TaqMan™ Copy Number Reference Assay, mouse, Tert

TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays für Mäuse werden mit vorgefertigten, Custom Plus und Custom TaqMan™ Kopienzahl-Assays in einer Duplex-Echtzeit-PCR-Reaktion durchgeführt, um Variationen in der Kopienzahl im Genom von Mäusen nachzuweisen und zu messen.TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays für Mäuse sind auch mit dem gängigen Vektor-Marker und Reportergen vorgefertigter TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays kompatibel.Es gibt zwei Optionen für Gene, die als endogene Referenzgene bei Mäusen genutzt werden können:TFRC und TERT.TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays sind für die Erfassung einzigartiger genomischer Sequenzen im Referenz-Genom der Maus ausgelegt (NCBI Build 37/mm9) und sind für die relative Quantifizierung von Zielsequenzen mit niedriger Kopienzahl erforderlich.

TaqMan™ Kopienzahl-Assays quantifizieren das Gen von Interesse und normieren auf ein endogenes Referenz-Gen, das bekanntermaßen in einem diploiden Genom in zwei Kopien vorliegt.Bitte beachten Sie, dass TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays artenspezifisch sind.

Tert:Die alternative Referenz-Gen-Option
TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assays verfügen über eine mit VIC™ Farbstoff markierte TAMRA™ Sonde und Referenzsequenz-spezifische Vorwärts- und Rückwärts-Primer.Die Assays sind nicht Primer-begrenzt.

TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TFRC wird als Standard-Referenz-Assay für die Analyse von Kopienzahlen bei Mäusen empfohlen.Dieser Assay weist das Transferrin-Rezeptor-Gen (TFRC) auf Chromosom 16, Zytoband 16qB3 nach.Die Assay-Lokalisierung ist chr.16:32626732 auf NCBI Build 37.Er verfügt über ein 91 bp-Amplikon, das sich innerhalb von Exon 17 des TFRC-Gens befindet.

Der TaqMan™ Kopienzahl-Referenz-Assay, Maus, TERT ist ein alternativer Referenz-Assay. Er wird für den Fall empfohlen, dass der TFRC-Assay aufgrund von Chromosomenaberrationen oder anderen Problemen nur schlecht bei einer Probe funktioniert.Der Assay zielt auf das Telomerase-Reverse-Transkriptase (TERT)-Gen auf Chromosom 13, Zytoband 13qC1 ab.Die Assay-Lokalisierung ist chr.13:73778992 auf NCBI Build 37.Er hat ein 96 bp-Amplikon, das sich innerhalb von Intron 8 des TERT-Gens befindet.

Der einfachste Arbeitsablauf
TaqMan™ Kopienzahl-Assays haben den einfachsten Arbeitsablauf aller derzeit erhältlichen CNV-Analysemethoden.Der Test-Assay (FAM™ Farbstoff-markiert), der Referenz-Assay (VIC™ Farbstoff-markiert), Ihre Proben-DNA und TaqMan™ Master Mix werden kombiniert und laufen dann auf einem Applied Biosystems™ Echtzeit-PCR-System mit dem standardmäßigen TaqMan™ Kopienzahl-Assay-Protokoll.Im Durchschnitt dauert es von der Einrichtung bis zur primären Analyse nur 3 bis 4 Stunden (einschließlich ca. 2 Stunden PCR-Lauf).

Leistungsstarke Datenanalyse-Software
Die CopyCaller™ Software wurde speziell für die Datenanalyse beim TaqMan™ Kopienzahl-Assay entwickelt.Diese kostenlose, anwenderfreundliche Software nutzt eine graphische Benutzeroberfläche, die eine mögliche Kopienanzahl einer Probengruppe schnell und in einem Durchlauf berechnet.Sie gibt außerdem einen Konfidenzwert für jede Kopienzahl und hat eine Ausreißer-Funktion.

Nur für Forschungszwecke.Nicht für therapeutische oder diagnostische Zwecke bei Menschen und Tieren vorgesehen.