Kits de préparation d’échantillons EasyPep™ MS

Citations et références (4)

Thermo Scientific™

Kits de préparation d’échantillons EasyPep™ MS

Name: Kits de préparation d’échantillons EasyPep™ MS
SKU: A45733
Price: 2125.65 EUR

Générez des échantillons protéomiques de haute qualité pour l’analyse MS en moins de quatre heures à l’aide de kits de préparation d’échantillon EasyPep MS optimisés.

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Référence	Description
A45733	Kit de préparation d’échantillons MS
A40006	Kit de préparation d’échantillons Mini MS
A57864	Kit de préparation d’échantillons Micro MS
A45734	Kit de préparation d’échantillons Maxi
A45735	Tampon de lyse
A57865	Plaque de nettoyage des peptides

6 options

Référence A45733

Prix (EUR)

2 125,65

Offre exceptionnelle en ligne

2 415,00

Économisez 289,35 (12%)

Each

Description:

Kit de préparation d’échantillons MS

Prix (EUR)

2 125,65

Offre exceptionnelle en ligne

2 415,00

Économisez 289,35 (12%)

Each

Les kits de préparation d’échantillons EasyPep Mini MS permettent un traitement efficace et reproductible des cellules et tissus de mammifères en culture pour l’analyse MS protéomique. Le kit contient des tampons préformulés, un mélange enzymatique de qualité MS, des colonnes de nettoyage de peptides et un protocole optimisé pour générer des échantillons de peptides compatibles MS en moins de trois heures. Les kits sont optimisés pour traiter des échantillons de protéines de 10 à 100 μg avec un rendement élevé de peptides prêts pour l’analyse MS.

• Complet : comprend des réactifs préformulés pour la lyse par digestion, des colonnes de nettoyage de peptides et un protocole optimisé pour 20 échantillons maximum
• Optimisé : protocole et réactifs simplifiés qui minimisent le nombre d’étapes et le temps nécessaires pour traiter les échantillons
• Flexible : les réactifs et le protocole ont été vérifiés à l’aide de cellules, de plasma et d’échantillons de tissus pour 10 à 100 µg d’échantillons
• Gain de temps : réduction du temps de traitement des échantillons de plus d’un jour à moins de trois heures
• Compatible : la préparation finale est prête pour l’analyse MS directe et d’autres applications en aval, y compris le marquage TMT

La préparation d’échantillons de peptides pour l’analyse MS est complexe, avec de nombreuses étapes et différents protocoles, ce qui engendre une variabilité des échantillons en termes de qualité et de quantité. Ce kit a été conçu pour améliorer la reproductibilité tout en économisant du temps de manipulation et de traitement. Le nombre d’étapes et le temps de traitement ont été réduits grâce à l’ajout de la nucléase universelle pour réduire la viscosité à partir des acides nucléiques (remplacement de la sonication), une solution rapide, dans un seul récipient, de réduction/alkylation pour la modification de la cystéine (carbamidométhylation, + 57,02) et à un mélange de protéase trypsine/Lys-C pour une digestion plus complète. En outre, le kit comprend des colonnes et des tampons de nettoyage Peptide pour préparer des échantillons de peptides sans détergent pour l’analyse MS. Les réactifs et le protocole optimisés produisent des peptides de haute qualité qui sont compatibles avec le marquage TMT et d’autres applications en aval, ou sont prêts pour l’analyse MS.

For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.

Spécifications

DescriptionKit de préparation d’échantillons MS

Type de produit finalpeptides

À utiliser avec (équipement)Spectromètre de masse

Marqueur ou colorantNon marqué

Quantité96 réactions

Conditions d’expéditionGlace

Étape du flux de travailDigestion des protéines

Méthode de détectionSpectrométrie de masse

FormatKit

Gamme de produitsEasyPep

Type de produitKit de préparation des échantillons

Matériau de départÉchantillons de protéines

Unit SizeEach

Contenu et stockage

Solution de lyse, 25 ml, stocker à 4°C.
Nucléase universelle, 25 kU, stocker à -20°°C.
Solution de réduction, 7 ml, stocker à 4°C.
Solution d’alkylation, 7 ml, stocker à 4°C.
Solution de reconstitution enzymatique, 7 ml, stocker à 4°°C.
Mélange de protéases Trypsine/Lys-C Pierce, qualité MS, 5 x 100 µg, stocker à -20°°C.
Solution d’arrêt de digestion, 7 ml, stocker à 4°C.
Plaque de nettoyage de peptides, 1 chaque, stocker à 4°C
Plaque de lavage et d’élution, 1 chaque, stocker à 4°C
Plaque de préparation d’échantillon, 1 chaque, stocker à 4°C.
Solution de lavage A, 40 ml, conserver à 4°°C.
Solution de lavage B, 3 x 27 ml, stocker à 4°°C.
Solution d’élution, 2 x 20 ml, stocker à 4°C.

Foire aux questions (FAQ)

Are the EasyPep MS Sample Prep Kits compatible with vacuum pumps/dry-down devices?

As per protocol, peptide samples need to be dried down prior to LC-MS analysis. This step can be performed using vacuum pumps/dry-down devices without any harm caused to the device by the components present in the elution buffer within the EasyPep MS Sample Prep Kits.

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I have a lot of plasma samples to prepare for mass spectrometry analysis. Is there a way to perform abundant protein depletion in a 96-well plate?

The bulk Top14 depletion resin is compatible with a 96-well filter plate such as the Agilent filter microplate (Cat. No. 200957-100). Add 600 µL of resin slurry (50%) to each of the wells in the 96-well filter plate, add 10-20 µL of sample, and incubate with gentle shaking. Depleted samples can be collected in a new 96-well polypropylene plate by centrifugation for 2 mins at 1,000 x g or by using a vacuum manifold.

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After cell lysis, my mass spectrometry sample is very viscous and difficult to pipette. How do I reduce the sample viscosity?

High sample viscosity after lysis is due to release of DNA from the nucleus. Sonication or addition of a nuclease such as the Pierce Universal Nuclease (Cat. No. 88700, 88701, or 88702) can be used to degrade DNA and reduce sample viscosity.

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How do I process yeast samples with EasyPep Mini MS Sample prep Kit?

Add 0.5 mm diameter glass beads to the sample pelleted in Easy Pep Lysis Solution and proceed as recommended in the Easy Pep sample prep protocol. Vortex vigorously for few minutes, spin at 16,000 x g for 5 mins, and extract the supernatant for protein assay and further downstream sample preparation.

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How do I process bacterial samples with EasyPep MS Sample Prep kits?

Add 1-2 µL of 50 mg/mL Lysozyme Solution (Cat. No. 90082) to 200 µL of the EasyPep lysis buffer provided in the kit and proceed with the sample prep. Add 200 µL of the prepared lysis solution to 5 X 10E8 bacterial cells (E. coli cells) (OD600 equal to 1, corresponding to 1 X 10E8 CFUs). Lyse by pipetting the sample repeatedly and centrifuge at 16,000 x g for 5 mins. Alternatively, E. coli cells can be lysed in lysis buffer using bead beating or sonication instead of lysozyme. After lysis, dilute samples to 1 mg/mL using lysis buffer, proceed with the EasyPep protocol for reduction, alkylation, digestion, and clean up as described in the product manual.

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Citations et références (4)

Citations et références

Abstract

Discovery of Orally Available and Brain Penetrant AEP Inhibitors.

Authors:Krummenacher D,He W,Kuhn B,Schnider C,Beurier A,Brom V,Sivasothy T,Marty C,Tosstorff A,Hewings DS,Mesch S,Pinard E,Brändlin M,Hochstrasser R,Westwood P,Rothe J,Kronenberger A,Morandi F,Gutbier S,Schuler A,Heer D,Gloria LE,Joedicke L,Rudolph MG,Müller L,Grüninger F,Baumann K,Kaniyappan S,Manevski N,Bartels B

Journal:Journal of medicinal chemistry

PubMed ID:38090813

Alzheimer's Disease (AD) is the most widespread form of dementia, with one of the pathological hallmarks being the formation of neurofibrillary tangles (NFTs). These tangles consist of phosphorylated Tau fragments. Asparagine endopeptidase (AEP) is a key Tau cleaving enzyme that generates aggregation-prone Tau fragments. Inhibition of AEP to reduce the ... More

Development of a First-in-Class RIPK1 Degrader to Enhance Antitumor Immunity.

Authors:Wang J,Lu D,Yu X,Qi X,Lin H,Holloman BL,Jin F,Xu L,Ding L,Peng W,Wang M,Chen X

Journal:Research square

PubMed ID:38659866

The scaffolding function of receptor interacting protein kinase 1 (RIPK1) confers intrinsic and extrinsic resistance to immune checkpoint blockades (ICBs) and has emerged as a promising target for improving cancer immunotherapies. To address the challenge posed by a poorly defined binding pocket within the intermediate domain, we harnessed proteolysis targeting ... More

Proteomic Characterization of Transfusable Blood Components: Fresh Frozen Plasma, Cryoprecipitate, and Derived Extracellular Vesicles via Data-Independent Mass Spectrometry.

Authors:Hwang JH,Lai A,Tung JP,Harkin DG,Flower RL,Pecheniuk NM

Journal:Journal of proteome research

PubMed ID:39254217

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Authors:Zhao XZ,Barakat IA,Lountos GT,Wang W,Agama K,Mahmud MRA,Suazo KF,Andresson T,Pommier Y,Burke TR Jr

Journal:Communications chemistry

PubMed ID:39284936

Developing effective inhibitors of the DNA repair enzyme tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1) has been challenging because of the enzyme shallow catalytic pocket and non-specific substrate binding interactions. Recently, we discovered a quinolone-binding hot spot in TDP1's active site proximal to the evolutionary conserved Y204 and F259 residues that position DNA. ... More