TaqMan&trade; Gene Expression Cells-to-C<sub>T</sub>&trade; Kit
Invitrogen™

TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ Kit

Effectuer une analyse d’expression directement à partir de cellules en culture sans purification de l’ARN.
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Prix (EUR)
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The TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ Kit makes it possible to perform expression analysis directly from cultured cells without RNA purification. This kit saves time and offers a simple workflow that is suitable for a few samples or can be easily incorporated into automated, high-throughput applications.

Le kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ permet l’analyse de l’expression directement à partir de cellules mises en culture sans purification de l’ARN. Ce kit permet de gagner du temps et offre un flux de travail simple qui est adapté à quelques échantillons ou qui peut facilement être incorporé dans des applications automatisées à haut débit.

Le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT est :

• Complet : flux de travail optimisé composé de réactifs de lyse cellulaire avec élimination de l’ADNg, du mélange enzymatique RT, d’un tampon et du nouveau mélange d’expression génétique TaqMan™ Gene Expression Master Mix
• Rapide : préparation des échantillons en 7 minutes à température ambiante, y compris le traitement par DNase
• Facile : lysez des échantillons dans un tube ou directement sur des plaques de culture
• Robuste : réalisez l’analyse de l’expression génétique de 10 à 100 000 cellules par échantillon ; résultats équivalents à ceux obtenus à partir de l’ARN purifié
• Efficace : contient suffisamment de réactifs pour générer 500 résultats de PCR en temps réel à partir de 100 échantillons de départ

. Doté d’une méthode unique pour lyser les cellules cultivées tout en retirant l’ADN génomique et en préservant l’intégrité de l’ARN, le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ contient des réactifs de transcription inverse (RT) pour la synthèse d’ADNc et le mélange TaqMan™ Gene Expression Master Mix pour l’analyse PCR en temps réel. Les ensembles d’amorces ⁄ sondes TaqMan™ sont vendus séparément.

Préparation d’échantillons simple de 7 minutes : partie d’un flux de travail complet
Que vous utilisiez des plaques ou des tubes, le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™, qui utilise la procédure simple de préparation des échantillons en 7 minutes décrite (voir illustration), est conçu pour 10 à 100 000 cellules cultivées ⁄ échantillon. Les cellules sont nettoyées dans du PBS et lysées en solution pendant 5 minutes à température ambiante ; le traitement par DNase peut être réalisé simultanément. La lyse est terminée à température ambiante par une incubation de 2 minutes avec une solution d’arrêt. Les lysats sont désormais prêts pour la transcription inverse ou une conservation à –20°C. Étant donné que les échantillons peuvent être traités directement dans des puits de culture (96 ou 384 puits), la manipulation des échantillons et le risque de perte des échantillons ou d’erreur de transfert sont minimisés, ce qui contribue à un traitement à haut débit rapide. Contrairement aux anciens protocoles d’isolement de l’ARN en plusieurs étapes, aucune étape de chauffage, nettoyage ou centrifugation n’est nécessaire. Le kit simplifie considérablement un processus laborieux de 30 à 60 minutes et le réduit à 7 minutes.

Le flux de travail du kit d’expression génétique Cells-to-CT™ TaqMan™ permet une évaluation d’expression génétique inégalée avec l’un des > 700 000 dosages d’expression génétique TaqMan™. Ce kit a été largement testé pour sa spécificité avec une vaste sélection de dosages d’expression génétique TaqMan™ et démontre des performances équivalentes à celles obtenues avec de l’ARN purifié (voir figure).

Obtenez des performances et une sensibilité inégalées
Contrairement à certains kits concurrents qui limitent la quantité de lysat dans la réaction RT à 5 %,le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ peut accueillir 45 % du volume total de la réaction RT sous forme de lysat cellulaire. En outre, l’ADNc peut composer jusqu’à 45 % du volume de réaction de PCR en temps réel. Le grand volume de lysat dans la réaction RT optimisée, associé à un grand volume d’ADNc lors de la PCR en temps réel subséquente qui utilise le mélange maître d’expression génétique TaqMan™, mène à une sensibilité maximale. Le Master Mix amplifie la cible de manière précise et exacte, permettant la détection de petites quantités de cible, comme des transcriptions exprimées à de faibles niveaux.

La capacité à détecter des quantités cibles limitées a été testée en mélangeant un nombre constant de cellules humaines avec différents nombres de cellules de souris. Les mélanges cellulaires ont été préparés à l’aide du kit TaqMan™ Gene Expression Cells-to-CT™ et dosés pour un gène spécifique à la souris et spécifique à l’humain. Des données comparatives ont été générées de la même manière avec de l’ARN purifié à l’aide d’une méthodologie classique. Les données indiquent que l’ARN provenant d’à peine 10 cellules de souris était détectable dans un fond d’ARN de 10 000 cellules humaines (voir la figure). La capacité du kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ à détecter les produits de la transcription en assez faible abondance était équivalente à celle de l’ARN purifié ; à des concentrations basses, sa capacité de détection était meilleure.

En outre, les performances du kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ ont été comparées aux kits de lysats concurrents et à l’ARN purifié. Des entrées de 100 à 100 000 cellules⁄réaction de lyse ont été examinées. La sensibilité du protocole du kit TaqMan™ Cells-to-CT™ était équivalente à celle obtenue avec l’ARN purifié et était supérieure à celle des lysats concurrents (voir la figure). En outre, le manque d’inhibition à des entrées cellulaires élevées et la faible variation entre les réplicats techniques démontrent la fiabilité de cette démarche pour les études d’expression génétique à l’aide de cellules mises en culture.

Performances éprouvées, ensemble
Tous les composants du kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ ont été optimisés pour assurer des performances constantes et fiables. Cela permet d’éliminer toute conjecture liée à l’assemblage des différentes préparations d’échantillons, de la RT et des kits de PCR en temps réel. Et le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™ a été validé avec les dosages d’expression génétique TaqMan™ afin d’optimiser le processus d’assurance qualité.

Produits associés
Le kit de contrôle TaqMan™ Cells-to-CT™ a été conçu pour être utilisé avec le kit d’expression génétique TaqMan™ Cells-to-CT™. Ce kit contient un contrôle endogène (ACTB) pour normaliser la variabilité du chargement des échantillons et un contrôle XenoRNA™ artificiel, ainsi qu’un dosage d’expression génétique TaqMan™ correspondant pour surveiller les effets de l’inhibition de la PCR.
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
À utiliser avec (équipement)Système 7000, système 7300, système 7500, système 7900HT, système de PCR en temps réel Applied Biosystems StepOnePlus™ Fast, StepOne™, mode standard, StepOnePlus™, mode standard, systèmes QuantStudio 6 et 7 Pro, système QuantStudio 7 Flex, systèmes QuantStudio 3 et 5, système QuantStudio 12k Flex, système QuantStudio 6 Flex
FormatTube
Nbre de réactions40 réactions
Colorant de référence passiveROX (pré-mélangé)
PolyméraseADN polymérase
Gamme de produitsAmbion, Cells-to-CT, TaqMan
Type de produitKit d’expression génétique Cells-to-CT
Pureté ou qualitéUP (Ultra Pure)
Quantité40 reactions
Transcriptase inverseM-MLV
Type d’échantillonCulture
Conditions d’expéditionGlace carbonique
Suffisant pour40 réactions
Méthode de détectionAmorce-sonde
GC-Rich PCR PerformanceÉlevé
Méthode PCRRT-qPCR en 2 étape
Vitesse de réactionÉtalon
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Contenu :
• Solution d’arrêt : Tube de 200 µl
• DNase I : tube de 22 µl
• Mélange enzymatique RT 20X : Tube de 110 µl
• Solution de lyse : Tube de 2,2 ml
• Tampon RT 2X : Tube de 2,2 ml
• mélange TaqMan™ Gene Expression Master Mix : Tube de 1 ml

Conserver la solution d’arrêt, la DNase I et le mélange enzymatique RT 20X à -20°C.
Conserver la solution de lyse, le tampon RT 2X et le mélange TaqMan™ Gene Expression Master Mix à 4°C.

Foire aux questions (FAQ)

I'm seeing PCR products in the minus-RT control after performing my Cells-to-CT experiment. What does this mean?

If PCR products are seen in the minus-RT control reaction, but not in the no-template control, it indicates that genomic DNA remains in the sample and that genomic DNA was amplified in real-time PCR. Please follow the suggestions below:

- Ensure the DNase I is mixed thoroughly into the Lysis Solution.
- Use fewer cells per lysis reaction.
- Lyse cells using Lysis Solution that is at room temperature, and make sure that the lysis reaction occurs at room temperature.
You can also try increasing the incubation time of the lysis reaction to 8 minutes and/or using Lysis Solution that has been warmed up to 25 degrees C for cell lysis.

I'm getting PCR products in the no-template PCR control when performing a Cells-to-CT experiment. What could cause this?

PCR products in the no-template PCR control indicate that the sample is contaminated with DNA. More stringent steps need to be taken to control contamination.

I'm getting no PCR product or unexpected PCR products after performing a Cells-to-CT experiment. What could be the cause of this?

Please review the following possibilities and suggestions:

- A problem with adding or mixing the Stop Solution: ensure that the Stop Solution was added directly to the lysate, as components of the Lysis Solution may inhibit RT-PCR if not fully inactivated.
- The RNA was degraded: keep cells in PBS on ice before starting the cell lysis procedure.
- RNase in the sample was not completely inactivated: Too many cells could have been used or too much PBS left on the cells, diluting the lysis solution.
- The lysates sat too long before going to room temperature: Do not allow lysates to sit longer than 20 minutes at room temperature once the Stop Solution has been added.
- The sample does not contain the target RNA: Verify that the procedure is working by using the XenoRNA Control in the sample. Also check that your PCR primers can amplify your target under the PCR conditions you are using.

I ran out of stop solution for my Cells-to-CT experiment. Can I purchase it separately?

Yes, it is available in 1 mL aliquots (Cat. No. 4402960).

I have genomic DNA contamination in my Cells-to-CT reaction. How do I get rid of it?

1. Ensure that all medium is removed from the wells.
2. Wash with an equal volume of room temperature 1X PBS after the medium is removed.
3. Ensure that the reaction happens at room temperature (the lysis reaction may not reach room temperature if the plate is on ice, if the plate was quickly moved to the bench, or if a cold lysis solution was added).
4. Warm lysis solution to room temperature before adding to cells.
5. Allow the lysis reaction to proceed for 8 minutes at 25 degrees C.