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Thermo Scientific™
Ion 16S™ Metagenomics Kit
The Ion 16S™ Metagenomics Kit is designed for rapid, comprehensive and broad-range analyses of mixed microbial populations using the Ion Torrent™ semiconducter sequencing workflow.
| 製品番号（カタログ番号） | 数量 |
|---|---|
| A26216 | 100 reactions |
製品番号（カタログ番号） A26216
価格（JPY）
139,100
Each
数量:
100 reactions
The Ion 16S™ Metagenomics Kit is designed for rapid, comprehensive and broad-range analyses of mixed microbial populations using the Ion Torrent™ semiconducter sequencing workflow. The kit permits PCR amplification of hypervariable regions of the 16S rDNA gene from bacteria. The amplified fragments can then be sequenced using the Ion PGM™ Sequencing 400 Kit on the Ion PGM™ platform and analyzed using the Ion 16S™ metagenomics analyses module within the Ion Reporter™ software.
Ion 16S™ Metagenomics Kitは、Ion Torrent™半導体シーケンシングワークフローを用いて、混合微生物群を迅速に、包括的に、広範に解析するためにデザインされたキットです。本キットにより、微生物の16S rDNA遺伝子の超可変領域をPCR増幅することができます。増幅したフラグメントは、Ion PGM™プラットフォームでIon PGM™ Sequencing 400 Kitを用いてシーケンシングを行い、Ion Reporter™ソフトウェア内のIon 16S™メタゲノミクス解析モジュールによって解析することができます。
包括的プライマーセットにより多様な微生物を同定
本キットには、微生物の16S rDNA遺伝子の超可変領域の増幅に用いる2プールのプライマーセットが含まれています：
• マーセット V2-4-8
• プライマーセット V3-6,7-9
これら包括的なプライマーセットによって、多様な微生物を属あるいは種レベルまで正確に検出・同定することが可能です。プライマーセットは、PCR阻害物質に対する高い耐性を持ち、環境/食物/組織/その他の難易度の高いサンプルからのターゲット増幅において最適化されたEnvironmental Master Mix v2.0と組み合わされて使用されます。また、本キットにはトラブルシューティング用にポジティブコントロールも含まれています。
実験をフレキシブルに設定可能
プライマーセットは2つのプールとして提供されます。各プールは個々に、あるいは組み合わせて使用でき、実験の設定をフレキシブルに行うことが可能です。Ion Xpress™ Barcode Adaptersキットと一緒にご使用いただくと、多数の微生物で構成される複数のサンプルを1つのシーケンシングワークフローにまとめることができます。
解析まで含めた完全なワークフローを提供
Ion 16S™ Metagenomics Kitを用いて生成されたシーケンスは、Ion Reporter™ソフトウェア内のIon 16S™メタゲノミクス解析モジュールを使って直接解析することができ、複雑な微生物サンプルを迅速に半定量的に評価することが可能です。
注： 本キットは、Ion Library Quantitation Kit (製品番号 4468802)には対応していません。本キットを用いて生成したアンプリコンの正確な定量には、Ion Universal Library Quantitation Kit (製品番号 A26217)をご使用ください。
包括的プライマーセットにより多様な微生物を同定
本キットには、微生物の16S rDNA遺伝子の超可変領域の増幅に用いる2プールのプライマーセットが含まれています：
• マーセット V2-4-8
• プライマーセット V3-6,7-9
これら包括的なプライマーセットによって、多様な微生物を属あるいは種レベルまで正確に検出・同定することが可能です。プライマーセットは、PCR阻害物質に対する高い耐性を持ち、環境/食物/組織/その他の難易度の高いサンプルからのターゲット増幅において最適化されたEnvironmental Master Mix v2.0と組み合わされて使用されます。また、本キットにはトラブルシューティング用にポジティブコントロールも含まれています。
実験をフレキシブルに設定可能
プライマーセットは2つのプールとして提供されます。各プールは個々に、あるいは組み合わせて使用でき、実験の設定をフレキシブルに行うことが可能です。Ion Xpress™ Barcode Adaptersキットと一緒にご使用いただくと、多数の微生物で構成される複数のサンプルを1つのシーケンシングワークフローにまとめることができます。
解析まで含めた完全なワークフローを提供
Ion 16S™ Metagenomics Kitを用いて生成されたシーケンスは、Ion Reporter™ソフトウェア内のIon 16S™メタゲノミクス解析モジュールを使って直接解析することができ、複雑な微生物サンプルを迅速に半定量的に評価することが可能です。
注： 本キットは、Ion Library Quantitation Kit (製品番号 4468802)には対応していません。本キットを用いて生成したアンプリコンの正確な定量には、Ion Universal Library Quantitation Kit (製品番号 A26217)をご使用ください。
研究用途にのみご使用ください。診断目的には使用できません。
仕様
検出法Ion Torrent Sequencing, Primer-Probe Detection
使用対象（アプリケーション）配列
使用対象 (装置)Ion GeneStudio™ S5 Series Sequencer
反応数250 Reactions
ポリメラーゼTaq DNA Polymerase
製品ラインIon Torrent
製品タイプMetagenomics Kit
数量100 reactions
サンプルタイプDNA
種All Species
対象微生物クラスAll Bacteria
検査時間Fast
フォーマットKit
Unit SizeEach
組成および保存条件
• DNA dilution buffer (7 mL)
• 2 tubes 2X environmental master mix (0.8 mL per tube)
Store the above at 2-8°C.
• E. coli DNA control (40 μL)
• Negative control water (1 mL)
• 16S primer set V2-4-8 (300 μL)
• 16S primer set V3-6,7-9 (300 μL)
Store the above at -5 to -30°C.
• 2 tubes 2X environmental master mix (0.8 mL per tube)
Store the above at 2-8°C.
• E. coli DNA control (40 μL)
• Negative control water (1 mL)
• 16S primer set V2-4-8 (300 μL)
• 16S primer set V3-6,7-9 (300 μL)
Store the above at -5 to -30°C.