QuantiGene™ Plex Human Virus-Host Panel, 50-plex

Le panneau virus humain-hôte QuantiGene Plex est un panneau de 50 plex axé sur les cibles d’ARN adapté à la biologie des infections respiratoires chez l’homme et comprend des cibles liées à la réaction immunitaire, au processus d’infection virale, au choc cytokinique, aux ARN viraux (SARS-CoV-2, grippe, virus respiratoire syncytial / VRS), et plus encore. Ce panneau a été vérifié de façon fonctionnelle. Si aucune cible d’intérêt particulière n’est incluse, un panneau personnalisé peut être conçu. Chaque panneau neuf et personnalisé est conçu, construit, validé et livré dans les trois semaines suivant votre commande. Ce panneau est utilisé en association avec le kit de dosage QuantiGene Plex, qui contient tous les tampons, plaques et réactifs de détection nécessaires pour effectuer le dosage dans des plaques à 96 ou 384 puits.

Les caractéristiques du panneau virus humain-hôte QuantiGene Plex sont les suivantes :
• Véritable multiplexage : mesure 50 gènes d’intérêt et gènes domestiques dans le même puits sans réactivité croisée
• Réception de types d’échantillons difficiles : fonctionnent avec de l’ARN dégradé et réticulé dans les tissus FFPE et du sang
• Plateforme standardisée : utilise des formats de plaque à 96 ou 384 puits compatibles avec Luminex 200, MagPix et les systèmes FlexMap3D
• Flux de travaux simples : utilise un flux de travaux de type ELISA avec hybridation directe des transcrits vers l’étiquetage des microbilles et des transcrits
• Large inventaire de cibles validées : si des cibles supplémentaires doivent être ajoutées à ce panneau, sélectionnez des gènes parmi plus de 22 000 gènes pour créer des panneaux de voies et pathologiques
• Réorientation rapide pour panneaux personnalisés : si nous n’avons pas votre (vos) gène(s), nous pouvons créer un panneau personnalisé en trois semaines

Les dosages QuantiGene Plex sont des dosages basés sur l’hybridation pour la quantification directe de l’ARN directement à partir de lysats cellulaires, d’homogénats tissulaires ou d’ARN purifié, et ils permettent la mesure de plusieurs cibles dans le même puits à l’aide du multiplexage. Les dosages QuantiGene Plex contiennent deux composants : un ensemble de sondes spécifiques à la cible et des microbilles de capture magnétiques. Ils utilisent les sondes spécifiques à la cible pour capturer l’ARN d’intérêt et la technologie d’analyse de l’ADN ramifié amplifie ensuite les signaux fluorescents qui sont lus avec un instrument Luminex xMAP.

Cibles : sonde Pan SARS-CoV-2 (orf1ab, glycoprotéine membraneuse, nucléocapside), ORF3a, ORF7a, ORF8, RdRP/NSP12, protéine S, TMPRSS2, ACE2, AT2, NF-κB, DPP4 (CD26), protéine d’enveloppe, sonde Pan de la grippe, sonde Pan RSV, CD4, CD8a, HLA-DR, CD38, CD25, CD14, CD19, RORc, TBX21, GATA3, NCAM1 (CD56), CD11d, IFITM1, CCL2 (MCP-1), CCL3 (MIP-1a), IFNg, Il12A, IL6, IL8a, IL1b, IFNa, Il10, IL2, TNFa, IL4, granzyme B, IL18, IP10 (CXCL10), GM-CSF, IL17A (CTLA8), VEGF-A, GAPDH, GUSB, HPRT1, PPIB, RPL13A

Technologie
Les dosages QuantiGene Plex utilisent la technologie de l’ADN ramifié (ADNb). Premièrement, les cellules (ou le sang) sont lysées ou des échantillons de tissus (y compris le FFPE) sont homogénéisés pour libérer l’ARN cible. Deuxièmement, le jeu de sondes oligonucléotides est incubé avec le jeu de microbilles d’ARN cible et xMAP Luminex pendant une nuit. Pendant cette incubation, les sondes s’hybrident avec la cible et capturent les sondes liées à chaque microbille, afin de capturer l’ARN cible. Enfin, l’amplification du signal est réalisée par hybridation séquentielle des molécules du préamplificateur d’ADNb, de l’amplificateur et de la sonde d’étiquetage à la cible. L’ajout de streptavidine-phycoérythrine génère un signal luminescent directement proportionnel à la quantité d’ARNm cible présente dans l’échantillon. Cela permet l’évaluation quantitative (relative) de l’expression génétique. Ce panneau spécifique permet l’étude des processus d’infection virale, du profil immunitaire humain (hôte), des biomarqueurs de choc cytokinique, de la présence de SARS-CoV-2 et de sélectionner des souches de grippe et de RSV.

Applications
Les applications de recherche de dosage QuantiGene Plex comprennent le criblage de composés permettant la recherche pharmaceutique, la vérification de biomarqueurs, l’efficacité de l’extinction exercée par des ARNsi, l’analyse prospective et/ou rétrospective d’échantillons d’essais cliniques, la validation de microarray, la toxicologie prédictive et la détection de translocations et de gènes de fusion.