MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit
MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit
Applied Biosystems™

MagMAX™ FFPE DNA/RNA Ultra Kit

El kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX™ está diseñado para el aislamiento secuencial de ADN y ARN a partirMás información
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Número de catálogoCantidad
A318811 Kit
Número de catálogo A31881
Precio (EUR)
764,00
Each
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Cantidad:
1 Kit
Precio (EUR)
764,00
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El kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX™ está diseñado para el aislamiento secuencial de ADN y ARN a partir de la misma muestra de tejido incrustado en parafina y fijado con formaldehído o paraformaldehído (FFPE). El ADN y el ARN se recuperan en eluidos separados y ambos son compatibles con una amplia gama de aplicaciones, incluyendo PCR en tiempo real y secuenciación de última generación. El aislamiento de ARN y ADN de la misma muestra de FFPE hace de este kit un método ideal de preparación de muestras para ensayos integrales Oncomine™ y ensayos de enfoque Oncomine™.

Características del kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX:
• Diseño flexible que permite el aislamiento manual y automatizado de ARN y ADN
• Requisito mínimo de 5 µm de sección o entrada de rizo
• Capaz de procesar secciones o rizos de FFPE de 40 µm; las secciones de más de 40 µm se pueden procesar con un protocolo alternativo
• Compatible con los paneles de secuenciación de ARN y ADN objetivo
• Contiene silano MyOne™ Dynabeads™ para un aislamiento consistente de ARN, microARN y ADN
• Protocolos alternativos para el aislamiento de ARN o ADN solo

El desbloqueo de la información contenida en las muestras de FFPE es esencial para la investigación del cáncer. Los métodos habituales de aislamiento de ácidos nucleicos requieren elegir qué ácido nucleico recuperar de una muestra dada, con la pérdida del otro ácido nucleico (y cualquier información que pueda haber resultado de su análisis). Alternativamente, el ADN y el ARN se copurifican o la muestra se divide a la mitad para que cada una se pueda purificar.

Más información a partir de una menor entrada de muestras
El protocolo del kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX aborda estos problemas aislando primero el ADN de la muestra de FFPE y, a continuación, recuperando el ARN del sobrenadante con ADN agotado. Los ácidos nucleicos se preparan como eluidos separados y están listos para el análisis posterior. Esto permite un análisis más completo de muestras valiosas, incluyendo la investigación de biomarcadores importantes, tales como mutaciones de áreas activas, CNV, fusiones de genes e indeles.

Ventajas de la purificación basada en partículas magnéticas MagMAX
El formato de purificación basada en partículas magnéticas del kit permite escalar fácilmente el número de muestras procesadas manualmente con un soporte magnético o con un procesador de partículas magnéticas como el procesador KingFisher™ Duo Prime o KingFisher™ Flex.

Las partículas magnéticas ofrecen muchas ventajas en comparación con otras tecnologías para aislar ácidos nucleicos. Los gránulos unen el ARN y ADN de forma más eficiente que los filtros de fibra de vidrio, lo que se traduce en producciones mayores y más homogéneas. Además, debido a que no se utilizan filtros y colectores de vacío, no hay riesgo de que partículas de tejido no digeridas obstruyan estos elementos durante el proceso de extracción. Este problema de obstrucción es de particular preocupación con las muestras fibrosas de tejido FFPE que no se digieren completamente durante el tratamiento con proteinasa K.

Química de la superficie de gránulos optimizada
El silano MyOne Dynabeads utilizado en el kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX tiene una química de superficie similar a la sílice optimizada y un área de la superficie muy específica, lo que ofrece una cinética eficaz y gran sensibilidad en la captura de ácidos nucleicos. Estos aspectos hacen que el silano Dynabeads MyOne sea ideal para la recuperación de los objetivos de ARN y ADN que se encuentran en las muestras de FFPE. Una vez capturados, ambos ácidos nucleicos se eluyen por separado en volúmenes de 50 µl y están listos para aplicaciones posteriores.

Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
Para utilizar con (aplicación)Secuencia de última generación, RT-PCR (punto final), PCR en tiempo real, PCR, análisis de microARN
Compatibilidad de alto rendimientoAplicaciones de alto rendimiento compatibles
Línea de productosMagMAX
Tipo de productoKit para ADN y ARN FFPE Ultra
Cantidad1 Kit
Tipo de muestraFFPE, Muestras fijas
Condiciones de envíoAprobado para su envío a temperatura ambiente o en hielo húmedo o seco
ObjetivoARN total, miARN, ácidos nucleicos totales, ADN genómico, ARNm, ARN de transcriptomas
FormatoKit
Isolation TechnologyGránulo magnético
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
• 1 x 385 µl de proteasa; almacenar a entre - 5 y - 30 °C
• 1 x 10 ml de tampón de digestión de proteasa; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 38,5 ml de solución de unión; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 1,95 ml de gránulos de unión de ácido nucleico; almacenar a entre 2 °C y 8 °C
• 1 x 38,5 ml de tampón de lavado de ADN; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 210 ml de concentrado de solución de lavado 2; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 5 ml de solución de elución; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 115 ml de concentrado de tampón de lavado de ARN; almacenar a temperatura ambiente
• 1 x 1,92 ml de ADNasa; almacenar a entre - 5 y - 30 °C
• 1 x 960 µl de tampón ADNasa; almacenar a entre - 5 y - 30 °C

Preguntas frecuentes

How can I increase my chances of successful extraction of FFPE samples in terms of DNA quality and yield?

There are a number of factors that can impact the overall quality and yield of DNA isolated from FFPE tissues. Here are recommendations to address several key factors:

- Upstream tissue procurement and tissue specimen preparation - if possible, tissues should be fixed within one hour of surgical resection. The optimal fixation time is 12-24 hours using neutral-buffered formalin or paraformaldehyde. Fixed tissues should be thoroughly dehydrated prior to the embedding process.
- Block storage - storage of blocks without cut faces, when possible, prevents ongoing damage from exposure to atmospheric oxygen, water, and other environmental factors such as light and infestation (fungi, insects, etc.).
- Tissue type, size, and amount being used for DNA isolation - the recommended tissue thickness is 10-20 µm. The number of sections used is determined by the tissue type (which impacts cell density) and surface area (recommended size: 50-300 mm^2). Excess starting material can cause filter clogging, resulting in poor yield.
- Excessive amount of paraffin used for embedding tissues - when possible, excess paraffin should be trimmed away prior to starting the purification protocol. For xylene-based purification methods, two xylene treatments at room temperature should be sufficient for complete deparaffinization. If desired, a more rigorous 37-55 degrees C treatment can be performed for up to 30 minutes. After the xylene deparaffinization, it is crucial that the 100% ethanol is completely removed and the pellets are dry after the two 100% ethanol washes. The magnetic bead method employs novel chemistries to deal with the paraffin that limits input to 20 µm sections.

Read more about extraction of nucleic acids from FFPE samples here (http://www.thermofisher.com/us/en/home/references/Invitrogen-tech-support/rna-isolation/general-articles/extraction-of-nucleic-acids-from-ffpe-samples.html).

What can I use to extract DNA from FFPE (formalin fixed paraffin embedded) samples?

We offer 2 kits: RecoverAll Total Nucleic Acid Isolation Kit for FFPE and MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit Read more about the differences between these kits here (http://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/dna-rna-purification-analysis/dna-extraction/genomic-dna-extraction/dna-extractions-working-with-ffpe-samples.html).

Is there a limit to the size of curls that can be processed with the MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra Kit (Cat. No. A31881)?

There is no specific upper limit to curl size for use with the MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra kit (Cat. No. A31881). If all of the tissue is able to be submerged in the 200 µL of buffer, then the large volume of protocol should work. Please keep in mind when processing sections that are thicker than 40 µm, additional digestion buffer, binding solution, and wash buffer, may need to be purchased separately (Cat. No. A32796).

Can I use a heat block for the AutoLys M tube incubation?

No. The AutoLys M tubes don't fit in a standard 1.5 mL or 2.0 mL heat block. We recommend incubating the tubes in the tube racks in an incubator or oven.

What kind of centrifuge do I need to spin down the AutoLys M Tubes (Cat. No. A38738)?

Any centrifuge with plate adapters will work. The AutoLys M Tube Racks fit nicely into those adapters.