Materiais online e para download para quantificação fluorométrica Qubit

Os manuais, brochuras, notas de aplicação, demonstrações, vídeos e outros recursos desta seção te ajudarão a tirar o máximo proveito do seu fluorômetro Qubit.


Documentação e literatura

Faça o download da ficha de especificações do Software Qubit Flex SAE para CFR 21 Parte 11

Brochura de quantificação de RNA e DNA

Fichas de informações dos ensaios Qubit


Demonstrações e vídeos

Tour virtual interativo em 3D pelo Fluorômetro Qubit 4

Faça um tour virtual pelas características e recursos do fluorômetro Qubit com nossa demonstração interativa.

Tour virtual interativo em 3D pelo Fluorômetro Qubit Flex

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Demonstração interativa do Qubit Flex SmartStart

Cada fluorômetro Qubit Flex inclui acesso a um tutorial online individualizado e uma experiência de referência projetada para ajudar você a começar rapidamente."


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Atualizações de firmware

Faça o download do firmware mais recente para os fluorômetros Qubit 4 e Qubit Flex aqui.


Solução de software Qubit Flex SAE para suporte à conformidade com o CFR 21 parte 11

Arquivos de componentes de software e instruções gerais

Para implementar a solução de firmware Qubit Flex SAE para suporte à parte técnica relacionada à conformidade com o CFR 21 Parte 11 nos fluorômetros Qubit Flex, os componentes a seguir precisam ser instalados, ativados e comunicados entre si.

A solução de software Qubit Flex SAE para suporte à conformidade com o CFR 21 Parte 11 consiste em:

  1. Software SAE: utilizado para configurar as definições de Segurança, Auditoria e Assinatura Eletrônica (SAE) do fluorômetro Flex Qubit. O Software SAE consiste em
    • o SAE Administrator Console (instalado em um servidor com um endereço IP estático)
    • Perfil de aplicação Qubit Flex SAE
  2. Licença SAE: utilizada para ativar as configurações SAE do fluorômetro Qubit Flex.
  3. {Modo SAE: firmware do fluorômetro Qubit Flex (versão 1.7.0 ou posterior) que é conectado remotamente com o console do administrador SAE e ativado usando o arquivo de chave de licença SAE

Para obter mais detalhes sobre esses componentes, consulte a Solução de Software Qubit Flex SAE para suporte à CFR 21 Parte 11.

Software SAE

Para baixar o software do Console do Administrador de SAE e o perfil da aplicação Qubit Flex, clique nos botões de transferência relevantes abaixo. As notas de versão também estão disponíveis para o software SAE Administrator Console.

IMPORTANTE: O software Console do Administrador de SAE só precisa ser baixado pelas pessoas que gerenciam os procedimentos de segurança, auditoria e assinatura eletrônica na instituição. O download do Qubit Flex Application Profile também deve ser feito apenas pelas pessoas que utilizarão o software SAE Administrator Console.

Licença SAE

É necessário adquirir uma licença Qubit Flex SAE para obter um arquivo de chave de licença que habilitará o modo SAE no instrumento Qubit Flex. Visite a página do produto ou entre em contato com o representante de vendas da Thermo Fisher Scientific para obter mais informações.

As instruções para baixar os arquivos da chave de Licença podem ser encontradas no Guia do usuário Console do Administrador de SAE para o fluorômetro Qubit Flex.

Modo SAE

O software SAE Admin Console permite o suporte ao 21 CFR Parte 11 por meio da ativação da configuração do Modo SAE no instrumento Qubit Flex. 

Consulte o Guia do Usuário do Console do Administrador de SAE para o fluorômetro Qubit Flex para obter mais instruções sobre como ativar o modo SAE no instrumento Qubit Flex.


Serviços de apoio

Os fluorômetros Qubit Flex oferecem serviços de qualificação de instalação (QI) e qualificação operacional (QO) realizados pelos nossos engenheiros de serviço de campo (FSEs) treinados pelo fabricante. Este serviço garantirá que o Qubit Flex seja instalado corretamente e funcione dentro das especificações do fabricante. 

 

Além da QI/QO do equipamento, pode ser realizado atendimento adicional para a QI/QO do Software Flex Qubit durante a mesma visita. A QO do SAE garantirá que o software da SAE esteja devidamente instalado e que a conexão com o instrumento pode ser feita. Além disso, incluirá testes que verificam a funcionalidade adequada do software SAE. A QI/QO do SAE só poderá ser concluído em conjunto com um QI/QO do instrumento.

Perguntas frequentes

Aqui estão as perguntas e respostas mais frequentes sobre os fluorômetros Qubit e a quantificação fluorométrica Qubit. Convidamos você a entrar em contato com o Suporte Técnico  se tiver dúvidas adicionais ou precisar de mais informações.

Comparação com a absorbância UV

Os instrumentos NanoDrop usam absorbância UV para medir as concentrações de DNA e RNA. As medições baseadas em absorbância têm limitações na distinção entre DNA, RNA e nucleotídeos livres, que absorvem a 260 nm.

 

Os ensaios Qubit são baseados em fluorescência. Ela foi projetada para quantificar apenas o analito alvo. Além disso, a quantificação de ácido nucleico baseada em fluorescência oferece uma faixa dinâmica mais sensível do que os instrumentos baseados em absorbância.

 

Quando usados com ensaios Qubit, os fluorômetros Qubit podem medir com precisão baixas concentrações de amostra, enquanto os espectrofotômetros NanoDrop podem detectar a presença de contaminantes comuns.

As leituras de absorbância UV medem qualquer coisa que absorve a 260 nanômetros, incluindo DNA, RNA, proteína, nucleotídeos livres e sal em excesso. A Quantificação Fluorométrica Qubit mede apenas a molécula na qual você está interessado, deste modo o número é quase sempre menor do que a leitura A260 .

Questões técnicas gerais

O Fluorômetro Qubit 4 tem uma tela de toque colorida grande e robusta para navegação perfeita no fluxo de trabalho e pode salvar dados em uma unidade USB, por meio de um cabo USB conectado diretamente a um computador ou por conexão Wi-Fi à rede baseada em nuvem Thermo Fisher Connect para gerenciamento eficiente de dados. Além disso, o instrumento pode ser personalizado para mostrar apenas os ensaios usados com frequência, para adicionar novos ensaios (incluindo ensaios definidos pelo usuário criados com a ferramenta de design de ensaios MyQubit) e para exibir o idioma de sua escolha, incluindo inglês, francês, espanhol, italiano, alemão, chinês simplificado e japonês. Por fim, o Fluorômetro Qubit 4 tem um Ensaio de Sistema de Validação dedicado disponível para testar o desempenho do instrumento.

Não, só é possível calibrar nos espaços dos tubos em que as amostras serão processadas. Talvez seja necessário atualizar o firmware do seu fluorômetro Qubit Flex para a versão 1.5.0 ou mais recente para ativar esta opção.

Para cada um dos ensaios, você pode optar por executar uma nova calibração ou utilizar os valores da calibração anterior. o usar o instrumento pela primeira vez, você deve realizar uma nova calibração a cada vez. À medida que você se familiarizar com os ensaios, o instrumento, a precisão da pipetagem e as flutuações significativas de temperatura em seu laboratório, poderá determinar seu nível de conforto com o uso dos dados de calibração armazenados da última vez em que o instrumento foi calibrado. Recomendamos executar uma nova curva de calibração sempre que preparar uma nova solução de trabalho.

Os padrões diluídos podem ser usados por até 3 horas se for usada a mesma solução de trabalho para as amostras.

Para aderir aos padrões legais de segurança cibernética, o firmware mais recente dos fluorômetros Qubit 4 e Qubit Flex exige que os usuários façam login para acessar determinadas opções de menu, como Instrument Settings (Configurações do instrumento), Software Update (Atualização de software) e System Verification (Verificação do sistema). Quando o aparelho não estiver conectado a um perfil de utilizador, estas opções de menu estarão inativas.

Quantificação de proteínas e ácidos nucleicos

Vimos uma diferença de 20–30%. Para as diferentes formas de DNA de plasmídeo, recomendamos o uso de um padrão que represente melhor a composição do DNA de plasmídeo na amostra.

O ensaio de proteína Qubit é compatível com quantidades muito pequenas de detergente. Consulte a Tabela 2, "Contaminantes tolerados pelo ensaio de proteínas Qubit", na página 6 do Manual do produto Kit de ensaio de proteínas Qubit para ver quantidades específicas. O ensaio pra proteína Qubit BR é compatível com amostras que contêm até 5% de detergentes.

Perguntas sobre o dispositivo

Os kits de ensaios de verificação do sistema Qubit 4 e Qubit Flex oferecem um método rápido, fácil de usar e baseado em reagentes para teste dos componentes internos de um fluorômetro Qubit.  Execute a verificação do sistema quando houver suspeita de um problema com o instrumento.  Não é necessário efetuar a verificação regularmente.

Existem duas fontes de luz LED nos fluorômetros Qubit 4 e Qubit Flex. A vida útil esperada é de 5 anos.

Use tubos de PCR de parede fina e transparentes de  0,5 mL para o instrumento Qubit 4. Para o Fluorômetro Qubit Flex, use as tiras de tubo Qubit Flex Assay,  que vêm como tubos de polipropileno de parede fina de 8 x 200 µL com fluorescência muito baixa.


Como criar ensaios MyQubit personalizados (Qubit 3.0 e 4)

Os recursos MyQubit permitem a criação de novos ensaios para os fluorômetros Qubit 3.0 e 4 em minutos, usando parâmetros que podem ser facilmente carregados no instrumento usando um dispositivo de armazenamento USB, sem alterar os ensaios existentes. Os seus novos ensaios podem ser versões otimizadas de ensaios baseados em fluorescência existentes ou podem ser completamente novos.

 

Para criar ensaios MyQubit personalizados para o fluorômetro Qubit 2.0, consulte Recursos para modelos Qubit anteriores.

Etapa 1: Colete dados e defina constantes para os ensaios MyQubit

Coleta dos dados. Prepare as amostras usando seus reagentes de ensaio e leia-as no modo Fluorômetro no instrumento Qubit. O modo Fluorômetro permite que você selecione manualmente a fonte de luz de excitação à sua escolha, LED azul ou LED vermelho, enquanto lê valores brutos de fluorescência nos canais de emissão verde e vermelho distante. Os valores podem ser usados para gerar dados para desenvolvimento do seu novo ensaio.

Definição das constantes. Nós recomendamos que todos os novos usuários no desenvolvimento de ensaios MyQubit usem a planilha do Excel Guia MyQubit EZ em seu computador para processar os dados do modo fluorômetro e gerar os parâmetros para seus ensaios. O Guia permite inserir leituras no modo Fluorômetro coletadas de amostras de concentrações conhecidas e, em seguida, calcula constantes que podem ser usadas para definir a forma da curva padrão que será usada para calibrar o novo ensaio.

 

Basta inserir os valores de fluorescência obtidos no modo Fluorômetro no fluorômetro Qubit, juntamente com as concentrações correspondentes do analito. Depois inserir os dados replicados na planilha, ajuste os parâmetros N e K para otimizar o algoritmo de ajuste da curva. O seu objetivo é ajustar N e K para alcançar o score de qualidade mais baixo possível, conforme mostrado no exemplo.

Etapa 2: Defina o seu ensaio com a ferramenta de desenho de ensaios MyQubit

Você pode usar a ferramenta de design de ensaios MyQubit para criar o arquivo MyQubit .qbt que definirá o seu novo ensaio. Em seguida, você pode carregar o arquivo .qbt para executar no seu Fluorômetro Qubit 3.0 ou 4.

 

Na ferramenta de design de ensaio MyQubit, você insere os valores dos parâmetros para o seu ensaio personalizado, conforme calculado na planilha MyQubit EZ Guide. Os campos podem aparecer ou desaparecer à medida que você seleciona valores. Passe o cursor sobre os ícones de ajuda para obter orientação sobre o preenchimento dos campos da ferramenta.

Etapa 3: Envie o seu ensaio para o seu fluorômetro Qubit 3.0 ou 4

Para carregar o seu novo arquivo de ensaio .qbt, você pode importá-lo para o seu instrumento a partir de um dispositivo de armazenamento USB ou diretamente de um computador externo por meio de um cabo USB. Seu Fluorômetro Qubit o guiará pelo processo de upload de novos ensaios. Novos ensaios podem ser carregados permanentemente sem afetar os ensaios existentes.

Importação de ensaios de um dispositivo de armazenamento USB

1.     Transfira os arquivos de ensaio MyQubit (.qbt) que pretende instalar para o diretório raiz (nível superior) de um dispositivo de armazenamento USB.

Não transfira os arquivos .qbt para uma pasta na unidade USB.

2.     Insira a unidade USB que contém o(s) novo(s) arquivo(s) de ensaio na porta USB do Qubit Fluorometer.

3.     Vá para a tela de Configurações e toque em Importar novo ensaio. O instrumento procura no dispositivo de armazenamento USB os arquivos de ensaio e apresenta os seus nomes na tela Importar novo ensaio .

4.     Toque para selecionar o(s) ensaio(s) que deseja importar. (Toque novamente em um ensaio para desmarcá-lo.) Você pode selecionar um ou mais ensaios para importar.

5.     Toque em Próximo. A tela Importar novo ensaio apresenta o nome do primeiro ensaio que está sendo importado e lista as pastas de destino onde podem ser salvos. Cada pasta pode conter até 9 ensaios.

6.     Selecione a pasta de destino para o novo ensaio e toque em Salvar). Você verá a sua escolha na tela Verificação (passo 8).

Como alternativa, toque em Nova pasta para criar uma nova pasta de destino (etapa 7).

7.     Na tela Nova pasta, toque no campo de texto Nova pasta. No teclado que aparece, digite um nome de pasta com até 11 caracteres. O nome pode incluir espaços exceto no início ou no fim

Toque em Entere, em seguida, toque em Concluído para voltar à tela Importar novo ensaio. A nova pasta aparecerá na lista de pastas.

Selecione a nova pasta de destino e toque em Salvar. Você verá a sua escolha na tela Verificação .

8.     Na tela Verificação, toque em Concluído para concluir a importação. Se estiver importando apenas um ensaio, você voltará à tela inicial.

Se estiver importando vários ensaios, você voltará à tela Importar novo ensaio, onde poderá selecionar a pasta de destino do próximo ensaio a ser importado.

Importação de ensaios de um computador

Você pode transferir arquivos de ensaios MyQubit (.qbt) diretamente do seu computador para o seu fluorômetro Qubit 3.0 ou 4 usando um cabo USB.

Nota: O cabo USB deve permanecer ligado ao fluorômetro Qubit e ao computador durante este procedimento.

  1. Se necessário, transfira o arquivo de ensaio MyQubit (.qbt) para o seu computador.
  2. Ligue o fluorômetro Qubit ao computador utilizando um cabo USB. O computador deve reconhecer o fluorômetro como um dispositivo externo.
  3. Copie e cole (ou clique e arraste) os arquivos .qbt que pretende importar para a janela do instrumento Qubit no computador.
    •  Nota: Os ensaios não ficarão visíveis no fluorômetro Qubit até que você execute o próximo passo.
  4. Vá para a tela de Configurações no fluorômetro Qubit e toque em Importar novo ensaio. Na tela Importar novo ensaio, você verá os nomes dos ensaios encontrados no computador.
  5. Siga as etapas 4­–8 do procedimento de importação descrito em Importação de ensaios de um dispositivo de armazenamento USB  acima.

Etapa 4: Execute o seu ensaio

Uma vez carregado, o novo ensaio MyQubit está pronto para uso. Consulte Manual do produto Qubit 4 para obter uma descrição detalhada do funcionamento do instrumento e do fluxo de trabalho do ensaio.


Conexão com um computador Windows (Qubit 3.0 ou 4)

A conexão de um fluorômetro Qubit 3.0 ou 4 a um computador com o sistema operacional Windows necessita da instalação de um driver. Faça o download do driver e das instruções de instalação abaixo.


Citações

2022

  • Khan SA, Gudeta DD, Chon J, et al. Whole-genome sequences of nine hospital-associated methicillin-susceptible Staphylococcus aureus strains." Microbiol Resour Announc. 2022; 11: e0118521. PubMed
  • Lopez D, Roberts J, Bourgeois M, et al. Infection clusters can elevate risk of diagnostic target failure for detection of SARS-CoV-2. PLoS one 2022; 17: e0264008. PubMed

2021

  • Kaspar JR. Complete genome sequence of Streptococcus oralis 34." Microbiol Resour Announc. 2021; 10: e00760–21. PubMed
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  • Redila CD, Prakash V, Nouri S. Metagenomics analysis of the wheat virome identifies novel plant and fungal-associated viral sequences. Viruses. 2021; 13, 2457. PubMed

2020

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  • Mondelo-Macía P, Rodríguez-López C, Valiña L, et al. Detection of MET alterations using cell free DNA and circulating tumor cells from cancer patients. Cells. 2020; 9: 522. PubMed
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2019

  • Hosein AN, Huang H, Wang Z, et al. Cellular heterogeneity during mouse pancreatic ductal adenocarcinoma progression at single-cell resolution." JCI Insight. 2019; 5: e129212. PubMed
  • Krasnenko AY, Stetsenko IF, Klimchuk OI, et al. Ultra-low coverage sequencing as the most accurate library quantification. SpringerLink

2018

  • Zingg D, Debbache J, Peña-Hernández R, et al. EZH2-mediated primary cilium deconstruction drives metastatic melanoma formation." Cancer cell. 2018; 9: 69–84. PubMed
  • Ponti G, Maccaferri M, Manfredini M, et al. The value of fluorimetry (Qubit) and spectrophotometry (NanoDrop) in the quantification of cell-free DNA (cfDNA) in malignant melanoma and prostate cancer patients. Clin Chim Acta. 2018; 479: 14–19. PubMed

Referências adicionais

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  • Kumar D, Panigrahi MK, Suryavanshi M, Mehta A, Saikia KK. Quantification of DNA extracted from formalin fixed paraffin-embeded tissue comparison of three techniques: Effect on PCR efficiency." J Clin Diag Res. 2016; 10: BC01­–BC03. PubMed
  • Mardis E, McCombie WR. Library quantification: fluorometric quantitation of double-stranded or single-stranded DNA samples using the qubit system. Cold Spring Harb Protoc. 2017; 2017: pdb-prot094730. PubMed

Recursos educacionais

Os recursos educacionais de quantificação fluorométrica Qubit inclui materiais online sobre quantificação e análise de ácidos nucleicos e proteínas.

Informações e suporte sobre quantificação de ácidos nucleicos

Confira esses recursos gratuitos para obter informações básicas e materiais de apoio sobre a quantificação fluorométrica de DNA e RNA da Qubit Fluorometric.

Centro de aprendizagem da biologia da proteína

A nossa introdução gratuita aos métodos e tecnologias de análise de proteínas inclui artigos, vídeos, aprendizagem guiada e mais recursos sobre proteínas e formas de estudá-las. A visão geral dos métodos de ensaios de proteínas pode ser um bom lugar para começar.


Recursos para modelos Qubit anteriores

Encontre manuais, brochuras, notas de aplicação, demonstrações, vídeos e outros recursos para ajudá-lo a tirar o máximo proveito do seu fluorômetro Qubit mais antigo.


For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.