GeneChip™ Rat Exon 1.0 ST Array

GeneChip ™ Rat Exon 1.0 ST Array bietet neue Erkenntnisse und leistungsstarke Schlüsselinformationen für Forscher.

Mit etwa vier Sonden pro Exon und etwa 40 Sonden pro Gen ermöglicht das GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST Array zwei komplementäre Ebenen der Analyse - Genexpression und alternative Spleißung.

Mehrere Sonden pro Exon ermöglichen die “Exon-level”-Analyse und ermöglichen die Unterscheidung zwischen verschiedenen Isoformen eines Gens. Diese exon-level Analyse auf einer Ganzgenomskala öffnet die Tür zum Nachweis spezifischer Veränderungen im Exon-Verbrauch, die eine zentrale Rolle in der Krankheitsmechanik und Ätiologie spielen können.

Die zweite Ebene ist die “Gen-Level”-Expressionsanalyse, bei der mehrere Sonden auf verschiedenen Exonen zu einem Expressionswert aller Transkripte desselben Gens zusammengefasst werden.

Exon-Arrays bieten die umfassendste Abdeckung des Genoms, einschließlich empirisch unterstützter und vorhergesagte Transkriptsequenzen, wodurch die Entdeckung zuvor nicht identifizierter neuer Ereignisse ermöglicht wird.

Array-Eigenschaften
•Expressionsanalyse mit höchster Auflösung, die mehr als 1 Million Exon-Cluster innerhalb der bekannten und vorhergesagten transkribierten Bereiche des gesamten Genoms abfragt.

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•Tailored GeneChip™ Whole Transcript (WT) Assay und Reagenzien, die unter Verwendung einer Random-Priming-Methode Messziele über die gesamte Länge der Transkripte erzeugen.

•Flexible Datenanalyselösungen und umfassende Anmerkungen, die Ihnen die Möglichkeit geben, die Daten in verschiedenen benutzerdefinierten Workflows zu untersuchen und zu zerlegen.

Sondensätze: ∼ 1 Million
Exon-Cluster: 850.000
unterstützt durch Putative Full-Length mRNA: 92.038 Sondensätze
Unterstützt von Ensembl-Transkripten: 195.943 Sondensätze
Unterstützt von EST: 211.451 Schallkopfsätze
, unterstützt von Human- oder Rat-mRNA: 272.061 Sondensätze
Unterstützt von Gene Prediction: 875.666 Sondensätze
Sondenauswahlbereich: Über die gesamte Länge der Transkriptsonde
/Sondenauswahl: 4¹
Hintergrund-Subtraktionsstrategie: Mittlere Intensität von bis zu 1.000 Hintergrundsonden mit demselben GC-Gehalt
Gesamtmerkmale pro Array: ∼ 4.000.000
abgefragter Strang: Sense<sup>2

1</sup> Etwa 10 Prozent der Exon-Sonden-Sets haben aufgrund der Länge und der Sequenzbedingungen des Sondenauswahlbereichs weniger als vier Sonden. ² Die auf dem Array gekachelten Sonden sind in der Anti-Sense-Ausrichtung konstruiert, sodass sense-strang-markierte Ziele mit dem Array hybridisiert werden müssen. Nach der Konvention wird das Array als ST-Array bezeichnet, was die Notwendigkeit der Verwendung von Messzielen darstellt (die markierten Proben, die mit dem Array hybridisiert werden sollen).

Starterkit Um optimale Ergebnisse mit dem GeneChip™ Exon Array System zu erzielen, wird dringend empfohlen, dass neue Anwender mit dem Starter-Kit beginnen.

*Jedes Starterkit enthält:

•GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST Array, 30 Arrays
•GeneChip™ WT Sense Target Labeling and Control Reagents, 30 Reaktionen
•Vor-Ort-Schulung einschließlich der folgenden Arrays und Reagenzien für die Schulung:
•GeneChip™ Mouse Exon 1.0 ST Array, 10 Arrays
•GeneChip™ WT cDNA Synthese- und Amplifikations-Kit, 10 Reaktionen
•GeneChip™ WT Terminal Labeling Kit, 10 Reaktionen
•GeneChip™ Sample Cleanup Module, 30 Reaktionen
•GeneChip™ Eukaryotic Poly-A RNA Control Kit, 100 Reaktionen
•GeneChip™ Hybridization Control Kit, 30 Reaktionen

Neue XRAY-Demos für die Exon-Expressionsanalyse •Sehen Sie sich eine zweiminütige Demo zu einem typischen Arbeitsablauf mit Biotique XRAY für die Analyse von GeneChip an™ Exon-Arrays
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•Sehen Sie sich eine zweiminütige Demo zur Interpretation der GeneChip an™ Exon-Array-Daten von Biotiques XRAY
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