Kit TOPO™ TA Cloning™ pour séquençage, avec E. coli chimiquement compétent One Shot™ TOP10
Kit TOPO&trade; TA Cloning&trade; pour séquençage, avec <i>E. coli</i> chimiquement compétent One Shot&trade; TOP10
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Kit TOPO™ TA Cloning™ pour séquençage, avec E. coli chimiquement compétent One Shot™ TOP10

Les kits de séquençage TOPO™ TA Cloning™ offrent une stratégie de clonage en une seule étape, en 5 minutes etAfficher plus
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Les kits de séquençage TOPO™ TA Cloning™ offrent une stratégie de clonage en une seule étape, en 5 minutes et très efficace (“clonage TOPO™”) pour l’insertion directe de produits PCR amplifiés par polymérase Taq dans un vecteur plasmidique à des fins de séquençage. Chaque kit utilise le vecteur pCR4-TOPO™ TA avec des sites d’amorce de séquençage spécifiquement conçus, qui permettent, pour chaque réaction, d’augmenter la séquence d’insert et de réduire celle de vecteur. Selon vos besoins et votre budget, ces kits peuvent comporter tout un éventail de cellules compétentes, ou aucune de ces cellules. Ces kits incluent tout ce dont vous avez besoin pour cloner et sélectionner les vecteurs recombinants contenant le fragment de PCR de votre choix. Caractéristiques des kits de séquençage TOPO™ TA Cloning™ :

Augmentation des séquences—permet d’augmenter la séquence d’insert et de réduire celle du vecteur lors de l’utilisation d’amorces de séquençage standard
Simplicité et rapidité—passez de la PCR aux clones en 3 étapes en un temps de manipulation inférieur à 5 minutes
Efficacité—obtenez jusqu’à 95 % de clones avec le bon insert
Résultats prouvés—performances fiables pendant plus d’une décennie avec plus de 4 000 citations

Kits de séquençage TOPO™ TA Cloning™—Présentation

Vecteur : vecteur TA pCR4-TOPO™—Vecteur de clonage optimisé pour des résultats de séquençage améliorés

Méthode de clonage : TOPO™ TA Cloning™ —topoisomérase – I, ligature en, 5 minutes des produits PCR avec des saillies de 3´A (amplification Taq) sur le vecteur

Cellules compétentes : Plusieurs options—faites votre choix parmi les kits qui proposent des cellules compétentes générales, à efficacité élevée, résistantes au bactériophage T1 ou à croissance rapide, ou utilisez votre propre

vecteur TA pCR™4-TOPO™optimisé pour le séquençage
Nous avons éliminé la majeure partie du site de clonage multiple du vecteur TA pCR™4-TOPO™ pour raccourcir la distance entre les sites d’amorce de séquençage et le site d’insertion à une valeur aussi faible que 33 bp. Résultat : les réactions de séquençage diminuent la séquence de vecteur et augmentent celle de l’insertion. Le vecteur TA pCR4-TOPO™ comprend des sites pour 4 amorces de séquençage communes : M13 direct, M13 inverse, T7 et T3. Les kits incluent une aliquote de chaque.

Sélection et manipulation de clones TA pCR™4-TOPO™
Le vecteur TA pCR™4-TOPO™ contient à la fois des Marquages de résistance à l’ampicilline et à la kanamycine et une fusion de gènes LacZα-ccdB pour une sélection positive et une sélection bleu/blanc. Le site de clonage multiple minimisé du vecteur inclut toujours des sites EcoRI de flanquement pour l’excision simplifiée des produits de PCR clonés et un site Sse8387I unique pour la génération des suppressions imbriquées avant le séquençage. Les promoteurs T7 et T3 sont également présents pour la transcription in vitro.

Clonage simplifié basé sur TOPO™
Grâce à la technologie de clonage TOPO™, il n’est pas nécessaire d’utiliser des amorces pour PCR contenant des séquences spécifiques ou des procédures post-PCR, de préparer les vecteurs ni d’effectuer d’autres étapes de manipulation longues d’ADN. Il suffit d’ajouter votre réaction PCR directement dans le vecteur chargé en topoisomérase, d’incuber pendant 5 minutes et de la transformer avec les cellules compétentes E. coli fournies.

Clonage efficace
Avec jusqu’à 95 % de clones porteurs de l’insert désiré, vous n’avez plus besoin d’analyser autant de clones, ce qui vous permet de gagner du temps et de l’argent. Le vecteur TA pCR™4-TOPO™ utilisé dans ce kit est livré avec des saillies de 3´T pour une ligature efficace des produits PCR amplifiés Taq, qui contient des saillies de 3´A.

La norme du clonage
En matière de clonage, la technologie de clonage TOPO™ est un partenaire fiable pour des milliers de scientifiques depuis plus de dix ans. Rapide, simple à utiliser et efficace, le clonage TOPO™ a été appliqué à de nombreux vecteurs différents pour un large éventail d’applications.

Kits TOPO™ TA Cloning™ pour séquençage—options de kit
Le kit de séquençage TOPO™ TA Cloning™ peut être acheté avec une variété de cellules compétentes offrant différents avantages selon vos besoins :

• Clonage général : TOP10 (No de catalogue K4575-J10, K4575-01, K4575-40)
• Clonage haute efficacité : Cellules ™ TOP10 Electrocomp (No de catalogue K4580-01, K4580-40)
• Clonage général, résistance aux bactériophages T1 : DH5α-T1R (No de catalogue K4595-01, K4595-40)
• Croissance rapide : Mach1™-T1R chimiquement compétente E. Coli (No de catalogue K4530-20)
• Fournissez le vôtre : pour une souplesse et des économies accrues (réf. nº 450030)

Nous proposons également une version du kit qui inclut un kit de minipréparation d’ADN plasmidique rapide PureLink™ (réf. K4575-02) à utiliser pour l’isolement de plasmide recombinant propre et prêt pour le séquençage.

Liens connexes

Services de construction et de clonage de vecteurs personnalisés
Guide de sélection du kit de purification d’ADN plasmidique
Réactifs, instruments et fournitures PCR
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
Souche bactérienne ou de levuresTOP10
Type de celluleChimiquement compétent
Méthode de clonageTOPO™-TA
À utiliser avec (application)Biologie de la chromatine
Gamme de produitsOne Shot
Type de produitKit de clonage
Quantité50 réactions
VecteurVecteurs de clonage TOPO-TA
FormatKit
AccélérateurT7, T3
Unit SizeEach
Contenu et stockage
Boîte 1 :
• Vecteur pCR4-TOPO™ activé par topoisomérase I
• Tampon PCR
• Solution saline
• dNTPs
• Modèle de contrôle
• Amorces directes T3, T7, M13 et inversées M13
• amorces pour PCR de contrôle
• Eau stérile

Stockez de -5 à -30°C.
Tous les réactifs sont stables pendant 6 mois lorsqu’ils sont correctement stockés.

Encadré 2 :
• Cellules d’E. coli chimiquement compétentes One Shot™ ou Electrocomp™
• Milieu S.O.C.
• Plasmide de contrôle pUC19 superenroulé

Stockez entre -68 et -85°C.

Foire aux questions (FAQ)

Can I store my competent E. coli in liquid nitrogen?

We do not recommend storing competent E. coli strains in liquid nitrogen as the extreme temperature can be harmful to the cells. Also, the plastic storage vials are not intended to withstand the extreme temperature and may crack or break.

How should I store my competent E. coli?

We recommend storing our competent E. coli strains at -80°C. Storage at warmer temperatures, even for a brief period of time, will significantly decrease transformation efficiency.

What is the best molar ratio of PCR product:vector to use for TOPO TA cloning? Is there an equation to calculate the quantity to use?

We suggest starting with a molar ratio of 1:1 (insert:vector), with a range of 0.5:1 to 2:1. The quantity used in a TOPO cloning reaction is typically 5-10 ng of a 2 kb PCR product.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 (insert:vector ratio)

What is the best ratio of insert:vector to use for cloning? Is there an equation to calculate this?

The optimal ratio is 1:1 insert to vector. Optimization can be done using a ratio of 0.5-2 molecules of insert for every molecule of the vector.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio

Does Platinum Taq DNA Polymerase High Fidelity enzyme mix leave 3' A-overhangs on the PCR product for subsequent cloning into a TOPO TA or original TA vector?

Yes, the enzyme mix leaves 3' A-overhangs on a portion of the PCR products. However, the cloning efficiency is greatly decreased compared to that obtained with Taq polymerase alone. It is recommended to add 3' A-overhangs to the product for TA cloning.

Citations et références (5)

Citations et références
Abstract
Molecular cloning and characterization of Foxp3 in Atlantic salmon (Salmo salar).
Authors:Zhang Z, Chi H, Niu C, Bøgwald J, Dalmo RA,
Journal:Fish Shellfish Immunol
PubMed ID:21276855
'Foxp3 is a T cell-specific transcription factor and plays a key role in the development of Treg cells and in the immune regulatory process during inflammation. Here we report cloning and characterization of the full-length cDNA of Atlantic salmon Foxp3, which possesses a Forkhead domain, a zinc finger domain and ... More
Detection of cytosine methylation in RNA using bisulfite sequencing.
Authors:Pollex T, Hanna K, Schaefer M
Journal:Cold Spring Harb Protoc
PubMed ID:20889702
'Post-transcriptional RNA modifications are a characteristic feature of noncoding RNAs and have been described for ribosomal RNAs (rRNAs), transfer RNAs (tRNAs), and various other small RNAs. However, the biological function of most of these modifications remains uncharacterized. Cytosine-5 methylation (5mC) has been detected in abundant and long-lived RNA molecules such ... More
Unique DNA methylome profiles in CpG island methylator phenotype colon cancers.
Authors:Xu Y, Hu B, Choi AJ, Gopalan B, Lee BH, Kalady MF, Church JM, Ting AH
Journal:Genome Res
PubMed ID:21990380
'A subset of colorectal cancers was postulated to have the CpG island methylator phenotype (CIMP), a higher propensity for CpG island DNA methylation. The validity of CIMP, its molecular basis, and its prognostic value remain highly controversial. Using MBD-isolated genome sequencing, we mapped and compared genome-wide DNA methylation profiles of ... More
Gene characterized for membrane desaturase that produces (E)-11 isomers of mono- and diunsaturated fatty acids.
Authors: Liu Weitian; Jiao Hongmei; Murray Nancy C; O'Connor Marion; Roelofs Wendell L;
Journal:Proc Natl Acad Sci U S A
PubMed ID:11805319
Moth species have evolved integral membrane desaturases that exhibit a wide diversity in substrate specificity, as well as in regiospecificity and stereospecificity of the unsaturated products. We report here the cloning and expression of a single desaturase from the sex pheromone gland of the light brown apple moth, Epiphyas postvittana, ... More
Genome and transcriptome sequencing of lung cancers reveal diverse mutational and splicing events.
Authors:Liu J, Lee W, Jiang Z, Chen Z, Jhunjhunwala S, Haverty PM, Gnad F, Guan Y, Gilbert HN, Stinson J, Klijn C, Guillory J, Bhatt D, Vartanian S, Walter K, Chan J, Holcomb T, Dijkgraaf P, Johnson S, Koeman J, Minna JD, Gazdar AF, Stern HM, Hoeflich KP, Wu TD, Settleman J, de Sauvage FJ, Gentleman RC, Neve RM, Stokoe D, Modrusan Z, Seshagiri S, Shames DS, Zhang Z
Journal:Genome Res
PubMed ID:23033341
Lung cancer is a highly heterogeneous disease in terms of both underlying genetic lesions and response to therapeutic treatments. We performed deep whole-genome sequencing and transcriptome sequencing on 19 lung cancer cell lines and three lung tumor/normal pairs. Overall, our data show that cell line models exhibit similar mutation spectra ... More