CFSE se utiliza frecuentemente para estudios de seguimiento celular y de proliferación. También se ha utilizado en ensayos de linfocitos T citotóxicos y en estudios de motilidad celular. CFSE es capaz de atravesar membranas celulares intactas. Una vez que se encuentra en el interior de las células, las esterasas intracelulares disocian los grupos de acetato para permitir el acceso de la molécula fluorescente de carboxifluoresceína. El grupo de éster de succinimidilo reacciona con las aminas primarias y entrecruza el tinte con las proteínas intracelulares. Se puede medir la división celular conforme la intensidad de la fluorescencia de CFSE se va reduciendo a la mitad. Las células marcadas con CFSE pueden fijarse y permeabilizarse para el análisis de objetivos intracelulares mediante fijadores estándar que contienen formaldehído y tampones de permeabilización basados en saponina, como el conjunto de tampones de tinción de factor de transcripción Foxp3 (n.º de cat. 00-5523), el tampón de fijación de IC (n.º de cat. 00-8222) y tampón de permeabilización (10x) (n.º de cat. 00-8333).

El peso molecular de CFSE es de 557,47. Tras la disociación de los grupos de acetato, tiene un pico de excitación de 494 nm y un pico de emisión de 521 nm. Cada vial de CFSE se debe reconstituir a una concentración de solución madre de 10 mM con 90 µl de DMSO anhidro; una vez reconstituido debe utilizarse en un plazo de 6 meses, proteger de la luz y almacenar a - 20 °C con desecante; se deben evitar los ciclos de congelación y descongelación.

Aplicación declarada
Análisis mediante citometría de flujo, microscopía