Collibri™ PCR-free PS DNA Library Prep Kits for Illumina Systems
Invitrogen™

Collibri™ PCR-free PS DNA Library Prep Kits for Illumina Systems

Le kit de préparation Invitrogen pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR prépare des bibliothèques pour le séquençage de génomeAfficher plus
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RéférenceNbre de réactionsType de produit
A4361002424 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit D, 73-96)
A38608024W24 préparationsKit de base de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR
A38610096W96 préparationsKit de base de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR
A3860802424 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index CD
A3861009696 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index CD
A3860902424 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit A, 1-24)
A4360802424 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit B, 25-48)
A4360902424 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit C, 49-72)
A3861519696 préparationsKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kits A-D, 1-96)
Référence A43610024
Prix (EUR)
992,00
Each
Nbre de réactions:
24 préparations
Type de produit:
Kit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit D, 73-96)
Prix (EUR)
992,00
Each
Le kit de préparation Invitrogen pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR prépare des bibliothèques pour le séquençage de génome entier (WGS) sur des systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) à haut débit Illumina. Le kit est adapté aux génomes à cisaillage physique (PS) de toutes tailles et de qualité variable, y compris les échantillons FFPE.

Le kit de préparation pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR :
• Inclut un feedback visuel pendant le traitement à chaque étape du processus pour confirmer le mélange approprié des réactifs et optimiser les chances de réussite de la préparation de la bibliothèque
• Comprend tous les composants nécessaires dans un seul kit
• Offre une couverture améliorée des régions génomiques complexes par rapport aux technologies disponibles en matière de préparation des bibliothèques
• Prend en charge les protocoles sans PCR dès 500 ng d’ADN
• Fournit jusqu’à 96 index combinatoires doubles ou uniques
• S’applique à l’automatisation de la préparation de la bibliothèque

Le kit de préparation pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR contient des colorants inertes qui fournissent un feedback visuel lors de la préparation de la bibliothèque : les mélanges de réaction changent de couleur en réponse à l’ajout de composants critiques à chaque étape. Les colorants inertes n’interfèrent pas avec les réactions enzymatiques et ne compromettent pas les résultats du séquençage.

Le kit de préparation pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR offre des appels SNP et INDEL plus fiables résultant d’une couverture améliorée des régions génomiques complexes à partir d’entrées dès 500 ng d’ADN double brin cisaillé physiquement (voir figure ci-dessous). L’ensemble du protocole de préparation de la bibliothèque dure environ deux heures pour le flux de travail sans PCR. Le kit contient des adaptateurs avec des index doubles (UDI) ou des index doubles combinatoires (CD) uniques qui permettent de mettre en commun jusqu’à 24 ou 96 échantillons différents avant d’exécuter le séquençage.

Applications
Le kit de préparation pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR est recommandé pour les applications suivantes :
• Séquençage du génome entier
• Reséquençage
• Assemblage de novo

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.
Spécifications
DescriptionLe produit contient les modules A38576024, A43351024, A43190024
À utiliser avec (application)Séquençage du génome entier, reséquençage, assemblage De Novo
À utiliser avec (équipement)HiSeq X, HiSeq2500, HiSeq3000, HiSeq4000, MiSeq ou iSeq, NextSeq 550, NovaSeq 6000
BibliothèquesBibliothèque de fragments
Nbre de réactions24 préparations
Gamme de produitsCollibri
Type de produitKit de préparation de bibliothèques d’ADN PS sans PCR avec index UD (kit D, 73-96)
Quantité24 préparations
Type d’échantillonADN
Conditions d’expéditionGlace carbonique
Étape du flux de travailGénération de bibliothèques
FormatKit
Sequencing TypeSéquençage du génome et de l’ADN
Unit SizeEach
Contenu et stockage
• Kit de préparation pour bibliothèque ADN PS Collibri sans PCR, conserver à -20°C
• Kit de nettoyage pour bibliothèque d’ADN Collibri, conserver à 4°C
• Index UD ADN Collibri, conserver à -20°C

Foire aux questions (FAQ)

Can indexed adaptors or other modules be purchased separately for the Collibri DNA Library Prep kits?

Indexed adapters and other modules in the kit can be purchased separately. Please refer to thermofisher.com/collibriDNA and contact us for more details.

With the Collibri DNA Library Prep kits, what is the distribution of enzymatically sheared DNA in the library?

Fragment size ranges from 150 bp to 850 bp. For optimal results, we recommend and provide detailed instructions for 350 bp and 550 bp average size library construction.

With the Collibri DNA Library Prep kits, can I use indexed adaptors interchangeably between RNA-seq and DNA-seq applications?

No. They are specifically designed for a product and cannot be used interchangeably.

With the Collibri DNA Library Prep kits, why is my ligation master mix orange instead of red?

Dyes inside the master mix react with CO2 and change the color from red to orange. The mix is still usable when the color changes to orange. To prevent discoloration, avoid keeping it on dry ice.

Are Collibri DNA Library Prep kits compatible with FFPE samples?

Collibri PS DNA Library Prep Kit can be used for library construction from lower-quality DNA (such as FFPE samples). However, the yields of adaptor-ligated molecules are typically lower compared to the yields obtained with high-quality DNA.

Collibri ES DNA Library Prep Kit is not recommended for library construction from FFPE samples.

Citations et références (2)

Citations et références
Abstract
Targeted In Situ Protein Diversification and Intra-organelle Validation in Mammalian Cells.
Authors:Erdogan M, Fabritius A, Basquin J, Griesbeck O
Journal:Cell Chem Biol
PubMed ID:32142629
Engineered proteins must be phenotypically selected for function in the appropriate physiological context. Here, we present a versatile approach that allows generating panels of mammalian cells that express diversified heterologous protein libraries in the cytosol or subcellular compartments under stable conditions and in a single-variant-per-cell manner. To this end we adapt ... More
Effects of Prenatal Phthalate Exposure and Childhood Exercise on Maternal Behaviors in Female Rats at Postpartum: A Role of
Authors:Lee YJ, Lin HT, Chaudhary MA, Lee YC, Wang DC
Journal:Int J Mol Sci
PubMed ID:34576011
Both the detrimental effect of prenatal exposure to di-(2-ethylhexyl)-phthalate (DEHP) and the beneficial effects of physical exercise on brain functions have been reported. The oxytocin pathway has been implicated in the onset of maternal behaviors. Epigenetic modification of the oxytocin receptor gene (OXTR) through DNA methylation has been associated with ... More