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- SNP ID:
- rs10858265
- Gene
-
COL5A1COL5A1-AS1 - Gene Name
- Set Membership:
- > HapMap > Validated
- Chromosome Location:
- Chr.9: 134652028 - 134652028 on Build GRCh38
- Polymorphism:
- C/T, Transition substitution
- Context Sequence [VIC/FAM]:
GGAGGGATGGTGACTCCCAGAGGTA[C/T]TAAGGAAAGGAGAAAGTGACACTGA
Genomic Map
Back To TopAssay Details
Species: |
Human | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
dbSNP Submissions: |
NA
|
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Phenotype: |
MIM: 120215
|
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Literature Links: |
COL5A1 PubMed Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Allele Nomenclature: |
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Minor Allele Frequency: |
| 1000Genome | Applied Biosystems® | HapMap | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Global
|
Caucasian
|
CEPH (CEU)
|
|||||||||
EAS
|
African American
|
YRI (Yoruba)
|
|||||||||
SAS
|
Japanese
|
JPT (Japanese)
|
|||||||||
AFR
|
Chinese
|
CHB (Han Chinese)
|
|||||||||
EUR
|
|||||||||||
AMR
|
| COL5A1 - collagen type V alpha 1 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Transcript Accession | SNP Location | SNP Type | Observed Codons | Observed Amino Acid | Protein ID | |
| NM_000093.4 | Intron | NP_000084.3 | ||||
| NM_001278074.1 | Intron | NP_001265003.1 | ||||
| XM_017014266.1 | Intron | XP_016869755.1 | ||||
| COL5A1-AS1 - COL5A1 antisense RNA 1 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| There are no transcripts associated with this gene. | ||||||
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Set Membership: |
HapMap
Validated
|
Panther Classification:
Gene Ontology Categories:
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