Logiciel SimGlycan™

Accélérez la caractérisation des glycanes complexes à l’aide du logiciel SimGlycan™ de PREMIER Biosoft. Le logiciel SimGlycan traite et interprète les données multi-étapes/séquentielles (MSⁿ) produites par les spectromètres de masse Thermo Scientific™, une spécificité essentielle pour déterminer l’hétérogénéité et les formes isomériques des glycanes. Le logiciel fait automatiquement correspondre les spectres de masse expérimentaux à une base de données complète et produit une liste classée de structures candidates. Les informations les plus pertinentes à propos de la structure proposée, y compris la classe de glycanes, la voie et l’enzyme, sont fournies par le biais de liens interactifs.

• Prend en charge toutes les trappes d’ions Thermo Scientific et les instruments à technologie Orbitrap™ effectuant la caractérisation des glycanes
• Traite les données MSⁿ pour résoudre l’hétérogénéité des glycanes, les schémas de ramification et les structures isobares. Jusqu’à sept niveaux de fragmentation MS peuvent être nécessaires pour différencier les isomères structurels des glycanes
• Comprend une base de données de plus 22 500 glycanes pour traiter et vérifier les structures
• Fournit une mine d’informations biologiques pertinentes pour la structure de glycane probable, notamment la classe de glycane, la réaction, la voie et l’enzyme
• Recherche des glycanes avec divers dérivés chimiques utilisés pour la réduction des modifications d’extrémité, même si le dérivé n’est pas disponible dans la base de données
• Caractérise les adduits Na, Li, Mg, K et formiate et les combinaisons d’adduits telles que Na + H, Li + H, etc.
• Identifie les structures glycosaminoglycanes complexes, même lorsqu’elles sont modifiées par des substituants tels que le sulfate, le phosphate et l’éthanolamine
• Détermine les clivages en anneaux croisés et glycosidiques doubles par le biais d’une combinaison de dérivation au perméthyle et de données MSⁿ

• Crée des rapports incluant des caractéristiques des glycanes telles que l’ID, la séquence, le nom, la composition, la masse, la valeur de m/z des ions précurseurs, la classe, la réaction, la voie, l’image glycane et les fragments théoriques avec masse et valeurs de m/z correspondantes
• Exporte des images des structures, des fragments et des spectres de glycanes sous forme de fichiers JPEG ou PNG