Conçue pour permettre des études de profilage d’expression de nouvelle génération, la matrice de transcriptome humain GeneChip™ 2.0 permet d’aller au-delà du profilage d’expression au niveau des gènes en fournissant la couverture et la précision requises pour détecter avec précision toutes les isoformes de transcription connues produites par un gène.

Consultez la fiche technique pour plus de détails sur le contenu et la couverture du HTA 2.0.

Une exploration complète du transcriptome
La recherche a montré que les dizaines de milliers de gènes humains contiennent des centaines de milliers d’exons, qui produisent des centaines de milliers d’isoformes de transcription différentes. Ces isoformes de transcription sont produites lorsque les exons d’un gène peuvent être inclus ou exclus de l’ARN messager final traité produit à partir de ce gène. Jusqu’à présent, la mesure et l’analyse de ces isoformes de transcription ont été pratiquement impossibles en raison des limites technologiques, des exigences en matière d’entrée d’échantillons et du manque de capacités/d’outils d’analyse.

L’analyse complète du transcriptome nécessite la combinaison de la diversité des transcripts à partir de plusieurs sources de données
La plupart des gènes produisent de multiples isoformes de transcription et la mesure des changements dans l’abondance relative de chaque isoforme fournit de nouveaux points de vue sur la maladie et la biologie. HTA 2.0 a combiné plusieurs sources de données pour vous assurer que vous êtes en mesure d’analyser indépendamment la plus grande collection d’isoformes de transcription disponibles.

Sources de données utilisées pour concevoir et annoter la matrice
RefSeq                                    Base de données Vertebrate Genome Annotation (Vega)
Ensembl                                   MGC Collection de gènes de mammifères (v10)
UCSC Gènes connus               www.noncode.org
UCSC Transcripts lincRNA        IncRNA db
Catalogue du Broad Institute, Human Body Map lincRNA, et TUCP (transcripts d’un potentiel codage incertain)

Données de meilleure qualité que 2 voies complètes de séquençage
Pour plus d’informations, reportez-vous au dépliant HTA 2.0 de la section Documents ci-dessous. HTA 2.0 offre une précision et une précision supérieures couplées à la vue la plus complète du transcriptome.

Bioinformatique intégrée à la conception de la matrice ; aucun assemblage requis
HTA 2.0 optimise la quantité d’informations uniques et précieuses possibles en minimisant la séquence conservée synthétisée sur la matrice. Cette conception de matrice haute résolution contient un nombre sans précédent de >6,0 millions de sondes couvrant les transcripts codants et les transcripts non codants. 70 % des sondes de cette matrice couvrent les exons des transcripts codants et les 30 % restants des sondes de la matrice couvrent les jonctions d’épissage exon-exon et les transcripts non codants. La couverture inégalée de cette matrice permet d’avoir une vision approfondie de tous les transcripts codants et non codants disponibles.

Solution d’analyse simple, rapide et gratuite
Pour la première fois, HTA 2.0 associé ™ au logiciel Expression Console et au logiciel TAC offre aux chercheurs une solution complète, des données aux prises de décision en quelques minutes. Cette solution d’analyse complète est fournie à tous les chercheurs utilisant nos matrices d’expression sans frais supplémentaires. En outre, l’analyse des données HTA 2.0 est prise en charge par les mêmes solutions d’analyse et fournisseurs de services utilisés pour d’autres données de matrices d’expression.

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