MAGnify™ Chromatin Immunoprecipitation System
Applied Biosystems™

MAGnify™ Chromatin Immunoprecipitation System

Le système d’immunoprécipitation de la chromatine MAGnify™ est un dosage optimisé et rationalisé destiné à l’enrichissement des complexes protéiques ouAfficher plus
Have Questions?
RéférenceQuantité
4920241 kit
Référence 492024
Prix (EUR)
728,00
Each
Quantité:
1 kit
Prix (EUR)
728,00
Each
Le système d’immunoprécipitation de la chromatine MAGnify™ est un dosage optimisé et rationalisé destiné à l’enrichissement des complexes protéiques ou de la chromatine et à la récupération de l’ADN à l’aide d’une technique de capture par microbille magnétique. L’ADN ainsi isolé peut servir aux analyses en aval selon des méthodes comme les dosages par PCR ou qPCR ou le séquençage d’ADN en parallèle à grande échelle.

ChIP
L’immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) est une technique puissante pour étudier l’association de certaines protéines avec des régions spécifiques du génome Ces protéines se liant à des séquences spécifiques de l’ADN joueraient un rôle dans les processus cellulaires comme la réplication, la recombinaison, la réparation et la ségrégation de l’ADN, la stabilité chromosomique, la progression du cycle cellulaire et l’extinction (“silencing”) épigénétique. Au cours d’un dosage ChIP standard, le traitement au formaldéhyde fixe la cellule puis la chromatine est cisaillée et immunoprécipitée par un anticorps très spécifique. Puis l’ADN est analysé pour identifier les régions génomiques où les protéines associées à la chromatine se fixent in vivo. Par rapport aux flux de travaux de ChIP standard, ce kit permet de commencer avec de plus petites quantités d’échantillons, économisant ainsi des échantillons précieux. D’autre part, le protocole est achevé en une journée seulement alors qu’il faut 2 – 3 jours avec un dosage de ChIP standard. Ce kit peut être utilisé avec notre suite d’anticorps validés pour la ChIP ; il est également complémentaire aux produits MethylCode™ et nCode™ pour la recherche en épigénétique en aval.

Utilisation du système MAGnify™
Au cours de l’utilisation du système MAGnify™, les cellules ou les tissus sont traités avec du formaldéhyde pour générer une réticulation protéine-protéine et protéine-ADN entre des molécules proches au sein de la chromatine. Les cellules sont ensuite lysées et la chromatine est libérée du noyau puis irradiée par ultrasons pour être cisaillée et obtenir des fragments moyens d’ADN de 200–500 bp, qui seront analysés par PCR quantitative en temps réel (qPCR), ou des fragments de 100–300 bp analysés par séquençage d’ADN en parallèle à grande échelle. La protéine réticulée d’intérêt est immunoprécipitée et isolée en utilisant un anticorps pour ChIP spécifique, conjugué à la protéine A/G Dynabeads™. La réticulation avec le formaldéhyde est inversée par traitement thermique et l’ADN associé à cette protéine est purifié. L’ADN est alors prêt pour des analyses en aval : PCR en point final ou quantitative (qPCR), analyses de l’ensemble du génome par puces “promoter-tiling arrays” ou séquençage de nouvelle génération. Lors d’une analyse par PCR/qPCR, les amorces sont élaborées pour couvrir la séquence d’ADN d’intérêt souhaitée et les données recueillies permettent de savoir si la protéine d’intérêt est associée in vivo à cette région d’ADN.
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
À utiliser avec (application)Immunoprécipitation de la chromatine
Compatibilité à haut débitCompatible avec le haut débit
Quantité1 kit
Type d’échantillonCultures cellulaires, ADN (génomique), cellules vivantes
Suffisant pour24 réactions
Gamme de produitsMAGnify
TypeSystème d’immunoprécipitation
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Module 1 (expédié sur de la glace humide, stocker à 4°C) :
• 2 × 1 ml glycine (1,25 M)
• 250 µl Dynabeads™ Protéine A/G (ne pas congeler)
• 1,4 ml tampon de réticulation inverse
• 500 µl microbilles magnétiques de purification d’ADN (ne pas congeler)
• 1,4 ml tampon de purification d’ADN
• 200 µl protéinase K (20 mg/ml)

Module 2 (expédié sur glace humide, stocker à 4°C) :
• Tampon 1 IP de 10 ml
• Tampon 2 IP de 7,5 ml
• Tampon de lavage ADN de 8 ml
• Tampon d’élution ADN 7,2 ml

Module 3 (expédié sur glace sèche, stocker à -20°C) :
• Inhibiteurs de protéase 100 µl (200X)
• Module IgG souris 15 µl (1 µg/µl)
• IgG lapin 15µ l (1 µg/µl)

Module (expédié sur glace sèche, stocker à -20°C) :
• Tampon de dilution de 8 ml
•, tampon de lyse de 3,6 ml

Foire aux questions (FAQ)

What is the recommended amount of starting material when working with the MAGnify Chromatin Immunoprecipitation System kit?

For each ChIP reaction, we recommend using 10,000-300,000 cells or 0.167-5 mg of tissue. To ensure consistency and decrease experimental variability, we recommend preparing a common chromatin batch suitable for multiple ChIP experiments. Note that following lysis, samples are at a concentration of 1 million cells/50 µL.

I am getting equivalent PCR signal from positive and negative control IP samples. Why is this?

There might be excess chromatin or antibody added to the IP, or insufficient amount of DNA template added into the PCR reaction. Also your PCR conditions might need optimizing. Try decreasing the number of amplification cycles in PCR. Finally, it is ideal to have duplicate or triplicate runs for each IP to identify any issues, like human or product errors.

I am not getting PCR signal in the experimental IP samples, while the results from positive and negative control IPs are as expected. What happened?

The most possible cause is the antibody does not function in IP. Not all antibodies used for western blotting will work well in ChIP. You need to verify the antibody is qualified for ChIP or IP applications. And try adding more antibody to the IP reaction and more DNA template to the PCR.

I am not getting any PCR signal with the positive control IP samples. Do you have some tips?

This is likely to be caused by insufficient chromatin amount in the IP reaction or insufficient antibody incubation time. We also recommend optimizing the crosslinking condition, and monitoring sonication of nuclei by microscope to ensure complete lysis.

I am doing chromatin analysis and am not getting PCR signal in the total input control samples. What should I do?

First make sure that the PCR condition is fully optimized and check the primer design. Then try increasing the amount of template DNA added to the PCR reaction. Finally, evaluate sonication of nuclei by microscope to ensure complete lysis.