BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit
BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit
Applied Biosystems™

BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit

Das BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit ist eine schnelle, einfache Aufreinigungsmethode für DNA-Sequenzierungsreaktionen, die nicht eingebaute BigDye™ Terminatoren und Salze entfernt.Keine FarbstofftropfenWeitere Informationen
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KatalognummerMenge
43764852 Flaschen
43764862 Flaschen
43764871000 Aufreinigungen
43764842 Flaschen
Katalognummer 4376485
Preis (EUR)
28.430,00
Each
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Menge:
2 Flaschen
Preis (EUR)
28.430,00
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Das BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit ist eine schnelle, einfache Aufreinigungsmethode für DNA-Sequenzierungsreaktionen, die nicht eingebaute BigDye™ Terminatoren und Salze entfernt.Keine Farbstofftropfen mehr!Die Aufreinigung ist nach weniger als 40 Minuten abgeschlossen und erfordert weniger als 10 Minuten Arbeitsaufwand.

•Wegfall des Flüssigkeitstransfers – Verwendung einer einzelnen Platte
•Restloses Entfernen von Farbstofftropfen
•Stabilisierung der Proben vor der Analyse
•Verbesserung des Sequenzierungsablaufs
• Manuelle oder automatisierte Protokolle
• Schnelle, zuverlässige und reproduzierbare Ergebnisse.

Einfacher Aufreinigungsprozess
Traditionelle Aufreinigungsmethoden wie Ethanolfällung erfordern die Zugabe mehrerer Reagenzien sowie Dekantier- und Zentrifugationsschritte.Das BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit benötigt lediglich zwei weitere Reagenzien, die nacheinander oder bereits vorgemischt hinzugefügt werden können:

• XTerminator™ Lösung – Entfernt nicht eingebaute Farbstoff-Terminatoren und löst Salze aus der Reaktion nach der Sequenzierung.
• SAM™ Lösung – Verbessert die Leistung der XTerminator™ Lösung und stabilisiert die Nachreinigungsreaktionen.

Das Protokoll ist sehr einfach (siehe Abbildung 1):
1.Führen Sie das Cycle-Sequencing-Verfahren mit BigDye™ Terminatoren durch.
2Zentrifugieren Sie anschließend die Reaktionsplatte kurz und pipettieren Sie dann die korrekte Menge SAM™ Lösung in jedes Well der Platte.
3.Pipettieren Sie die korrekte Menge XTerminator™ Lösung in jedes Well:
4.Der Behälter mit der XTerminator™ Lösung wird kurz mit einem Vortexmischer gemischt.
5.Unter Verwendung einer Pipettenspitze mit breiter Öffnung (zu empfehlen) wird die angemessene Flüssigkeitsmenge in jedes Well pipettiert.
6.Versiegeln Sie die Platte durch Heißversiegelung oder mittels transparenter Klebefolie (P⁄ N 4306311).30 Minuten lang Vortexmischen (empfohlen werden Vortexmischer für 96-Well-Mikrotiterplatten und für 384-Well-Mikrotiterplatten), dann die Reaktionsplatte kurz zentrifugieren.
7.Setzen Sie die Reaktionsplatte in den Applied Biosystems DNA-Analysator ein.Wählen Sie das Modul und die Platte für den Analyselauf aus.

Ausgezeichnete Rückgewinnung langer Fragmente
Mit dem BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit gehen Sie nicht auf Kosten der Sequenzlänge.Abbildung 2 zeigt Daten der Abteilung für DNA-Technologie des Plant Biotechnology Institute (NRC-PBI) in Saskatoon, Kanada.Die Leselänge der Q20-Basis beträgt 1044 bp.

Verbesserte Rückgewinnung kurzer Fragmente
Mit dem BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit erhalten Sie qualitativ hochwertigere Daten.Abbildung 3 zeigt einen Vergleich zwischen dem BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit und der Aufreinigung mittels Ethanolfällung, der von der Abteilung für DNA-Technologie des Plant Biotechnology Institute (NRC-PBI) in Saskatoon, Kanada durchgeführt wurde.Das BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit sorgt für qualitativ hochwertige Rückgewinnung kurzer Fragmente.Sequenzdaten aus der Aufreinigung mittels Ethanolfällung wurden durch Farbstofftropfen beschädigt.

Erhöhte Stabilität
Versiegelte Reaktionsplatten sind bei Raumtemperatur 48 Stunden lang, oder bei 4 °C 10 Tage lang stabil. Im Fall eines Strom- oder Rechnerausfalls, bzw. einer anderen Störung, kann dieselbe Probe neu analysiert werden, ohne das Experiment wiederholen zu müssen.Dies erhöht Ihre Flexibilität beim Laden einer Reaktionsplatte auf ein CE-Gerät.

Verfügbare Betriebsmodule
Applied Biosystems bietet herunterladbare Betriebsmodule für die Verwendung mit dem BigDye XTerminator™ Aufreinigungskit und der Datenerfassungssoftware.Diese Module sind für die 3100, 3100–Avant (mit Data Collection v2.0 oder höher), 3130⁄3130xl und 3730⁄3730xl Analysatoren bestimmt.Die Softwaremodule für das BigDye XTerminator Aufreinigungskit sind mit den Betriebssystemen Windows™ 2000 und Windows™ XP kompatibel und sind auf unserer Software-Download-Seite verfügbar:

Applied Biosystems Integrierte Systeme für die genetische Analyse ›

Nur für Forschungszwecke.Darf nicht für diagnostische Verfahren eingesetzt werden.
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
Specifications
EndprodukttypDNA
Zur Verwendung mit (Anwendung)Sequenzierung
Enthält2 Flaschen
Anzahl Reaktionen40.000
ProduktlinieBigDye XTerminator, BigDye
ProdukttypAufreinigungskit
Menge2 Flaschen
ProbentypSequenzierungsprodukte
Ausgangsmaterialmenge10 μl
ZielSequenzierungsreaktionen
Prüfzeit40 min
FormatKit
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
800 mL Xterminator™ Lösung (bei 4 °C lagern), 3600 mL SAM™ Lösung (bei Raumtemperatur oder 4 °C lagern)

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Can I store samples in BigDye Xterminator solution? If so, what is the optimal temperature, and for how long can I store it?

Yes, after cleaning the sequencing product using the BigDye XTerminator Purification Kit, the end product can be stored up to 10 days at either 4°C or –20°C.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What is a dye blob?

After the cycle sequencing reaction is complete, unincorporated ddNTPs can form complexes that migrate more slowly than individual ddNTPs would. These complexes can interfere with electrokinetic injection, electrophoretic separation, and data analysis. In the electropherogram these can be observed as a region containing multicolored peaks of varying sizes or blobs, depending on the efficiency of the cleanup. In BigDyeTerminator v3.1 reactions, these blobs may appear around 70–80 bp and, in severe cases, 110–120 bp. For BigDye Terminator v1.1, the blobs will either migrate ahead of the data collection time (so they will not be visible) or they may be visible at the very beginning of the run.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

What are the different ways to clean up my sequencing reactions?

While there are many kits and methods available to clean up the extension products from a sequencing reaction, the ones that Thermo Fisher Scientific has formally tested and recommends are:

•BigDye XTerminator Purification Kit
•Ethanol precipitation
•Spin column/plate purification (e.g. Centri-Sep columns, DTR Kits from Edge Biosystems)

A list of alternative methods for purification is available in the DNA Sequencing by Capillary Electrophoresis: Applied Biosystems Chemistry Guide: Second Edition (Cat. No. 4305080, Rev. C, page 119). The guide can be found by searching the Thermo Fisher Scientific website with the Cat. No. 4305080.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Capillary Electrophoresis Applications Support Center.

Does the BigDye XTerminator (including SAM Solution) contain any aerosols?

The BigDye Xterminator Solution and SAM Solution do not contain aerosols.

Find additional tips, troubleshooting help, and resources within our Nucleic Acid Purification and Analysis Support Center.

What kit do you recommend for cleanup of the cycle sequencing reaction?

For the purification of the sequencing reaction, we recommend the BigDye Xterminator Purification Kit. For reference, the following is the link to the BigDye Xterminator Purification Kit User Guide.

Additionally, our Sanger Sequencing Guide has additional recommendations starting on page 68 for purifying the sequencing reaction.