Kit de preparación de bibliotecas de ARN multifilar Collibri™ para sistemas Illumina™

El kit de preparación de biblioteca de ARN de cadena Invitrogen Collibri para los sistemas Illumina está diseñado para la construcción sólida de bibliotecas de ADNc para la secuenciación de ARN específica de cadenas en sistemas de secuenciación de última generación Illumina (NGS). El kit reúne las características superiores de la transcriptasa inversa SuperScript IV, las partículas magnéticas Dynabeads y la polimerasa ADN Platinum SuperFi, lo que permite a los usuarios obtener bibliotecas preparadas para una secuenciación de alta calidad.

El kit de preparación de la biblioteca de ARN de cadena Collibri ofrece:
• Flujo de trabajo corto y fácilmente automatizable: el ARN total se puede convertir en una biblioteca preparada para la secuenciación en 6,5 horas
• Colorantes inertes en los reactivos: vea el progreso de la generación de la biblioteca sin efectos negativo en la calidad
• Mayor eliminación del ARNr
• Cobertura uniforme y alta sensibilidad de detección de la transcripción
• Alta sensibilidad de detección de la expresión génica diferencial
• > 98 % de especificidad de cadena
• Detección eficaz de ARN no codificante
• Conservación de la información de la secuencia en el extremo 3‘

Este kit de preparación de la biblioteca de ARN de cadena Collibri está diseñado para una preparación rápida y cómoda de la biblioteca a partir de muestras iniciales de 100 ng a 1 µg de ARN total de humano, ratón o rata. Las reacciones de ligadura de adaptador de un solo tubo y transcripción inversa, así como la reducción del ARNr basada en gránulos magnéticos y los pasos de purificación de la biblioteca, permiten completar todo el flujo de trabajo en aproximadamente 6,5 horas. El kit es adecuado para varias muestras de ARN de calidad, incluidas las muestras de FFPE.

Señales visuales de la integridad del proceso
Para una máxima comodidad, se incluyen señales visuales de la integridad del proceso en todo el flujo de trabajo de preparación de la biblioteca. Supervise el progreso de la generación de bibliotecas mediante la retroalimentación visual de colorantes en reactivos críticos. La mezcla de reacción cambia de color en respuesta a la adición de componentes críticos en cada paso para asegurar que la preparación de la biblioteca tiene la mayor probabilidad de éxito. Los colorantes inertes no interfieren con las reacciones enzimáticas y no comprometen los resultados de la secuenciación.

Funcionamiento
El kit de preparación de la biblioteca de ARN de cadena Collibri con el kit de agotamiento de ARNr de humano, ratón o rata incluye reactivos de agotamiento de ARN ribosomal (ARNr) para permitir una visión completa del transcriptoma a través de una mayor eliminación de ARNr de humano, ratón o rata. Los adaptadores compatibles con Illumina de longitud completa se introducen mediante una amplificación de PCR utilizando ADN polimerasa Platinum SuperFi para construir bibliotecas de índice simple o de índice dual único, compatibles con secuencias de lectura única o de dos extremos. El kit contiene 24 o 96 primers de PCR con código de barras (i7) de índice simple premezclados con un primer i5 universal o primers de PCR con índice dual único que permiten la multiplexación de hasta 96 bibliotecas. Los pasos de limpieza optimizados eliminan eficazmente los primers residuales y los dímeros del adaptador/primer, al mismo tiempo que se conserva la producción alta de la biblioteca.

El kit de cuantificación de bibliotecas Collibri, que es un producto relacionado, se recomienda para las cuantificaciones de bibliotecas basadas en qPCR antes de proceder con la secuenciación.

Aplicaciones
El kit de preparación de la biblioteca de ARN de cadena Collibri se recomienda para:
• Estudios de expresión génica
• Análisis de empalme alternativo
• Detección y descubrimiento de ARN no codificante
• Identificación de sitios alternativos de poliadenilación
• Detección de fusión génica
• Detección de isoformas de transcripción