MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit
MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit
Applied Biosystems™

MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit

Le kit d’ADN / ARN MagMAX™ FFPE Ultra est conçu pour l’isolement séquentiel de l’ADN et de l’ARN à partirAfficher plus
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RéférenceQuantité
A318811 kit
Référence A31881
Prix (EUR)
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Le kit d’ADN / ARN MagMAX™ FFPE Ultra est conçu pour l’isolement séquentiel de l’ADN et de l’ARN à partir du même échantillon de tissu fixé au formaldéhyde ou au paraformaldéhyde et inclus en paraffine (FFPE). L’ADN et l’ARN sont récupérés dans des éluats séparés et sont tous compatibles avec une vaste gamme d’applications, notamment la PCR en temps réel et le séquençage de nouvelle génération. L’isolement de l’ARN et de l’ADN du même échantillon FFPE fait de ce kit une méthode idéale de préparation des échantillons pour les dosages Oncomine™ Comprehensive etOncomine™ Focus.

Caractéristiques du kit d’ADN / ARN FFPE MagMAX Ultra :
• Conception flexible qui permet l’isolement manuel et automatisé de l’ARN et de l’ADN
• Exigence minimale d’entrée de repli ou de coupe de 5 µm
• Capable de traiter des coupes ou des replis en FFPE de 40 µm ; les coupes supérieures à 40 µm peuvent être traitées avec un protocole alternatif
• Compatible avec les panels de séquençage d’ARN et d’ADN ciblés
• Contient les Dynabeads™ MyOne™ Silane pour l’isolement homogène de l’ARN, du micro-ARN et de l’ADN
• Des protocoles alternatifs pour l’isolement de l’ARN ou de l’ADN seulement

Accéder aux informations contenues dans les échantillons de FFPE est essentiel pour les recherches sur le cancer. Les méthodes courantes d’isolement des acides nucléiques exigent que vous choisissiez l’acide nucléique à récupérer à partir d’un échantillon donné, avec perte de l’autre acide nucléique (et de toute information qui peut avoir découlé de son analyse). Autrement, l’ADN et l’ARN sont co-purifiés, ou l’échantillon est divisé en deux afin qu’ils puissent tous les deux être purifiés.

Plus d’informations avec moins d’échantillons
Le protocole du kit d’ADN / ARN FFPE MagMAX Ultra règle ces problèmes en isolant d’abord l’ADN de l’échantillon FFPE, puis en récupérant l’ARN du surnageant épuisé en ADN. Les acides nucléiques sont préparés en éluats séparés et sont ensuite prêts pour une analyse en aval. Ceci permet une analyse plus complète des échantillons précieux, notamment l’étude de biomarqueurs importants, tels que les points chauds de mutation, les VNC, les fusions de gènes et les indels.

Avantages de la purification à microbilles magnétiques MagMAX
La purification avec microbilles magnétiques du kit permet d’augmenter ou de réduire facilement le nombre d’échantillons traités manuellement avec un support magnétique ou avec un processeur de particules magnétiques tel que le processeur KingFisher™ Duo Prime ou KingFisher™ Flex.

Les microbilles magnétiques ont de nombreux avantages comparées à d’autres technologies d’isolement de l’acide nucléique. L’ADN et l’ARN se lient plus efficacement aux microbilles qu’aux filtres en fibre de verre, ce qui permet d’obtenir des rendements plus élevés et plus constants. L’absence de filtres et de modules de dégazage permet également d’éliminer tout risque que des particules de tissus non digérées obstruent ces éléments pendant le processus d’extraction. Ce problème d’obstruction est particulièrement préoccupant pour les échantillons de tissus en FFPE fibreux qui ne sont pas entièrement digérés pendant le traitement à la protéinase K.

Chimie optimisée de la surface des microbilles
Les Dynabeads MyOne Silane utilisés dans le kit d’ADN / ARN FFPE MagMAX Ultra ont une chimie de surface optimisée de type silice avec une surface hautement spécifique qui permet une cinétique efficace et une sensibilité élevée pour la capture d’acides nucléiques. Ces particularités font des Dynabeads MyOne Silane l’outil idéal pour la récupération des ARN et ADN cibles présents dans les échantillons FFPE. Une fois capturés, ces deux acides nucléiques sont ensuite élués séparément en volumes de 50 µl et sont prêts pour des applications en aval.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
À utiliser avec (application)Séquençage de nouvelle génération, RT-PCR (point final), PCR en temps réel, PCR, analyse de micro-ARN
Compatibilité à haut débitCompatibilité avec des cadences élevées
Gamme de produitsMagMAX
Type de produitKit d’ADN/ARN FFPE Ultra
Quantité1 kit
Type d’échantillonFFPE, Échantillons fixés
Conditions d’expéditionApprouvé pour l’expédition à température ambiante ou sur de la glace ou de la glace carbonique.
CibleARN total, micro-ARN, acides nucléiques totaux, ADN génomique, ARNm, ARN transcriptome
FormatKit
Isolation TechnologyMicrobille magnétique
Unit SizeEach
Contenu et stockage
• 1 x 385 µl de protéase, stocker entre -5 et -30°C
• 1 x 10 ml de tampon de digestion par la protéase, stocker à température ambiante
• 1 x 38,5 ml de solution de liaison, stocker à température ambiante
• 1 x 1,95 ml de microbilles de liaison d’acides nucléiques, stocker entre 2°C et 8°C
• 1 x 38,5 ml de tampon de lavage d’ADN, stocker à température ambiante
• 1 x 210 ml de concentré de solution de lavage 2, stocker à température ambiante
• 1 x 5 ml de solution d’élution, stocker à température ambiante
• 1 x 115 ml de concentré de tampon de lavage d’ARN, Stocker à température ambiante
• 1 x 1,92 ml de DNase, stocker entre -5 et -30°C
• 1 x 960 µl de tampon DNase, stocker entre -5 et -30°C

Foire aux questions (FAQ)

How can I increase my chances of successful extraction of FFPE samples in terms of DNA quality and yield?

There are a number of factors that can impact the overall quality and yield of DNA isolated from FFPE tissues. Here are recommendations to address several key factors:

- Upstream tissue procurement and tissue specimen preparation - if possible, tissues should be fixed within one hour of surgical resection. The optimal fixation time is 12-24 hours using neutral-buffered formalin or paraformaldehyde. Fixed tissues should be thoroughly dehydrated prior to the embedding process.
- Block storage - storage of blocks without cut faces, when possible, prevents ongoing damage from exposure to atmospheric oxygen, water, and other environmental factors such as light and infestation (fungi, insects, etc.).
- Tissue type, size, and amount being used for DNA isolation - the recommended tissue thickness is 10-20 µm. The number of sections used is determined by the tissue type (which impacts cell density) and surface area (recommended size: 50-300 mm^2). Excess starting material can cause filter clogging, resulting in poor yield.
- Excessive amount of paraffin used for embedding tissues - when possible, excess paraffin should be trimmed away prior to starting the purification protocol. For xylene-based purification methods, two xylene treatments at room temperature should be sufficient for complete deparaffinization. If desired, a more rigorous 37-55 degrees C treatment can be performed for up to 30 minutes. After the xylene deparaffinization, it is crucial that the 100% ethanol is completely removed and the pellets are dry after the two 100% ethanol washes. The magnetic bead method employs novel chemistries to deal with the paraffin that limits input to 20 µm sections.

Read more about extraction of nucleic acids from FFPE samples here (http://www.thermofisher.com/us/en/home/references/Invitrogen-tech-support/rna-isolation/general-articles/extraction-of-nucleic-acids-from-ffpe-samples.html).

What can I use to extract DNA from FFPE (formalin fixed paraffin embedded) samples?

We offer 2 kits: RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit for FFPE and MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit Read more about the differences between these kits here (http://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/dna-rna-purification-analysis/dna-extraction/genomic-dna-extraction/dna-extractions-working-with-ffpe-samples.html).

Is there a limit to the size of curls that can be processed with the MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit (Cat. No. A31881)?

There is no specific upper limit to curl size for use with the MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra kit (Cat. No. A31881). If all of the tissue is able to be submerged in the 200 µL of buffer, then the large volume of protocol should work. Please keep in mind when processing sections that are thicker than 40 µm, additional digestion buffer, binding solution, and wash buffer, may need to be purchased separately (Cat. No. A32796).

Can I use a heat block for the AutoLys M tube incubation?

No. The AutoLys M tubes don't fit in a standard 1.5 mL or 2.0 mL heat block. We recommend incubating the tubes in the tube racks in an incubator or oven.

What kind of centrifuge do I need to spin down the AutoLys M Tubes (Cat. No. A38738)?

Any centrifuge with plate adapters will work. The AutoLys M Tube Racks fit nicely into those adapters.