El kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX™ está diseñado para el aislamiento secuencial de ADN y ARN a partir de la misma muestra de tejido incrustado en parafina y fijado con formaldehído o paraformaldehído (FFPE). El ADN y el ARN se recuperan en eluidos separados y ambos son compatibles con una amplia gama de aplicaciones, incluyendo PCR en tiempo real y secuenciación de última generación. El aislamiento de ARN y ADN de la misma muestra de FFPE hace de este kit un método ideal de preparación de muestras para ensayos
integrales Oncomine™ y
ensayos de enfoque Oncomine™.
Características del kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX:
• Diseño flexible que permite el aislamiento manual y automatizado de ARN y ADN
• Requisito mínimo de 5 µm de sección o entrada de rizo
• Capaz de procesar secciones o rizos de FFPE de 40 µm; las secciones de más de 40 µm se pueden procesar con un protocolo alternativo
• Compatible con los paneles de secuenciación de ARN y ADN objetivo
• Contiene silano MyOne™ Dynabeads™ para un aislamiento consistente de ARN, microARN y ADN
• Protocolos alternativos para el aislamiento de ARN o ADN solo
El desbloqueo de la información contenida en las muestras de FFPE es esencial para la investigación del cáncer. Los métodos habituales de aislamiento de ácidos nucleicos requieren elegir qué ácido nucleico recuperar de una muestra dada, con la pérdida del otro ácido nucleico (y cualquier información que pueda haber resultado de su análisis). Alternativamente, el ADN y el ARN se copurifican o la muestra se divide a la mitad para que cada una se pueda purificar.
Más información a partir de una menor entrada de muestrasEl protocolo del kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX aborda estos problemas aislando primero el ADN de la muestra de FFPE y, a continuación, recuperando el ARN del sobrenadante con ADN agotado. Los ácidos nucleicos se preparan como eluidos separados y están listos para el análisis posterior. Esto permite un análisis más completo de muestras valiosas, incluyendo la investigación de biomarcadores importantes, tales como mutaciones de áreas activas, CNV, fusiones de genes e indeles.
Ventajas de la purificación basada en partículas magnéticas MagMAXEl formato de purificación basada en partículas magnéticas del kit permite escalar fácilmente el número de muestras procesadas manualmente con un soporte magnético o con un procesador de partículas magnéticas como el procesador KingFisher™ Duo Prime o KingFisher™ Flex.
Las partículas magnéticas ofrecen muchas ventajas en comparación con otras tecnologías para aislar ácidos nucleicos. Los gránulos unen el ARN y ADN de forma más eficiente que los filtros de fibra de vidrio, lo que se traduce en producciones mayores y más homogéneas. Además, debido a que no se utilizan filtros y colectores de vacío, no hay riesgo de que partículas de tejido no digeridas obstruyan estos elementos durante el proceso de extracción. Este problema de obstrucción es de particular preocupación con las muestras fibrosas de tejido FFPE que no se digieren completamente durante el tratamiento con proteinasa K.
Química de la superficie de gránulos optimizadaEl silano MyOne Dynabeads utilizado en el kit Ultra de ADN/ARN de FFPE MagMAX tiene una química de superficie similar a la sílice optimizada y un área de la superficie muy específica, lo que ofrece una cinética eficaz y gran sensibilidad en la captura de ácidos nucleicos. Estos aspectos hacen que el silano Dynabeads MyOne sea ideal para la recuperación de los objetivos de ARN y ADN que se encuentran en las muestras de FFPE. Una vez capturados, ambos ácidos nucleicos se eluyen por separado en volúmenes de 50 µl y están listos para aplicaciones posteriores.
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.