Logiciel ProSightPD

Effectuez une analyse complète des données protéomiques top down grâce au logiciel Thermo Scientific™ ProSightPD™. ProSightPD est doté de moteurs de recherche protéomique robustes pour la caractérisation des protéoformes, y compris les protéoformes avec des PTM ou des troncatures. Le logiciel ProSightPD prend en charge les données protéomiques générées par les techniques de fragmentation présentes dans tous les spectromètres de masse Thermo Scientific. Le logiciel ProSightPD est le seul logiciel de protéomique qui permet à l’utilisateur de rechercher des données MS / MS dans des bases de données de protéomes avec la complexité biologique d’UniProt.

• Comprend cinq modes de recherche de base de données différents : marquage de séquence, protéine unique et restriction de gène pour une caractérisation exceptionnelle de protéines intactes.
• Effectue des calculs de taux de faux positifs au niveau des protéines, des isoformes, des protéoformes et des succès protéoformes.
• Traite de nombreux types de données de fragmentation, y compris les données générées à l’aide d’ETD, HCD, EThcD, UVPD, ECD, IRMPD, ou CID.
• Permet la fusion de cartes de fragments graphiques, même ceux avec différents types d’ions.
• Comprend la base exclusive ProSight contenant toutes les modifications post-traductionnelles (PTM), les épissages alternatifs et les polymorphismes à simple nucléotide (SNP).
• Permet une analyse de masse des précurseurs plus robuste, avec les données FAIMS et PTR maintenant facilement analysable grâce au logiciel ProSightPD. Les données à haute et basse résolution peuvent être traitées avec les algorithmes Xtract et ReSpect intégrés dans le logiciel ProSightPD, ce qui permet l’analyse des masses d’une large gamme de masses (∼ 1 kDa à > 150 kDa).
• Importe les bases de données XML et FASTA et les annote “par shotgun” avec toutes les modifications possibles.
• Permet aux utilisateurs de bénéficier d’une visualisation exceptionnelle et modulable pour analyser les résultats de recherche et personnaliser les modifications afin de trouver des résultats plus pertinents.