Converge™ Software

El producto incluye un servidor Converge y el software. Para activar y utilizar la aplicación Case Management con los módulos NGS o Kinship Analysis (que se describen a continuación), debe adquirirse la licencia adecuada.

Características y ventajas clave:
• Análisis de los datos de NGS desde los paneles Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2, Precision ID mtDNA Whole Genome o Control Region Panels, Precision ID Identity Panel Precision ID Ancestry Panel, o custom Ion AmpliSeq SNP
• Análisis rutinarios y complejos de paternidad/parentesco
• Centralización y gestión de datos forenses e información de casos en un solo lugar para facilitar el acceso
• Personalización de la arquitectura de la información, las entradas de datos y los parámetros para satisfacer las necesidades del

módulo de análisis de datos NGS del laboratorio
El módulo de análisis de datos NGS permite a los usuarios analizar datos de STR, SNP o mtDNA a partir de flujos de trabajo de Precision ID y es necesario para generar perfiles a partir de Precision ID GlobalFiler NGS STR Panel v2 de Applied Biosystems. La funcionalidad del análisis de NGS incluye información sobre la llamada a alelos STR, motivos de secuencia de STR y SNP en regiones de flancos, así como la capacidad de distinguir heterocigotos isométricos (alelos de la misma longitud de fragmento, pero que contienen secuencias diferentes). Estas fuentes adicionales de diversidad alélica pueden ser útiles tanto en el análisis de mezcla como en la interpretación de parentesco. Con una interfaz similar a la del software GeneMapper ID-X de Applied Biosystems, los analistas forenses podrán evaluar rápidamente los datos de NGS utilizando valores de calidad de proceso (PQV) conocidos y marcadores como el número de alelo (AN), los alelos fuera de escalera (OL), la relación de altura máxima (PHR), valores inferiores al umbral estocástico (BST) y la concordancia del control (CC). El módulo de NGS ofrece ajustes de análisis preconfigurados que el laboratorio puede modificar según sea necesario. Además, se incluye toda la funcionalidad de auditoría en relación con los requisitos de la cadena de custodia. El uso del módulo de análisis de datos NGS con la aplicación Case Management permite una comparación simplificada de los perfiles de NGS y CE.

Para el análisis de ADNm con el panel Precision ID mtDNA Whole Genome o el panel Precision ID mtDNA Control Region, el módulo de análisis de datos NGS Converge proporciona una llamada de variantes sencilla y precisa. El proceso de análisis automatizado de NGS de ADNmt integra diversas fuentes de conocimientos para la variación de ADNmt, incluidos los filoárboles y el EMPOP, con el objeto de ofrecer alineaciones ajustadas y llamadas a variantes para salvar las dificultades de los algoritmos estándar. Los laboratorios interesados en un análisis más avanzado y en la elaboración de informes de tipos de ADNmt pueden obtener y comparar información de haplotipos y haplogrupos, junto con evaluaciones cuantitativas de las heteroplasmas de punto y longitud. Además de aplicar las recomendaciones forenses pertinentes de acuerdo con las directrices de interpretación SWGDAM para el análisis de ADN mitocondrial (2019), el software Converge también ofrece características de facilidad de uso mejoradas para el análisis de secuencias en profundidad mediante un visor de luz IGV integrado con trillado flexible y exportaciones con formato CODIS.

El módulo NGS del software Converge contiene parámetros de análisis para generar informes desde los paneles Precision ID Ancestry, Precision ID Identity o los paneles Ion AmpliSeq SNP personalizados. El análisis de SNP de Converge ofrece una variedad de valores de medición que permiten supervisar la calidad de la secuencia, incluida la cobertura de lecturas alineadas a un punto caliente, el sesgo de la cadena, el número de lecturas que contiene cada base en el punto caliente, la llamada de genotipos y la calidad. El análisis de ancestros terciarios consiste en la generación de una estimación de la predicción de mezclas a partir de siete regiones geográficas: África, América, Asia oriental, Europa, Oceanía, Asia meridional y Asia sudoccidental. El análisis se puede realizar utilizando la información de frecuencia de alelos y de población por defecto de los 1000 proyectos de genomas; alternativamente, los usuarios pueden designar sus propias frecuencias de alelos y poblaciones para depurar el análisis.

Módulo Kinship and Paternity
Las pruebas de paternidad y parentesco presentan desafíos debido a la complejidad de los flujos de trabajo de laboratorio y los análisis estadísticos realizados. El módulo Kinship and Paternity Converge se integra con el software Converge y el software de genotipado GeneMapper ID-X para ayudar a automatizar el análisis, notificar casos rutinarios de pruebas de paternidad y otros casos de pruebas de parentesco, además de permitir el cálculo y la notificación de la relación de probabilidad genética. El sistema es altamente configurable para adaptarse a flujos de trabajo, procedimientos operativos estándar (SOP) y parámetros de análisis específicos de cada laboratorio. También se puede integrar en un sistema de gestión de información de laboratorio (LIMS) existente mediante el uso de puntos de integración de arquitectura orientada al servicio integrados en el software Converge.

Aplicación Case Management
El software Converge está diseñado para aumentar la eficacia de los laboratorios de análisis de ADN forenses y de parentesco mediante la centralización de la creación, el análisis y el almacenamiento de datos en un único punto de acceso. La aplicación Case Management admite la gestión de datos de casos, sujetos, genotipos y laboratorio, además de permitir la transferencia de datos automatizada y la integración con diversos sistemas de laboratorio de ADN forense. El software es altamente configurable y puede adaptarse a flujos de trabajo de laboratorio específicos, no solo a parámetros de análisis, sino también a campos de datos según los procedimientos operativos estándar del laboratorio. Además, permite la configuración de la interfaz de usuario y de los informes de salida, al tiempo que brinda características que ayudan a garantizar la seguridad y la integridad de los datos. Estas funciones son fácilmente accesibles a través de una interfaz segura basada en navegador web bajo la protección del departamento de TI del laboratorio. Se puede crear una gran variedad de módulos de software fácilmente en la plataforma Converge para admitir varias aplicaciones forenses.

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Más información sobre la combinación de licencias de Case Management y Kinship & Paternity Analysis >
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