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Kit d’isolement de transcriptome RiboMinus™ Bacteria 2.0
Déplétion très efficace de l’ARNr 16S, 23S et 5S d’une variété d’espèces Le kit d’isolement de transcriptomes RiboMinus Bacteria 2.0Afficher plus
| Référence | Quantité |
|---|---|
| A47335 | 12 réactions |
Référence A47335
Prix (EUR)
1 186,00
Each
Quantité:
12 réactions
Prix (EUR)
1 186,00
Each
Déplétion très efficace de l’ARNr 16S, 23S et 5S d’une variété d’espèces
Le kit d’isolement de transcriptomes RiboMinus Bacteria 2.0 est un kit complet et automatisable qui permet d’éliminer efficacement et sélectivement l’ARN ribosomique bactérien et archaebactérien (ARNr) de l’ARN total intact (100 ng à 5 μg) en moins de deux heures.
Principales caractéristiques du kit RiboMinus Bacteria 2.0 :
• Efficace : le mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote inclus a constamment présenté moins de 10 % de lectures par rapport aux lectures d’ARNr 16S et 23S
• . Large gamme de cibles : conçu avec >150 sondes qui visent des cibles d’ARNr 16S, 23S et 5S provenant de >76 espèces représentatives de bactéries et d’archaebactéries issues de phyla et de sous-phyla commun
• Pratique : Microbilles magnétiques de streptavidine C1 Dynabeads MyOne et module et protocoles de nettoyage par microbilles inclus pour les instruments KingFisher
• Flexible : peut accepter des poids de 100 ng à 5 µg d’ARN total ; fonctionne avec une large gamme d’échantillons d’ARN total avec des valeurs RIN de 5,0 à 10,0
• Grande sensibilité de détection : permet d’augmenter le nombre de cartographies de lectures de séquençage par rapport aux transcripts de codage de protéines, en comparaison avec la version précédente
• Convient aux études métatranscriptomiques : déplétion de l’ARNr de nombreuses espèces microbiennes dans les échantillons métagénomiques
Ciblez l’ARNr à partir d’un vaste éventail de bactéries et de archaebactéries
Le kit RiboMinus Bacteria 2.0 repose sur la technologie de capture par hybridation et inclut un nouveau mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote, qui permet de diviser par 4 les lectures ribosomiques restantes et présente une amélioration significative par rapport au mélange de sondes bactériennes précédent. Le nouveau mélange de sondes comprend plus de 150 oligonucléotides d’ADNsb marqués à la 3’-biotine. Ces oligonucléotides ont été créés à l’aide de zones extrêmement protégées d’ARNr chez 76 espèces de pan-procaryotes (voir tableau ci-dessous) et testés avec plusieurs espèces (voir liste de compatibilité ci-dessous).
Kit de nettoyage par microbilles de streptavidine C1 Dynabeads MyOne inclus
Une fois que le mélange de sondes s’est hybridé de manière sélective par rapport aux transcrits d’ARNr cible, l’élimination du complexe sonde-ARNr est réalisée par capture sur des microbilles magnétiques de streptavidine C1 Dynabeads MyOne, laissant derrière l’ARN appauvri en ARNr. Le kit RiboMinus Bacteria 2.0 inclut un module de nettoyage par microbilles magnétiques destiné à la concentration de l’ARN appauvri en ARNr, qui permet de simplifier la manipulation, l’évolutivité et l’automatisation sur les instruments KingFisher. L’ARN appauvri en ARNr qui en résulte (ARN RiboMinus) convient aux analyses de transcriptomes entiers par séquençage de l’ARN ou à d’autres applications en aval.
Compatibilité
Le mélange de sondes Pan-Procaryote RiboMinus s’est avéré compatible avec les espèces testées suivantes :
Acinetobacter baumannii
Bacteroides thetaiotaomicron
Bifidobacterium longum subsp. infantis.
Campylobacter jejuni
Clostridioides difficile
Escherichia coli
Fusobacterium nucleatum
Helicobacter pylori
Janthinobacterium sp.
Moorella thermoacetica
Pseudomonas putida
Rickettsia rickettsia
Salmonella typhimurium
Pseudomonas aeruginosa
Salmonella enterica
Staphylococcus aureus
Thermoanaerobacter kivui
Vibrio cholerae
Vibrio fisheri
Le mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote s’est avéré compatible avec les espèces suivantes sur la base d’une homologie de séquence :
Corynebacterium
Enterococcus faecalis
Gluconobacter
Myxococcus xanthus
Streptomyces coelicoflavus
Le kit d’isolement de transcriptomes RiboMinus Bacteria 2.0 est un kit complet et automatisable qui permet d’éliminer efficacement et sélectivement l’ARN ribosomique bactérien et archaebactérien (ARNr) de l’ARN total intact (100 ng à 5 μg) en moins de deux heures.
Principales caractéristiques du kit RiboMinus Bacteria 2.0 :
• Efficace : le mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote inclus a constamment présenté moins de 10 % de lectures par rapport aux lectures d’ARNr 16S et 23S
• . Large gamme de cibles : conçu avec >150 sondes qui visent des cibles d’ARNr 16S, 23S et 5S provenant de >76 espèces représentatives de bactéries et d’archaebactéries issues de phyla et de sous-phyla commun
• Pratique : Microbilles magnétiques de streptavidine C1 Dynabeads MyOne et module et protocoles de nettoyage par microbilles inclus pour les instruments KingFisher
• Flexible : peut accepter des poids de 100 ng à 5 µg d’ARN total ; fonctionne avec une large gamme d’échantillons d’ARN total avec des valeurs RIN de 5,0 à 10,0
• Grande sensibilité de détection : permet d’augmenter le nombre de cartographies de lectures de séquençage par rapport aux transcripts de codage de protéines, en comparaison avec la version précédente
• Convient aux études métatranscriptomiques : déplétion de l’ARNr de nombreuses espèces microbiennes dans les échantillons métagénomiques
Ciblez l’ARNr à partir d’un vaste éventail de bactéries et de archaebactéries
Le kit RiboMinus Bacteria 2.0 repose sur la technologie de capture par hybridation et inclut un nouveau mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote, qui permet de diviser par 4 les lectures ribosomiques restantes et présente une amélioration significative par rapport au mélange de sondes bactériennes précédent. Le nouveau mélange de sondes comprend plus de 150 oligonucléotides d’ADNsb marqués à la 3’-biotine. Ces oligonucléotides ont été créés à l’aide de zones extrêmement protégées d’ARNr chez 76 espèces de pan-procaryotes (voir tableau ci-dessous) et testés avec plusieurs espèces (voir liste de compatibilité ci-dessous).
Kit de nettoyage par microbilles de streptavidine C1 Dynabeads MyOne inclus
Une fois que le mélange de sondes s’est hybridé de manière sélective par rapport aux transcrits d’ARNr cible, l’élimination du complexe sonde-ARNr est réalisée par capture sur des microbilles magnétiques de streptavidine C1 Dynabeads MyOne, laissant derrière l’ARN appauvri en ARNr. Le kit RiboMinus Bacteria 2.0 inclut un module de nettoyage par microbilles magnétiques destiné à la concentration de l’ARN appauvri en ARNr, qui permet de simplifier la manipulation, l’évolutivité et l’automatisation sur les instruments KingFisher. L’ARN appauvri en ARNr qui en résulte (ARN RiboMinus) convient aux analyses de transcriptomes entiers par séquençage de l’ARN ou à d’autres applications en aval.
Compatibilité
Le mélange de sondes Pan-Procaryote RiboMinus s’est avéré compatible avec les espèces testées suivantes :
Acinetobacter baumannii
Bacteroides thetaiotaomicron
Bifidobacterium longum subsp. infantis.
Campylobacter jejuni
Clostridioides difficile
Escherichia coli
Fusobacterium nucleatum
Helicobacter pylori
Janthinobacterium sp.
Moorella thermoacetica
Pseudomonas putida
Rickettsia rickettsia
Salmonella typhimurium
Pseudomonas aeruginosa
Salmonella enterica
Staphylococcus aureus
Thermoanaerobacter kivui
Vibrio cholerae
Vibrio fisheri
Le mélange de sondes RiboMinus Pan-Prokaryote s’est avéré compatible avec les espèces suivantes sur la base d’une homologie de séquence :
Corynebacterium
Enterococcus faecalis
Gluconobacter
Myxococcus xanthus
Streptomyces coelicoflavus
Usage exclusivement réservé à la recherche.Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Type de produit finalARN du transcriptome
À utiliser avec (application)Séquençage de nouvelle génération, analyses microarray, PCR quantitative en temps réel (qPCR), PCR par transcriptase inverse (RT-PCR), construction de bibliothèques d’ADNc
FormeMicrobille magnétique
Compatibilité à haut débitNon compatible avec des cadences élevées (manuel)
Nbre de réactions12 reactions
Gamme de produitsRiboMinus
Quantité12 réactions
Quantité de matériel de démarrage100 ng à 5 µg d’ARN total
Type de systèmeRiboMinus
Isolation TechnologyMicrobille magnétique
Type d’échantillonARN total (bactérien)
TargetARN du transcriptome
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Les kits d’isolement de RiboMinus comprennent des microbilles magnétiques RiboMinus, des bactéries, des sondes à levures et des tampons d’hybridation RiboMinus humain/souris, des bactéries ou sonde à levure et tampon d’hybridation. Le module de concentration RiboMinus en option contient des cartouches de centrifugation, des tubes de lavage, des tubes de récupération, du tampon de liaison, du tampon de lavage et de l’eau exempte de RNase (traitée au DEPC). Conserver les modules d’isolement à +4°C et le module de concentration à température ambiante. La stabilité de tous les réactifs est garantie pendant 6 mois, sous réserve d’un stockage correct.