GeneArt™ Seamless Cloning and Assembly Enzyme Mix
Invitrogen™

GeneArt™ Seamless Cloning and Assembly Enzyme Mix

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Le mélange d’enzymes de clonage et d’assemblage transparents GeneArt™ permet le clonage simultané et directionnel de 1 à 4 fragments de PCR, composés de n’importe quelle séquence, dans n’importe quel vecteur linéarisé, en une seule réaction à température ambiante de 30 minutes. Le mélange d’enzymes transparentes GeneArt™ est le choix le plus économique pour créer des constructions allant jusqu’à 13 kb avec la possibilité d’un assemblage à haut débit.

Efficacité : option de pré-clonage pour les fragments de grande taille afin d’augmenter l’efficacité de clonage
Rapidité et facilité : clonez des fragments d’ADN, avec la séquence de votre choix, en un seul vecteur (jusqu’à 13 kb) ; aucun site de digestion par enzymes de restriction, de ligature ou de recombinaison requis
Outils gratuits : concevez votre construction finale et vos oligos d’ADN in silico grâce à notre outil Web gratuit qui vous guide étape par étape dans l’ensemble de votre projet
Flexibilité du vecteur : utilisez notre vecteur linéaire ou un vecteur de votre choix

Pour le clonage d’éléments d’ADN préexistants depuis trop longtemps pour être amplifiés par PCR et pour des molécules finales jusqu’à 40 Kb, envisagez le kit de clonage et d’assemblage GeneArt™ Seamless PLUS (1 à 4 fragments d’ADN uniquement) ; et pour les molécules finales supérieures à 110 Kb, envisagez le système d’assemblage génétique GeneArt™ High-Order.

Création de clones simple et rapide
Le clonage GeneArt™ Seamless est un processus simple en deux étapes, composé d’un assemblage in vitro suivi d’une transformation. Le mélange d’enzymes utilise un mélange d’enzymes / tampons exclusif pour assembler des fragments d’ADN sans séquences supplémentaires ni cicatrices (“transparent”). L’homologie des extrémités terminales est facilement incorporée par amplification par PCR avec des oligos d’ADN adaptés conçus à l’aide de notre outil web gratuit.

Efficacité, flexibilité et précision du clonage
Le succès du clonage ne dépend pas de la séquence d’inserts ni du type de vecteur, ce qui vous permet de concevoir et d’ajouter presque n’importe quelle séquence, ou combinaison de séquences, souhaitée à n’importe quel plasmide tant qu’elle peut être linéarisée par une digestion par enzymes de restriction ou par PCR. Les clones circularisés obtenus à partir de la réaction ne contiennent que la séquence de votre vecteur d’origine, des inserts, les homologies Clonage désignées, sans insertions de nucléotides étrangères.

Assistance de conception de clonage in silico
Une étape clé du clonage GeneArt™ Seamless est la conception correcte des fragments et des oligos avec une homologie et un espacement adaptés, ce qui contribue au succès de l’assemblage de votre clone. Pour simplifier et accélérer le processus de conception, nous proposons un outil en ligne gratuit, l’outil de conception pour l’assemblage et la mutagenèse transparente ou de haut niveau GeneArt™ qui vous aidera à concevoir vos expériences in silico. L’outil guide l’utilisateur dans la conception de la construction, notamment pour l’importation, l’ordre et l’orientation des fragments ; il vérifie les zones de l’homologie et les éventuels problèmes de conception ; il crée des amorces pour le pré-clonage ou l’incorporation de l’homologie des extrémités terminales entre les fragments, si nécessaire ; puis il génère les fichiers de la carte de construction finale et la séquence au format Genbank pour le téléchargement ou l’importation dans le logiciel Vector NTI™.

Applications
Le mélange enzymatique de clonage et d’assemblage GeneArt™ Seamless est conçu pour permettre le clonage et l’assemblage d’ADN dans un large éventail d’applications de biologie moléculaire et de biologie synthétique, entre autres. Ce produit permet de créer des vecteurs d’expression modulaires, avec des éléments interchangeables, et peut être utilisé pour effectuer une variété d’opérations qui nécessiteraient sinon une multitude d’étapes. Utilisez le mélange pour construire des protéines hybrides ; supprimer, remplacer ou ajouter des éléments ADN tels que des sites de restriction dans un vecteur existant ; et exécuter de nombreuses autres techniques qui nécessitent une manipulation de séquences génétiques.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Non utilisé à des fins thérapeutiques ou diagnostiques humaines ou animales.
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Méthode de clonageClonage transparent
À utiliser avec (application)Clonage
Nombre de fragmentsJusqu’à 4 fragments
Quantité20 réactions
Dimensions13 kb au total (vecteur plus tous les inserts)
VecteurpUC19L linéarisé
Étape du flux de travailAssemblage d’ADN
FormatKit
Unit SizeEach
Contenu et stockage
1 flacon de mélange enzymatique GeneArt (2X)
Vecteur linéarisé pUC19L
Insert de contrôle

Foire aux questions (FAQ)

With the GeneArt Seamless Cloning and Assembly Kit, a large number of the transformants contain the incorrect insert. Can you please offer some suggestions?

Check your PCR product on a gel. You may be getting multiple products, causing incorrect inserts to clone in to your vector. Gel purification of the PCR products can help with this issue.

With the GeneArt Seamless Cloning and Assembly Kit, a large number of the transformants contain no insert. Can you please offer some suggestions?

Check to ensure that the cloning vector is completely linearized. Additionally, the order in which the GeneArt Enzyme mix is added is crucial to the experiment – add it last. Lastly, check the incubation time of the reaction for the recommended time.

With the GeneArt Seamless Cloning and Assembly Kit, I'm getting no colonies after transformation with DNA inserts, but the transformation with control assembly reaction is successful. Can you please offer some troubleshooting tips?

– Check the purity of the PCR products.
– Ensure that the required end-terminal homology between ends is present.
– DNA ends may have been damaged during preparation (exposure to UV); limit exposure time to UV/EtBr.
– Check ratio and amounts of DNA inserts and vector (2:1 insert:vector molar ratio).
– Ensure that the GeneArt Enzyme Mix is handled correctly.This enzyme is temperature sensitive. Return immediately to storage after use. Do not leave at room temperature or on ice for extended periods.

I'm cloning 4 DNA fragments in a vector. Should I use the GeneArt Seamless Cloning and Assembly (Plus) Kit or the GeneArt High-Order Genetic Assembly Kit?

If the fragments are all below 5 kb and the total size of the molecule is below 13 kb, we would recommend the GeneArt Seamless Cloning and Assembly (Plus) kit. If you are assembling elements that have no end-homology, are too large to be amplified by PCR, or are trying to create a molecule over 13 kb, we recommend the GeneArt High-Order Genetic Assembly System. Overall, the High-Order system can do more fragments, fragment editing, and oligonucleotide stitching and can do it at a higher efficiency. However, the assembly is in vivo (yeast) and takes longer to get the final construct due to longer growth periods for yeast compared to E. coli. Select the GeneArt Seamless Cloning and Assembly kit that is best for your application by visiting http://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/cloning/seamless-cloning-and-genetic-assembly.html.

I am using the GeneArt Seamless Cloning and Assembly Kit, and I accidentally designed my primers so there is only a 14 bp overlap. Is this acceptable?

This should not be a problem. An overlap that is a few bases shorter than recommended should still function in the reaction. However, for best results always use 15 bp.