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          See other AUP1 GE Assays ›
          Gene Symbol:
          Aup1
          Gene Name:
          ancient ubiquitous protein 1
          Gene Aliases:
          AA589454
          Chromosome Location:
          Chr.6: 83054521 - 83057682 on Build GRCm38
          Species:
          Mouse
          Species Specific ID (Flybase ID):
          -
          Assay ID Mm04412209_g1
          Size
          Availability Made To Order
          Catalog # 4426961
          Price 434.00
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          Genomic Map

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          Assay Details

          Gene Symbol: Aup1
          Interrogated Sequence Translated Protein Exon Boundary Assay Location IMAGE Clone ID Amplicon Length
          RefSeq NM_001301649.1 NP_001288578.1 6 - 7 854 71
          NM_007517.4 NP_031543.2 7 - 8 1005 71
          NR_125891.1 7 - 8 1005 71
          GenBank mRNA AK154707.1 - 7 - 8 874 71
          AK158035.1 - 7 - 8 796 71
          AK167335.1 - 7 - 8 795 71
          AK171011.1 - 7 - 8 808 71
          AK171184.1 - 7 - 8 801 71
          AK171202.1 - 7 - 8 815 71
          AK171249.1 - 7 - 8 795 71
          AK171541.1 - 7 - 8 795 71
          AK171621.1 - 7 - 8 788 71
          AK208846.1 - 1 - 2 65 71
          BC012699.1 - 6 - 7 638 3986517 71
          BC016485.1 - 7 - 8 798 3962982 71
          U41736.1 - 7 - 8 803 71
          Interrogated Sequence Translated Protein Exon Boundary Assay Location IMAGE Clone ID Transcript Location Amplicon Length
          GenBankmRNA AA274093.1 - 4 - 5 290 Chr. 6 - 83055621 - 83056787 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BG920053.1 - 4 - 5 360 Chr. 6 - 83055559 - 83057342 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BG245841.1 - 4 - 5 342 Chr. 6 - 83055567 - 83057353 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AA432965.1 - 3 - 4 202 Chr. 6 - 83055915 - 83056617 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AA111432.1 - 3 - 4 196 Chr. 6 - 83055921 - 83057024 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BG971702.1 - 5 - 6 425 Chr. 6 - 83055259 - 83057095 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CF740816.1 - 1 - 2 62 Chr. 6 - 83056378 - 83057680 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA W09267.1 - 58 Chr. - - [-] on Build 71
          GenBankmRNA BQ954519.1 - 4 - 5 242 Chr. 6 - 83055668 - 83057658 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BG086461.2 - 1 - 2 48 Chr. 6 - 83056392 - 83057585 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AV460618.1 - 4 - 5 352 Chr. 6 - 83055559 - 83056794 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AV474529.1 - 2 - 3 Chr. 6 - 83055936 - 83056858 [-] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BI415696.1 - 7 - 8 Chr. 6 - 83054758 - 83056643 [+] on Build GRCm38 73
          GenBankmRNA AA982923.1 - 3 - 4 166 Chr. 6 - 83055951 - 83057039 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BI557459.1 - 4 - 5 255 Chr. 6 - 83055655 - 83057395 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AW990175.1 - 1 - 2 52 Chr. 6 - 83056388 - 83057393 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AA466764.1 - 4 - 5 415 Chr. 6 - 83055506 - 83056608 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BI851444.1 - 1 - 2 73 Chr. 6 - 83056367 - 83057651 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CK619002.1 - 4 - 5 279 Chr. 6 - 83055631 - 83057244 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BG277761.1 - 3 - 4 219 Chr. 6 - 83055897 - 83057032 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BQ129705.1 - 1 - 2 73 Chr. 6 - 83056367 - 83057536 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AI325213.1 - 3 - 4 Chr. 6 - 83055500 - 83056997 [-] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AA162754.1 - 4 - 5 343 Chr. 6 - 83055568 - 83056622 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BF166885.1 - 3 - 4 238 Chr. 6 - 83055904 - 83057409 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BI408756.1 - 2 - 3 232 Chr. 6 - 83056060 - 83057674 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BU846850.1 - 4 - 5 319 Chr. 6 - 83055593 - 83057342 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CN674942.1 - 1 - 2 48 Chr. 6 - 83056392 - 83057618 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AA611986.1 - 4 - 5 386 Chr. 6 - 83055525 - 83056878 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CA979639.1 - 4 - 5 437 Chr. 6 - 83055473 - 83057361 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AW912110.1 - 1 - 2 74 Chr. 6 - 83056373 - 83057531 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CD555883.1 - 1 - 2 48 Chr. 6 - 83056392 - 83057567 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA EL962090.1 - 4 - 5 274 Chr. 6 - 83055657 - 83057015 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA CX222997.1 - 1 - 2 73 Chr. 6 - 83056367 - 83057395 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA AV460566.1 - 4 - 5 363 Chr. 6 - 83055547 - 83056797 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA DT905904.1 - 4 - 5 337 Chr. 6 - 83055573 - 83057311 [+] on Build GRCm38 71
          GenBankmRNA BI332034.1 - 4 - 5 334 Chr. 6 - 83055576 - 83057005 [+] on Build GRCm38 71

          Adjacent Gene Details

          Gene name Gene Symbol Alias Distance Relative Direction Location Chromsome
          Upstream HtrA serine peptidase 2 Htra2 AI481710,
          Omi,
          Prss25,
          mnd2
          -1.8kb Anti-sense Chr. 6 - 83051266 - 83054571 on NCBI Build GRCm38
          Downstream DEAQ RNA-dependent ATPase Dqx1 2310066E11Rik 1.1kb Sense Chr. 6 - 83057731 - 83067219 on NCBI Build GRCm38

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          More Information


          Updated Mapping Information

          This assay targets the same location as MTA transcript cluster(s) TC0600000916.mm.1

          Set Membership:

          Ambion siRNA available Amplicon length between 71 and 85 Mammalian Gene Collection Detect Genomic DNA Mus musculus Probe spans exons

          Matching Ambion siRNAs:

          Click here to find siRNAs for Gene Aup1

          Panther Classification:

          Molecular Function -

          scaffold/adaptor protein

          Gene Ontology Categories:

          Function(s) Process(es)

          metabolic process
          retrograde protein transport, ER to cytosol
          transferase activity, transferring acyl groups

          MicroArray Probes:

          Affymetrix

          Array Name Probe IDs Targets Target Type
          Affymetrix Mouse Clariom S Array PSR0600006870.mm.1 NM_007517.4 Refseq
          Affymetrix Mouse Clariom S Array PSR0600006870.mm.1 TC0600000916.mm.1 MTA TC

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          Host server : magellan-search-green-b49b87d85-lnstr:80/100.66.74.145:80.
          git-commit: 5b8c860b7cdb41e9cfe07630520f6b51e109d38e
          git-url: https://github.com/thermofisher/magellan-search
          git-branch: release/2.47.0-Offline