Kit de purification BigDye Xterminator™
Applied Biosystems™

Kit de purification BigDye Xterminator™

Le kit de purification BigDye XTerminator™ est une méthode de purification simple et rapide pour les réactions de séquençage d’ADNAfficher plus
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RéférenceQuantité
43764862 flacons
43764871000 préparations
43764842 flacons
43764852 flacons
Référence 4376486
Prix (EUR)
351,00
Each
Quantité:
2 flacons
Prix (EUR)
351,00
Each
Le kit de purification BigDye XTerminator™ est une méthode de purification simple et rapide pour les réactions de séquençage d’ADN qui élimine les sels et les terminateurs BigDye™ non incorporés.Fini les taches de colorants !Le nettoyage est complet en moins de 40 minutes et demande moins de 10 minutes de travail.

•Éliminez le transfert de liquide – utilisez une seule plaque
•Obtenez l’élimination totale des taches de colorants.
•Stabilisez les échantillons avant analyse.
•Améliorez vos flux de travaux liés au séquençage.
• Exécutez des protocoles manuels ou automatisés.
• Parvenez rapidement à des résultats fiables et reproductibles.

Procédé de purification simple
Les méthodes traditionnelles de purification, telles que la précipitation à l’aide d’éthanol, nécessitent l’ajout de nombreux réactifs avec des étapes de décantation et de centrifugation.Le kit de purification BigDye XTerminator™ ne nécessite l’ajout que de deux réactifs qui peuvent être soit incorporés de façon séquentielle soit pré-mélangés :

• Solution XTerminator™ : récupère les terminateurs de colorants non incorporés et les sels libres de la réaction post-séquençage.
• Solution SAM™ : optimise la performance de la solution Xterminator™ et stabilise les réactions de post-purification.

Le protocole est très simple (voir figure 1) :
1.Exécutez le séquençage des cycles avec les terminateurs BigDye™.
2.Après les cycles de séquençage, centrifugez brièvement la plaque de réaction, puis pipetez le bon volume de solution SAM™ dans chaque puits de la plaque.
3.Pipetez le bon volume de solution XTerminator™ dans chaque puits :
4.Vortexez brièvement le conteneur vrac de la solution XTerminator™.
5.À l’aide d’une pipette large (embouts larges recommandés), pipetez le bon volume de liquide dans chaque puits de la plaque
6.Scellez la plaque à l’aide d’un thermo-scellage ou d’un film adhésif transparent (P⁄N 4306311).Agitez au mélangeur vortex pendant 30 minutes (nous recommandons les agitateurs-mélangeurs vortex pour microplaques de 96 puits et les agitateurs-mélangeurs vortex pour microplaques de 384 puits), puis centrifugez brièvement la plaque de réaction.
7.Placez la plaque de réaction dans l’analyseur d’ADN Applied Biosystems.Sélectionnez le module et la plaque d’exécution.

Excellente récupération des fragments longs
Vous n’aurez pas à sacrifier la longueur de la séquence quand vous utiliserez le kit de purification BigDye XTerminator™.La figure 2 montre les données fournies par l’Unité de technologie d’analyse de l’ADN, Plant Biotechnology Institute (NRC-PBI) Saskatoon, Canada.Résultat de la base Q20 =1044 bp.

Récupération des fragments courts améliorée
Utilisez le kit de purification BigDye Xterminator™ pour obtenir des données de meilleure qualité.La figure 3 montre une comparaison entre le kit de purification BigDye XTerminator™ et la purification à base d’éthanol précipité réalisée à l’Unité de technologie d’analyse de l’ADN, Plant Biotechnology Institute (NRC-PBI) Saskatoon, Canada.Le kit de purification BigDye XTerminator™ démontre une récupération supérieure des fragments courts.La purification à l’éthanol produit des données de séquençage tachées par les colorants.

Stabilité accrue
Les plaques de réaction scellées sont stables pendant 48 heures à température ambiante ou 10 jours à 4°C. Vous pouvez réutiliser les mêmes échantillons en cas de coupure de courant, de dysfonctionnement informatique, etc. sans avoir à répéter l’expérience.Cela augmente votre liberté d’action lorsque vous chargez une plaque de réaction sur un instrument CE.

Modules d’exécution disponibles
Applied Biosystems fournit des modules téléchargeables à utiliser avec le kit de purification BigDye XTerminator™ et le logiciel de collecte de données.Ces modules sont conçus pour les analyseurs 3100, 3100–Avant (avec collecte de données v2.0 ou ultérieure), 3130⁄3130xl et 3730⁄3730xl.Les modules logiciels pour le kit de purification BigDye XTerminator™ sont compatibles avec les systèmes d’exploitation Windows™ 2000 et Windows™ XP et sont disponibles sur notre page de téléchargement de logiciels :

Applied Biosystems Integrated Systems pour l’analyse génétique ›

Usage exclusivement réservé à la recherche.Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.

Spécifications
Type de produit finalADN
À utiliser avec (application)Séquençage
Comprend2 flacons
Nbre de réactions100
Gamme de produitsBigDye XTerminator, BigDye
Type de produitKit de purification
Quantité2 flacons
Type d’échantillonRéactions de séquençage
Conditions d’expéditionGlace
Quantité de matériel de démarrage10 μl
CibleRéactions de séquençage
Heure du test40 min
FormatKit
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Solution XTerminator™ de 2 mL (conserver à 4°C), Solution SAM™ de 9 mL (conserver à température ambiante ou à 4°C)

Foire aux questions (FAQ)

Can I store samples in BigDye Xterminator solution? If so, what is the optimal temperature, and for how long can I store it?

Yes, after cleaning the sequencing product using the BigDye XTerminator Purification Kit, the end product can be stored up to 10 days at either 4°C or –20°C.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What is a dye blob?

After the cycle sequencing reaction is complete, unincorporated ddNTPs can form complexes that migrate more slowly than individual ddNTPs would. These complexes can interfere with electrokinetic injection, electrophoretic separation, and data analysis. In the electropherogram these can be observed as a region containing multicolored peaks of varying sizes or blobs, depending on the efficiency of the cleanup. In BigDyeTerminator v3.1 reactions, these blobs may appear around 70–80 bp and, in severe cases, 110–120 bp. For BigDye Terminator v1.1, the blobs will either migrate ahead of the data collection time (so they will not be visible) or they may be visible at the very beginning of the run.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What are the different ways to clean up my sequencing reactions?

While there are many kits and methods available to clean up the extension products from a sequencing reaction, the ones that Thermo Fisher Scientific has formally tested and recommends are:

•BigDye XTerminator Purification Kit
•Ethanol precipitation
•Spin column/plate purification (e.g. Centri-Sep columns, DTR Kits from Edge Biosystems)

A list of alternative methods for purification is available in the DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis: Applied Biosystems Chemistry Guide: Second Edition (Cat. No. 4305080, Rev. C, page 119). The guide can be found by searching the Thermo Fisher Scientific website with the Cat. No. 4305080.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

Does the BigDye XTerminator (including SAM Solution) contain any aerosols?

The BigDye Xterminator Solution and SAM Solution do not contain aerosols.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Nucleic Acid Purification and Analysis Support Center.

What kit do you recommend for cleanup of the cycle sequencing reaction?

For the purification of the sequencing reaction, we recommend the BigDye Xterminator Purification Kit. For reference, the following is the link to the BigDye Xterminator Purification Kit User Guide.

Additionally, our Sanger Sequencing Guide has additional recommendations starting on page 68 for purifying the sequencing reaction.