Le SNAP-ChIP (normalisation de l’échantillon et immunoprécipitation de la chromatine de profilage des anticorps) est une technologie exclusive produite par EpiCypher. Elle s’appuie sur des nucléosomes semi-synthétiques avec des codes-barres d’ADN portant des mutations histoniques distinctes comme contrôles spike-in ChIP.

• Étalons homogènes entièrement définis représentant fidèlement les mononucléosomes cibles dans l’échantillon expérimental
• Nucléosomes soumis à un contrôle qualité rigoureux pour assurer la cohérence entre les lots
• Codes-barres d’ADN uniques pouvant être distingués des génomes d’échantillons expérimentaux
• Spike-ins permettant de lire directement les performances des anticorps par ChIP
• Possibilité de surveiller la variabilité technique entre les échantillons
• Normes définies permettant une normalisation universelle de l’ensemble des expériences

Les panneaux SNAP-ChIP sont directement compatibles avec votre flux de travail actuel ChIP, avec des nucléosomes semi-synthétiques portant des mutations d’intérêt immunoprécipitées et traitées avec de la chromatine d’échantillon.

Les utilisateurs peuvent surveiller directement les capacités des anticorps (spécificité et enrichissement) lors d’une expérience ChIP en mesurant la récupération des nucléosomes sur et en dehors des cibles. Les spike-ins SNAP peuvent également être utilisés comme norme définie afin de normaliser vos données ChIP et de pouvoir contrôler la variabilité technique entre les expériences.

Le panneau OncoStat est constitué d’un pool de nucléosomes comportant sept marques bien étudiées de mutations histoniques H3.3 impliquées dans le cancer (histones H3.3K4M, H3.3K9M, H3.3K27M, H3.3G34R, H3.3G34V, H3.3G34W et H3.3K36M) et un contrôle H3.3 de type sauvage. Par ailleurs, ces huit nucléosomes sont tous enveloppés par deux codes-barres d’ADN indépendants (panneau contenant 16 codes-barres en tout), ce qui permet de réaliser une réplication technique interne durant chaque réaction ChIP. Un seul spike-in du panneau permet aux utilisateurs de vérifier la spécificité des anticorps en examinant la récupération post-IP des nucléosomes SNAP-ChIP sur et en dehors de la cible, ce qui permet ainsi de prendre en charge la génération de données ChIP de haute qualité.