Collibri™ Library Amplification Master Mix with Primer Mix
Invitrogen™

Collibri™ Library Amplification Master Mix with Primer Mix

Invitrogen Collibri-Bibliotheks-Amplifikations-Mastermix ist eine gebrauchsfertige Lösung für die Amplifikation von Next-Generation-Sequenzierungs(NGS)-Bibliotheken. Der Mastermix enthält Platinum SuperFi DNA-Polymerase in Kombination mitWeitere Informationen
Have Questions?
Ansicht ändernbuttonViewtableView
KatalognummerAnzahl Reaktionen
A3854005050
A38540250250
Katalognummer A38540050
Preis (EUR)
198,00
Each
Anzahl Reaktionen:
50
Preis (EUR)
198,00
Each
Invitrogen Collibri-Bibliotheks-Amplifikations-Mastermix ist eine gebrauchsfertige Lösung für die Amplifikation von Next-Generation-Sequenzierungs(NGS)-Bibliotheken. Der Mastermix enthält Platinum SuperFi DNA-Polymerase in Kombination mit einem proprietären Reaktionspuffer, der alle erforderlichen Komponenten für eine effiziente Bibliotheks-Amplifikation mit minimaler Verzerrung und überlegener Genauigkeit enthält.

Merkmale sind u. a:
Hohe Genauigkeit – Minimale Fehlerraten, ähnlich wie bei PCR-freien Methoden
Hohe Effizienz – Hohe Ausbeuten aus winzigen Eingangsmengen
Minimale Verzerrung – Gleichmäßige Verstärkung, unabhängig vom GC-Gehalt

Dieser Collibri Bibliotheks-Amplifikations-Mastermix wird mit einem 10X Primermix geliefert, der auf die P5- und P7-Regionen von Illumina Adaptern zielt. Der Mastermix wird mit einem inerten blauen Farbstoff ergänzt, während der Primermix einen gelben Farbstoff enthält. Durch das Mischen beider Komponenten in einer PCR-Reaktion wird die endgültige PCR-Lösung grün. Dies ist eine visuelle Hilfe bei der Pipettierung und trägt dazu bei, das Risiko für Pipettierfehler während des Reaktionsaufbaus zu verringern.

Platinum SuperFi DNA-Polymerase weist sowohl 5’- bis 3’-Polymerase- als auch 3’- bis 5’-Exonuklease(Proofreading)-Aktivitäten auf, jedoch keine 5’- bis 3’-Exonuklease-Aktivität. Die außergewöhnlich starke Proofreading-Aktivität gewährleistet die Verstärkung von NGS-Bibliotheken mit höchster Sequenzgenauigkeit, wodurch sich NGS-Fehlerraten ähnlich wie bei PCR-freien Methoden ergeben

Der proprietäre Reaktionspuffer enthält alle erforderlichen PCR-Komponenten und Additive, um eine effiziente und gleichmäßige Verstärkung der Bibliothek unabhängig vom GC-Gehalt zu ermöglichen und so die Abdeckung von GC- und AT-reichen Sequenzen und anderen komplexen Regionen zu verbessern. Dank der hohen Verstärkungseffizienz kann die gewünschte Ausbeute mit weniger Zyklen erreicht werden.

Die Platin-Hot-start-Technologie hemmt die DNA-Polymeraseaktivität bei Umgebungstemperaturen und ermöglicht so den Reaktionsaufbau und die Lagerung von vorgefertigten PCR-Reaktionen bis zu 24 Stunden lang vor der PCR.

Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
Specifications
Wiedergabetreue (vs. Taq)≥100
Zur Verwendung mit (Anwendung)Sequenzierung
FormFlüssig
GC-reiche PCR-LeistungHoch
Hot-StartIntegrierter Heißstart
Anzahl Reaktionen50
ÜberhangStumpf
ProduktlinieCollibri
ProdukttypMaster Mix zur Bibliotheksammplifikation
Menge50 reactions
ReaktionsformatSuperMix oder Master Mix
ProbentypDNA, RNA
VersandbedingungTrockeneis
PrüfzeitStandard
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
• 1 x 1,25 ml Collibri Bibliotheks-Amplifikations-Mastermix (2X)
• 1 x 500 µl Primermix

Bei –20 °C lagern.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Are PCR products generated using the Collibri Library Amplification Master Mix blunt-ended?

Yes, PCR products generated using the Collibri Library Amplification Master Mix are blunt-ended.

Is Collibri Library Amplification Master Mix compatible with magnetic beads?

Yes, Collibri Library Amplification Master Mix is compatible with magnetic beads provided in Collibri library preparation kits and in Agencourt AmPure XP system from Beckman Coulter.

What is the fidelity of the Collibri Library Amplification Master Mix?

The Collibri Library Amplification Master Mix contains Platinum SuperFi DNA Polymerase that has strong 3' to 5' exonuclease (proofreading) activity for superior amplification accuracy, greater than 100-fold in comparison with Taq polymerase.

What are the recommended storage conditions for the Collibri Library Amplification Master Mix?

We recommend storing the Collibri Library Amplification Master Mix at -20 degrees C.

Is Collibri Library Amplification Master Mix suitable for amplification of libraries prepared from FFPE samples?

Yes, however, additional PCR cycles (1-3) are typically needed with FFPE DNA or other challenging samples. To determine the optimal PCR conditions, use the table in the user manual (https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/LSG/manuals/MAN0017582_Platinum_SuperFi_LibraryAmp_MM_w_Primer_Mix_UG.pdf) with the required number of PCR cycles per sample size as a starting point.

Zitierungen und Referenzen (1)

Zitierungen und Referenzen
Abstract
High-resolution microbiome analysis enabled by linking of 16S rRNA gene sequences with adjacent genomic contexts.
Authors:Kapustina Ž, Medžiune J, Alzbutas G, Rokaitis I, Matjošaitis K, Mackevicius G, Žeimyte S, Karpus L, Lubys A
Journal:Microb Genom
PubMed ID:34473015
Sequence-based characterization of bacterial communities has long been a hostage of limitations of both 16S rRNA gene and whole metagenome sequencing. Neither approach is universally applicable, and the main efforts to resolve constraints have been devoted to improvement of computational prediction tools. Here, we present semi-targeted 16S rRNA sequencing (st16S-seq), ... More