Los kits de preparación de bibliotecas de ADN de cadena Invitrogen Collibri están diseñados para la secuenciación de última generación (NGS) en sistemas Illumina.  El kit admite la secuenciación de transcriptomas completos (humanos, ratones, ratas) y las aplicaciones de secuenciación de ARNm (compatible con todas las especies).

El kit de preparación de bibliotecas de ADN de cadena Collibri:
• Incluye todos los componentes necesarios en un solo kit* para un uso rápido
• El ARN total se puede convertir en una biblioteca preparada para la secuenciación en 4,5 horas
• > 98 % de especificidad de cadena, detección eficaz de ARN no codificado y alta sensibilidad de la detección diferencial de la expresión génica
• Proporciona información visual en proceso para facilitar la manipulación
• Es adecuado para la automatización convencional a fin de aumentar el rendimiento

El kit de preparación de biblioteca de ARNm de cadena Invitrogen Collibri para los sistemas Illumina está diseñado para la construcción sólida de bibliotecas de ADNc para la secuenciación de ARN específica de cadenas en sistemas de secuenciación de última generación Illumina (NGS). El kit reúne las características superiores de la transcriptasa inversa SuperScript IV, las partículas magnéticas Dynabeads y la ADN polimerasa Platinum SuperFi, lo que permite a los usuarios obtener bibliotecas de alta calidad preparadas para secuenciación. Este kit de preparación de bibliotecas de ARN multifilar de Collibri admite la preparación rápida de bibliotecas en un plazo de 4,5 horas para bibliotecas de ARNm o transcriptomas completos con entre 1 y 25 ng de entrada de muestra de ARN enriquecida con ARNm o con ribo empobrecido. La multiplexación de bibliotecas se puede realizar utilizando hasta 96 primers de índice simple o de índice dual único, lo que permite la secuenciación de lectura única o de dos extremos. El kit es adecuado para varias muestras de ARN de calidad, incluidas las muestras de FFPE.

Señales visuales de la integridad del proceso
Para una máxima comodidad, se incluyen señales visuales de la integridad del proceso en todo el flujo de trabajo de preparación de la biblioteca. Supervise el progreso de la generación de bibliotecas mediante la retroalimentación visual de colorantes en reactivos críticos. La mezcla de reacción cambia de color en respuesta a la adición de componentes críticos en cada paso para asegurar que la preparación de la biblioteca tiene la mayor probabilidad de éxito. Los colorantes inertes no interfieren con las reacciones enzimáticas y no comprometen los resultados de la secuenciación.

Funcionamiento
Los adaptadores compatibles con Illumina de longitud completa se introducen mediante una amplificación de PCR utilizando ADN polimerasa Platinum SuperFi para construir bibliotecas de índice simple o de índice dual único, compatibles con secuencias de lectura única o de dos extremos. El kit contiene 24 o 96 primers de PCR con código de barras (i7) de índice simple premezclados con un primer i5 universal o primers de PCR con índice dual único que permiten la multiplexación de hasta 96 bibliotecas. Los pasos de limpieza optimizados eliminan eficazmente los primers residuales y los dímeros del adaptador/primer, al mismo tiempo que se conserva la producción alta de la biblioteca.

El kit de cuantificación de bibliotecas Collibri, que es un producto relacionado, se recomienda para la cuantificación de bibliotecas basadas en qPCR antes de proceder con la secuenciación.

Aplicaciones
El kit de preparación de la biblioteca de ARN de cadena Collibri se recomienda para:
• Estudios de expresión génica
• Análisis de empalme alternativo
• Detección y descubrimiento de ARN no codificante
• Identificación de sitios alternativos de poliadenilación
• Detección de fusión génica
• Detección de isoformas de transcripción

*El kit consta de modificación enzimática, selección de tamaño/limpieza y módulos con adaptador indexado. También se puede incluir un módulo adicional de ARNr humano, de ratón o de rata.