Ensayo de genotipado SNP TaqMan™, humano
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Applied Biosystems™

Ensayo de genotipado SNP TaqMan™, humano

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Los ensayos de identificación de genotipos de SNP Applied Biosystems TaqMan utilizan la composición química de la 5´-nucleasa TaqMan paraMás información
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Número de catálogoCantidad
43513761000 reacciones (M, 40X)
43513742400 reacciones (L; 80X)
4351379300 reacciones (pequeñas, 40X)
Número de catálogo 4351376
Precio (MXN)
16,909.93
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Cantidad:
1000 reacciones (M, 40X)
Los ensayos de identificación de genotipos de SNP Applied Biosystems TaqMan utilizan la composición química de la 5´-nucleasa TaqMan para amplificar y detectar polimorfismos específicos en muestras de ADN genómico purificado.Cada ensayo permite el genotipado de individuos para un polimorfismo de nucleótido único (SNP) y consta de dos primers específicos de secuencia y dos sondas de ligante de ranura menor TaqMan (MGB) con supresores no fluorescentes (NFQ).Una sonda está etiquetada con colorante VIC para detectar la secuencia Allele 1; la segunda sonda está etiquetada con colorante FAM para detectar la secuencia Allele 2.

Nuestros ensayos humanos de genotipado TaqMan SNP prediseñados son una colección de millones de ensayos humanos para todo el genoma, incluidos 1000 SNP de genomas, SNP de HapMap y SNP de codificación.

Ventajas:
•Probado: la química TaqMan estándar de oro y los diseños de ensayo robustos brindan resultados precisos, reproducibles y confiables
•Sencillo: el conveniente formato de un solo tubo y el flujo de trabajo simple brindan un camino fácil hacia resultados confiables; no se requiere optimización
•Relevante: la extensa colección de ensayos humanos prediseñados ofrece acceso directo al contenido que es relevante para su investigación.
•Probado: todos los ensayos de genotipado de SNP humanos se prueban funcionalmente para garantizar la discriminación alélica

Tiempo aproximado de envío
4–6 días en Norteamérica y 6–10 días en Europa

Los ensayos de genotipado TaqMan SNP requieren solo tres componentes de reacción para PCR: ADN genómico purificado (1–20 ng), la solución de ensayo y la mezcla maestra de genotipado TaqMan (u otra mezcla maestra compatible) (se vende por separado).

Todos los diseños de ensayos son el producto de nuestra cartera de bioinformática, optimizada a lo largo de más de una década mediante el aprovechamiento de los datos de rendimiento de ensayo y fabricación.Los ensayos TaqMan se han citado en más de 40 000 publicaciones y están respaldados por más de 350 patentes.

Todos nuestros ensayos TaqMan prediseñados están cubiertos por la garantía qPCR de los ensayos TaqMan.*

Mezcla maestra recomendada (se vende por separado):Mezcla maestra para genotipado TaqMan

*Se aplican los términos y condiciones.Para obtener más información, visite www.thermofisher.com/taqmanguarantee.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.

Especificaciones
Modificación del cebador 3'Ninguno
Modificación del cebador 5'Ninguno
DescripciónLa sonda de MGB VIC™ detecta el alelo 1; la sonda FAM-MGB detecta el alelo 2
Para utilizar con (equipo)7500 System, 7500 Fast System, 7900HT System, StepOne™, StepOnePlus™, ViiA™ 7 System, QuantStudio™ Absolute Q Digital PCR System, QuantStudio™ 3, QuantStudio™ 5, QuantStudio™ 6 Flex, QuantStudio™ 7 Flex, QuantStudio 6 Pro, QuantStudio 7 Pro, QuantStudio™ 12k Flex ProFlex PCR System*, VeritiPro*, SimpliAmp*, MiniAmp*, Automated Thermal Cycler** If a thermal cycler is used for PCR amplification, the optional pre-read and the post-read must be performed separately on a real-time PCR system in order to detect and record fluorescent signals.
Características ecológicasEmbalaje sostenible
Modificación de sonda internaVIC™ (5'), FAM (5'), MGB (unión al surco menor) (3')
N.º de reacciones5000 reacciones
Línea de productosTaqMan
Método de purificaciónExtracción en fase sólida (SPE)
Grado de pureza o calidadSin ARNasa, sin ADNasa
Cantidad1000 reacciones (M, 40X)
Tipo de muestraHumano
Condiciones de envíoTemperatura ambiente
EspecieHumano
ObjetivoHay más de 4,5 millones de ensayos genómicos en humanos disponibles
Concentración40X
Para utilizar con (aplicación)Genotipado
FormularioCongelado
Etiqueta o tinteFAM, VIC
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
1 tubo que contiene una mezcla de 40x (tamaños S y M) u 80x (tamaño L) de ensayo preformulado (2 sondas y 2 cebadores).

Almacenar a entre -15 y -25 °C.

Preguntas frecuentes

What is the maximum size of insertion/deletion that can be detected by a TaqMan SNP Genotyping Assay?

Assays can detect an insertion/deletion of up to 6 bases. If you desire an assay to detect a larger insertion or deletion you may want to consider our Custom Design Service (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/custom-services-reagents-real-time-pcr-qpcr/custom-services-real-time-pcr-assays.html).

What can I do if there are no predesigned assays to my SNP?

You can use our Custom Assay Design Tool (https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-assays/snp-genotyping-taqman-assays/custom-snp-assays.html?ICID=ta-lm-custom%20taqman%20snp%20assay-Single%20Tube%20Custom%20TaqMan%C2%AE%20SNP%20Genotyping%20Assays) to submit your SNP sequence for an assay design. Alternatively, you can also use Primer Express Software to design an assay.

How do I find an assay to my SNP?

You can easily find predesigned TaqMan SNP Genotyping Assays with our user-friendly search tool at https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/pcr/real-time-pcr/real-time-pcr-assays/snp-genotyping-taqman-assays.html. Simply search by:

-Target (assay ID, rs number, gene symbol)
-Specific location on a chromosome

You can also watch this short video (https://www.youtube.com/watch?feature=player_embedded&v=qA4VWe8Jyrs) on how to search for assays.

Can the TaqMan SNP Genotyping Assays be used for allele quantification?

No. TaqMan SNP assays contain competitive probe sequences with a 1 bp mismatch where the SNP is located. The other probe will still bind at a lower efficiency, producing some signal for the other fluorophore. Therefore, these are not quantitative.

In my TaqMan SNP Genotyping Assay, which base is labeled with FAM or VIC dye?

The probe labels are provided in the assay documentation and also online. Simply look up the assay by typing the assay ID into the search bar on thermofisher.com. Click on the “View Details” button, and under the Product Details look for the Context Sequence. The assays are always in a [VIC/FAM dye] order. From the context sequence, you can see which base is first (thus labeled with VIC dye), and which is second (thus labeled with FAM dye).

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Citations & References (1421)

Citations & References
Abstract
Determination, mechanism and monitoring of knockdown resistance in permethrin-resistant human head lice, Pediculus humanus capitis
Authors:Clark, JM
Journal:JOURNAL OF ASIA-PACIFIC ENTOMOLOGY
PubMed ID:
Permethrin resistance has been reported worldwide and clinical failures to commercial pediculicides containing permethrin have likewise occurred. Permethrin resistance in head lice populations from the U.S. is widespread but is not yet uniform and the level of resistance is relatively low (∼4-8 fold). Permethrin-resistant lice are cross-resistant to pyrethrins, PBO-synergized ... More
Geographical mapping of a multifocal thyroid tumour using genetic alteration analysis & miRNA profiling
Authors:Aherne, ST; Smyth, PC; Flavin, RJ; Russell, SM; Denning, KM; Li, JH; Guenther, SM; O'Leary, JJ; Sheils, OM
Journal:Molecular Cancer
PubMed ID:
Background: Papillary thyroid carcinoma (PTC) frequently presents as multiple tumour-foci within a single thyroid gland or pluriform, with synchronous tumours comprising different histological variants, raising questions regarding its clonality. Among the genetic aberrations described in PTC, the BRAF V600E mutation and ret/PTC activation occur most commonly. Several studies have investigated ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:MAMMALIAN GENOME
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Risk haplotype analysis for bovine paratuberculosis
Authors:Pinedo, PJ; Wang, CG; Li, Y; Rae, DO; Wu, RL
Journal:JOURNAL OF NEURAL TRANSMISSION
PubMed ID:
Paratuberculosis (Johne's disease), caused by Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis, is an important disease for bovines, although its genetic basis is poorly understood. In this study, three candidate genes were typed to study the associations between single nucleotide polymorphisms (SNPs) and paratuberculosis susceptibility (measured in a 1 or 0 form) at ... More
Association of Polymorphisms in Genes of the Homologous Recombination DNA Repair Pathway and Thyroid Cancer Risk
Authors:Bastos, HN; Antao, MR; Silva, SN; Azevedo, AP; Manita, I; Teixeira, V; Pina, JE; Gil, OM; Ferreira, TC; Limbert, E; Rueff, J; Gaspar, JF
Journal:THYROID
PubMed ID:
Background: Ionizing radiation exposure has been pointed out as a risk factor for thyroid cancer. The double-strand breaks induced by this carcinogen are usually repaired by homologous recombination repair pathway, a pathway that includes several polymorphic genes. Since there is a scarcity of data about the involvement of these gene ... More
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