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Invitrogen™

BioPrime™ Total FFPE Genomic Labeling System

Le système de marquage génomique de FFPE total BioPrime™ est un kit complet de marquage d’ADN génomique conçu pour uneAfficher plus
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RéférenceQuantité
A10965011
également connu sous le numéro A10965-011
30 réactions
Référence A10965011
également connu sous le numéro A10965-011
Prix (EUR)
3 750,00
Each
Quantité:
30 réactions
Prix (EUR)
3 750,00
Each
Le système de marquage génomique de FFPE total BioPrime™ est un kit complet de marquage d’ADN génomique conçu pour une utilisation dans des applications d’hybridation génomique comparative basées sur des matrices (aCGH) à l’aide d’échantillons fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE). Les protocoles précédents ont nécessité de grandes quantités d’ADN de très haute qualité, ce qui est souvent difficile à obtenir à partir de matériel FFPE. Grâce à une méthode d’amplification par amorce aléatoire (RPA), utilisant des mélanges de marquage spécifiquement formulés pour les échantillons de FFPE, le système d’étiquetage génomique de FFPE total BioPrime™ génère des rendements élevés d’ADN marqué, ce qui est le plus représentatif de l’échantillon de départ. Une précision accrue des classifications est obtenue avec des rendements plus élevés de matériaux marqués sur la matrice, ce qui vous donne des classifications plus précises. Le système de marquage génomique de FFPE total BioPrime™ offre aux utilisateurs les avantages suivants :

- taux de classification amélioré avec des rapports signal / bruit plus élevés à partir des colorants Alexa Fluor™ 3 et 5
- la facilité de nettoyage de la purification Purelink™ élimine la nécessité de recourir à des étapes complexes de réduction du volume
- moins de biais de canal dû à une formulation de réaction améliorée pour les échantillons FFPE
- exigences moindres pour les matériaux d’entrée à l’aide de la méthode de RPA enzymatique


Ce kit tout compris est optimisé pour fonctionner sur une plus large gamme de matériaux d’échantillons sans nécessiter de préamplification. Le fragment exo-Klenow hautement concentré de l’ADN polymérase I dans une réaction limitée à un composant permet des rendements d’ADN homogènes et robustes d’ADN FFPE génomique. BioPrime™ Total pour aCGH Agilent™ est fourni avec la purification Purelink™ qui permet une faible élution, éliminant ainsi la nécessité de recourir à des étapes complexes de réduction de volume. La purification Purelink™ réduit également le bruit de fond dû à la présence de colorants dans d’autres systèmes de purification. Un mélange de nucléotides marqué par colorant optimisé avec de nouveaux liants dNTP, de nouveaux colorants Alexa Fluor™ 3 et 5 spécifiques à l’application et une meilleure chimie de tampon réduit la variation de marquage et augmentent le rapport signal-bruit sur les matrices. Les spectres d’excitation et d’émission des colorants Alexa Fluor™ 3 et 5 conviennent aux scanners deux couleurs classiques sans avoir à modifier les réglages. Les kits complets sont testés par lots pour garantir la qualité des performances, lot par lot.
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Excitation / émission650/670, 555/565
Comprend l’étiquette ou le colorantOui
Méthode d’étiquetageMarquage direct
Gamme de produitsBioPrime
Type de produitSystème de marquage génomique
Quantité30 réactions
Méthode de détectionFluorescence
Type de produit finalSondes (ADN marqué)
Labeling TargetADN génomique
Marqueur ou colorantAlexa Fluor™ 3, Alexa Fluor™ 5
Type d’échantillonTissu (FFPE)
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Contient le mélange de nucléotides Alexa Fluor™ 3 FFPE 10X et mélange de nucléotides Alexa Fluor™ 5 FFPE 10X, fragment Exo-Klenow (40 U ⁄ µl), 5 mM EDTA, solution d’amorces aléatoires 2,5X, ADN de contrôle (sperme de saumon) et eau traitée au DEPC. Stockez à -80°C pour un stockage à long terme. Les mélanges de nucléotides 10X peuvent être stockés à +4°C pendant 4 semaines et doivent être tenus à l’abri de la lumière. Contient également des colonnes de purification d’ADN génomique et des tampons de purification Purelink™. Stocker à température ambiante. Tous les composants sont garantis pendant 6 mois lorsqu’ils sont correctement conservés.

Foire aux questions (FAQ)

Why is the selection of a BioPrime Genomic Labeling System so important?

The overall performance of your microarray experiment is driven by numerous factors including the microarray, amplification method, labeling method, hybridization solutions/conditions, blocking and wash methods, as well as performance of the associated hardware systems. In order to achieve the highest confidence in your array results best in class components must be selected for each step. Invitrogen’s BioPrime Total and Cot-1 DNA products are the proven labeling and blocking reagents to increase accuracy, sensitivity, and simplicity.

When using BioPrime Genomic Labeling Systems, why is random primed linear amplification (RPA) so important for these applications?

All of the BioPrime Genomic Labeling systems are based on linear, random primed amplification methods-the best method to maintain accurate representation of copy number. Other methods of amplification may provide inaccurate amplification of starting material which potentially invalidate array results.

What are the differences between Alexa Fluor 3 and 5 used in the BioPrime Genomic Labeling Systems?

Both lines of Alexa Fluor dyes can be used on traditional 2 color scanners with excitation and emission wavelengths optimized for these scanners.  The Alexa Fluor 3 and Alexa Fluor 5 dye conjugated nucleotides have been optimized for DNA Microarray applications and are incorporated with the enzymes used in BioPrime Total Genomic Labeling systems to provide excellent performance when dried down on arrays. Excitation/Emission for Alexa Fluor 3 is 555/565 nm. For Alexa Fluor 5 it is 650/670 nm.

Which BioPrime Genomic Labeling System is right for me?

The BioPrime Total array CGH reagents offer various configurations to allow for optimal performance on arrays based on premier enzymes, primers, dyes and purification systems. For 2 color array CGH and ChIP on Chip experiments Invitrogen recommends the BioPrime Total Genomic Labeling system. The BioPrime Total Genomic Labeling system allows for the lowest starting input material, includes application optimized dye labeled nucleotides with Alexa Fluor 3 and Alexa Fluor 5 dyes, and is the simplest, easiest to use kit in the product family.  For researchers favoring other dyes, BioPrime aCGH Genomic Labeling systems are available without dyes and can be used with your dye of preference to offer superior yield and total dye incorporation due to higher performance enzymes and reagents from Invitrogen. Both BioPrime Total and BioPrime array CGH kits have been successfully used with both oligo and BAC arrays from vendors such as:  Agilent, Perkin Elmer, Signature Genomics, Combimatrix Diagnostics, and BlueGnome. For microarray systems requiring biotin labeling the BioPrime DNA Labeling system includes biotin labeled nucleotides in the kit and has been successfully used in both one and two color microarray experiments. View the Genomic array CGH selection guide.