MagMAX™ FFPE DNA/RNAウルトラキットは、同じホルムアルデヒドまたはパラホルムアルデヒド固定パラフィン包埋(FFPE)組織サンプルからDNAおよびRNAを連続的に単離できるように設計されています。DNAとRNAは別々の溶出液で回収され、リアルタイムPCRや次世代シーケンシングなどの幅広い用途に対応しています。このキットは、同じFFPEサンプルからRNAとDDNAを単離できるため、
Oncomine™ Comprehensiveおよび
Oncomine™ Focusアッセイでのサンプル調整に最適です。
MagMAX FFPE DNA/RNAウルトラキットの特長:
•RNAやDNAの手動/自動単離が可能な柔軟な設計
• 最小要件5 µm切片またはカール入力
• 40 µm FFPE切片またはカールを処理可能。代替プロトコルで40 µmより大きい切片を処理可能
• ターゲットRNAとDNAシーケンシングパネルに対応
• RNA、microRNA、DNAの一貫した単離が可能なDynabeads™ MyOne™シランを含む
• RNAまたはDNAのみを単離可能な代替プロトコル
FFPEサンプルに含まれる情報を解明することは、がん研究に不可欠です。一般的な核酸分離法では、サンプルから回収する核酸を選択する必要がありますが、他の核酸(およびその分析によって得られた可能性のある情報)は失われます。あるいは、DNAとRNAを共精製するか、サンプルを半分に分割してそれぞれを精製することもできます。
少ないサンプルからより多くの情報を取得MagMAX FFPE DNA/RNAウルトラキットプロトコルは、まずFFPEサンプルからDNAを単離し、次にDNA除去上清からRNAを回収することで、これらの問題に対処します。核酸は個別の溶出液として調製され、下流分析に使用できます。これにより、ホットスポット変異、CNV、融合遺伝子、インデルなどの重要なバイオマーカーの調査など、貴重なサンプルのより完全な分析が可能になります。
MagMAX磁気ビーズベースで精製するメリットこのキットの磁気ビーズベースの精製フォーマットで、磁気スタンドやKingFisher™ DuoプライムやKingFisher™ Flexプロセッサなどの磁性粒子プロセッサを用いた手動でのサンプル処理が可能。処理するサンプル数を簡単にスケールアップできます。
磁気ビーズは、核酸を分離する他の技術と比べて多くの利点を提供します。ビーズはガラス繊維フィルターよりも効率的にRNAおよびDNAを結合し、より高く、一貫性に優れた収率を生じます。さらに、フィルターと真空マニホールドが使用されないため、抽出工程中に未消化の組織の粒子状物質によってこれらの部分が詰まるリスクがありません。この目詰まりの問題は、プロテイナーゼK処理中に完全に消化されない線維FFPE組織サンプルで特に懸念されます。
最適化されたビーズ表面化学MagMAX FFPE DNA/RNAウルトラキットに使用されているDynabeads MyOneシランは、高特異的な表面積を持つ最適化されたシリカ様表面化学を有しており、核酸の回収において効率的なカイネティクスと高感度を実現します。これらの側面から、Dynabeads MyOneシランはFFPEサンプル中のRNAおよびDNAターゲットの両方の回収に最適です。捕捉したこれらの核酸は、両方とも50 µLの容量で個別に溶出され、ダウンストリームアプリケーションに使用できます。