Thermo Fisher Scientific

  1. Accelerating Science
  2. Learning at the Bench
    3. /
  3. 分子生物学実験関連
    4. / 複雑なデータ解析をシンプルに！ Ion Reporter ソフトウエアを使ってみよう　～データのインポート～

複雑なデータ解析をシンプルに！ Ion Reporter ソフトウエアを使ってみよう　～データのインポート～

Written by | Published: 04.12.2023

Ion Reporter™ ソフトウエアは、当社が提供する次世代シーケンサ（NGS） データ解析用ソフトウエアです。Ion Reporterソフトウエアにはクラウドとローカルサーバーの2種類あり、今回はクラウドへのデータインポート方法について紹介を行います。Ion Reporterソフトウエアはヒト遺伝子変異解析機能が充実し、ゲノム上の変異や融合遺伝子の検出、検出した変異に対してさまざまなアノテーション情報の付加ができます。Webブラウザの操作のみでデータ解析が実行でき、特別なバイオインフォマティクスの知識がなくても遺伝子変異解析が行えます。
本ブログでは、Ion Reporterソフトウエアを使用する上で必須となるデータインポートの方法について下記3点の紹介を行います。

  • Ion Torrent™ 次世代シーケンサからIon Reporterソフトウエアへの手動データインポート
  • Ion Torrent 次世代シーケンサからIon Reporterソフトウエアへの自動データインポート
  • PCからIon Reporterソフトウエアへの手動データインポート

データインポートの方法を含む詳細な操作方法は、「Ion Reporterソフトウエア 基本操作方法」資料をご覧ください。

▼こんな方におすすめです！

  • Ion Torrent次世代シーケンサでヒトの遺伝子変異解析を実施している、もしくは実施したい
  • Ion Reporterソフトウエアを使用してデータ解析を実施している
  • Ion Reporterソフトウエアへのデータインポートをしたい

Ion Torrent次世代シーケンサからIon Reporterソフトウエアへの手動データインポート

Plan作成の段階で自動解析の設定をOffにした場合でも、シーケンス終了後Ion Reporterソフトウエア （クラウド）へデータのインポートが可能です。Access codeの作成及びIon Reporter Uploaderの設定

Torrent browserからIon Reporterへの手動アップロード

Ion Torrent次世代シーケンサからIon Reporterソフトウエアへの自動データインポート

Plan作成の段階で自動解析の設定をONにすることで、シーケンス終了後自動でIon Reporterソフトウエアへデータが転送され、解析まで行うことが可能です。Torrent browserからIon Reporterへの自動アップロード

PCからIon Reporterソフトウエアへの手動データインポート

シーケンス後、Ion Torrent次世代シーケンサを経由せずPCから直接Ion Reporterソフトウエアへデータのインポートを行います。PCからIon Reporterへの手動アップロード

まとめ

本ブログではIon Reporterソフトウエアへのデータインポート方法について3種類の方法を紹介しました。今回はローカルサーバーへのアップロード方法やサンプル情報の編集方法には触れていません。データインポート以外にもIon Reporterソフトウエアにはさまざまな機能があり、ご不明な点は当社テクニカルサポートまでお問い合わせください。
また、Ion Reporterソフトウエア以外にも、次世代シーケンス（NGS）データ解析コンサルティングサービスでは、カスタムアノテーションの作成から解析結果の評価などのサービス内容についてもご相談を受け付けております。
ご興味がありましたら、当社テクニカルサポートまでお問い合わせください。

シリーズ：複雑なデータ解析をシンプルに！ Ion Reporter ソフトウエアを使ってみよう

次世代シーケンサ（NGS）入門

次世代シーケンスの原理や何ができるかがよくわからない、または自分の研究領域にどのように活用できるかわからないという方向けに、次世代シーケンスの基本や各研究領域に特化したアプリケーションをまとめました。リンク先から、それぞれの領域に応じたページをご覧いただけます。

詳細を見る

 

研究用にのみ使用できます。診断用には使用いただけません。

記事へのご意見・ご感想お待ちしています

  • サーモフィッシャーサイエンティフィックジャパングループ各社は取得した個人情報を弊社の個人情報保護方針に従い利用し、安全かつ適切に管理します。取得した個人情報は、グループ各社が実施するセミナーに関するご連絡、および製品／サービス情報等のご案内のために利用させていただき、その他の目的では利用しません。詳細は個人情報の取扱いについてをご確認ください。
  • 送信の際には、このページに記載のすべての注意事項に同意いただいたものとみなされます。