使用了专业的Greengenes和高级 MicroSEQ® ID 16S rRNA 参考数据库,适于对复杂的多细菌成分样本进行微生物鉴定(属或种的水平)。Ion Reporter™ 宏基因组工作流程同时还能够提供引物信息、分类信息、百分比ID和定位信息。(IR)通过显示交互式的Krona表格结果,使用户可以方便地在分类学水平诠释其研究靶标的种群多样性。

 

详细了解Ion Reporter™软件 ›

Figure4B-16S-CO28956-550px

采用Ion Reporte™软件中进行自动分析、诠释和分类任务。[A] 使用默认的分析参数,显示 平衡后的模拟 细菌样本属水平上的同源性视图。未定位的读值显示为蓝色,在属水平上的 slash call 以红色圈出。[b] 使用更为严格的分析参数,显示平衡后的模拟细菌样本属水平上的同源性视图。在属水平上的slash call 以红色圈出。

 

其他资源

联系我们

电话和邮件

仅限研究用途,不可用于诊断操作。