Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2

Le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 est un groupe unique d’amorces permettant d’effectuer la PCR multiplexe en vue de préparer des bibliothèques d’amplicons à partir de régions “hot spot” génomiques faisant fréquemment l’objet de mutations dans les gènes du cancer chez l’humain (télécharger la liste des gènes ciblés et des mutations pour le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2). Au-delà des mutations incluses dans le panel initial Ion AmpliSeq™Cancer, le dernier panel Ion AmpliSeq™ prêt à l’emploi offre ce qui suit :
• Compatibilité maintenue avec des échantillons FFPE tout en agrandissant le contenu mutationnel pour une couverture élargie de gènes supplémentaires et de mutations “hot spot”
• Couverture extrêmement uniforme pour un séquençage plus efficace et une réduction des coûts
• Conception de l’amorce améliorée, avec une optimisation des nouveaux ensembles d’amorces et une corrélation de brin encore plus faible pour stimuler la confiance liée aux classifications de variantes précises
• Meilleure détection des variantes avec le logiciel Torrent Suite v3.0 et le plug-in de classifications de variantes lors de la détection des variantes de l’allèle faible et sensibilité améliorée à l’indel

Contenu mutationnel supplémentaire pour faire progresser les études de recherche sur le cancer
Le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 a été conçu pour amplifier 207 amplicons couvrant environ 2 800 mutations COSMIC à partir de 50 oncogènes et gènes suppresseurs de tumeurs. Cela englobe 739 mutations COSMIC à partir de 46 gènes dans le premier panel Ion AmpliSeq™Cancer avec des mutations hotspot supplémentaires provenant de gènes importants du cancer. Tout en conservant la compatibilité avec les échantillons FFPE et en couvrant les mêmes cibles que le premier panel Ion AmpliSeq™Cancer, nous avons inclus des mutations supplémentaires en ajoutant plusieurs amplicons pour les hotspots dans EZH2, GNA11, GNAQ et IDH2, et en ajoutant des amplicons légèrement plus longs pour les autres gènes afin de faire progresser vos recherches sur le cancer. Le panneau Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 doit être utilisé avec le kit de bibliothèque Ion AmpliSeq™Library Kit 2.0.

Séquençage plus efficace et plus rentable avec une couverture extrêmement uniforme
Le design amélioré de l’amorce dans le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 améliore l’uniformité de couverture de la technologie Ion AmpliSeq™. Grâce à une couverture plus uniforme, une profondeur minimale sur tous les amplicons est réalisable en utilisant un débit de séquençage nettement inférieur. Par conséquent, des échantillons supplémentaires peuvent être multiplexés à l’aide de puces ioniques. Cela se solde par des économies de coûts, avec un séquençage plus efficace, tout en conservant une confiance élevée des classifications de variantes. Qui plus est, la faible corrélation de brin dans les ensembles d’amorces du panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 stimule la confiance liée aux classifications de variantes précises.

Simplicité, vitesse et évolutivitéde la technologie Ion AmpliSeq™
En favorisant la simplicité de la technologie Ion AmpliSeq™, le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 encourage les études génétiques sur le cancer avec des tissus FFPE et seulement 10 ng d’ADN entrant pour créer une bibliothèque ciblée. Le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 gère également ce flux de travaux révolutionnaire en utilisant les équipements standard de la PCR et une simple réaction de PCR pour sélectionner la cible PCR multiplexe ultra élevée, sans recourir à un vaste programme d’investissement en capitaux. Qui plus est, le panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2 optimise votre vitesse d’accès aux bibliothèques ciblées en 3,5 heures environ. L’évolutivité et la flexibilité sont également préservées grâce au panel Ion AmpliSeq™Cancer Hotspot v2, ce qui permet le séquençage d’un échantillon unique ou d’échantillons multiplexés à code-barres à l’aide de puces ioniques.

Meilleure détection des variantes avec le logiciel Torrent Suite v3.0
Le logiciel Torrent Suite intuitif et le plug-in de classifications de variantes vous permettent de passer de l’ADN extrait aux classifications de variantes en à peine 10 heures. Grâce aux algorithmes améliorés, vous constaterez une détection plus sensible de l’indel et de SNP avec des allèles de fréquence plus faible. Le logiciel Ion Reporter™ peut alors être utilisé pour annoter les variantes dans les dosages d’ADN de routine afin de faire progresser la recherche clinique.