Collibri™ Library Amplification Master Mix with Primer Mix
Collibri™ Library Amplification Master Mix with Primer Mix
Invitrogen™

Collibri™ Library Amplification Master Mix with Primer Mix

Le Master Mix d’amplification de bibliothèque Invitrogen Collibri est une solution prête à l’emploi conçue pour l’amplification des bibliothèques deAfficher plus
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Le Master Mix d’amplification de bibliothèque Invitrogen Collibri est une solution prête à l’emploi conçue pour l’amplification des bibliothèques de séquençage de nouvelle génération (NGS). Le Master Mix comprend l’ADN polymérase Platinum SuperFi en association avec un tampon de réaction exclusif contenant tous les composants nécessaires pour une amplification efficace de la bibliothèque avec un biais minimal et une précision supérieure.

Caractéristiques :
Haute fidélité : taux d’erreur minimal similaire aux méthodes sans PCR
Haute efficacité : rendements élevés d’efficacité élevés à partir de quantités infime de modèles
Biais minimal : amplification uniforme, quelle que soit la teneur en GC

Le Master Mix d’amplification de bibliothèque Collibri avec mélange d’amorces est fourni avec un mélange d’amorces 10X qui cible les régions P5 et P7 des adaptateurs Illumina. Le Master Mix est complété par un colorant bleu inerte, tandis que le mélange d’amorces contient un colorant jaune. Le mélange des deux composants dans une réaction PCR rend la solution PCR finale verte. Ceci fournit une aide visuelle lors du pipetage et diminue le risque d’erreurs de pipetage pendant la configuration de la réaction.

L’ADN polymérase Platinum SuperFi présente l’activité polymérase 5’ à 3’ et l’activité d’exonucléase (relecture) 3’ à 5’, mais pas l’activité exonucléasique 5’ à 3’. Une activité de correction exceptionnellement forte garantit l’amplification des bibliothèques NGS avec une précision de séquence extrême, produisant des taux d’erreur NGS similaires aux méthodes sans PCR

Le tampon de réaction exclusif contient tous les composants et additifs PCR nécessaires pour permettre une amplification efficace et uniforme de la bibliothèque, quel que soit le contenu en GC, ce qui permet d’améliorer la couverture dans les séquences riches en GC et en AT et dans d’autres régions complexes. L’efficacité d’amplification élevée permet d’utiliser moins de cycles pour obtenir le rendement désiré.

La technologie de démarrage à chaud Platinum inhibe l’activité de l’ADN polymérase à température ambiante, ce qui permet la configuration de la réaction à température ambiante et le stockage de réactions PCR pré-assemblées jusqu’à 24 heures avant la PCR.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Fidélité (par rapport à Taq)≥100
À utiliser avec (application)Séquençage
FormeLiquide
Performances de PCR riches en GCÉlevé
Hot StartFonctionnalité Hot-Start (démarrage à chaud) intégrée
Nbre de réactions50
En surplombArrondi
Gamme de produitsCollibri
Type de produitMaster Mix d’amplification de bibliothèque
Quantité50 reactions
Format de réactionSuperMix ou Master Mix
Type d’échantillonADN, ARN
Conditions d’expéditionGlace carbonique
Heure du testÉtalon
Unit SizeEach
Contenu et stockage
•1 Master Mix d’amplification de bibliothèque Collibri de 1,25 ml (2X)
• 1 mélange d’amorce de 500 µl

Conserver à -20°C.

Foire aux questions (FAQ)

Are PCR products generated using the Collibri Library Amplification Master Mix blunt-ended?

Yes, PCR products generated using the Collibri Library Amplification Master Mix are blunt-ended.

Is Collibri Library Amplification Master Mix compatible with magnetic beads?

Yes, Collibri Library Amplification Master Mix is compatible with magnetic beads provided in Collibri library preparation kits and in Agencourt AmPure XP system from Beckman Coulter.

What is the fidelity of the Collibri Library Amplification Master Mix?

The Collibri Library Amplification Master Mix contains Platinum SuperFi DNA Polymerase that has strong 3' to 5' exonuclease (proofreading) activity for superior amplification accuracy, greater than 100-fold in comparison with Taq polymerase.

What are the recommended storage conditions for the Collibri Library Amplification Master Mix?

We recommend storing the Collibri Library Amplification Master Mix at -20 degrees C.

Is Collibri Library Amplification Master Mix suitable for amplification of libraries prepared from FFPE samples?

Yes, however, additional PCR cycles (1-3) are typically needed with FFPE DNA or other challenging samples. To determine the optimal PCR conditions, use the table in the user manual (https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0017582_Platinum_SuperFi_LibraryAmp_MM_w_Primer_Mix_UG.pdf) with the required number of PCR cycles per sample size as a starting point.

Citations et références (1)

Citations et références
Abstract
High-resolution microbiome analysis enabled by linking of 16S rRNA gene sequences with adjacent genomic contexts.
Authors:Kapustina Ž, Medžiune J, Alzbutas G, Rokaitis I, Matjošaitis K, Mackevicius G, Žeimyte S, Karpus L, Lubys A
Journal:Microb Genom
PubMed ID:34473015
Sequence-based characterization of bacterial communities has long been a hostage of limitations of both 16S rRNA gene and whole metagenome sequencing. Neither approach is universally applicable, and the main efforts to resolve constraints have been devoted to improvement of computational prediction tools. Here, we present semi-targeted 16S rRNA sequencing (st16S-seq), ... More