Collibri™ PS DNA Library Prep Kits for Illumina Systems

Das Invitrogen Collibri PS DNA-Bibliothek-Vorbereitungskit dient zur Vorbereitung von Bibliotheken für die Sequenzierung ganzer Genome (WGS) auf Illumina Systemen mit hohem Durchsatz für die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS). Das Kit eignet sich für physisch gescherte (PS) Genome aller Größen und mit variabler Qualität, darunter FFPE-Proben.

Das Collibri PS DNA-Bibliothek-Vorbereitungskit:
• Bietet für jeden Prozessschritt ein integriertes visuelles Feedback zur Bestätigung der richtigen Mischung von Reagenzien für die höchste Erfolgsquote bei der Vorbereitung von Bibliotheken
• Umfasst alle erforderlichen Komponenten in einem einzigen Kit
• Bietet eine konsistente, gleichmäßige Abdeckung variabler GC-Regionen auch schon bei äußerst geringen Zugaben von 1 bis 1.000 ng
• Bietet im Vergleich zu bereits verfügbaren Vorbereitungstechnologien für Bibliotheken eine bessere Abdeckung schwieriger genomischer Regionen
• Bietet bis zu 96 kombinatorische oder eindeutige Doppelindizes
• Kompatibel mit der automatisierten Bibliothek-Vorbereitung

Das Collibri PS DNA-Bibliothek-Vorbereitungskit enthält Inertfarbstoffe, die bei der Vorbereitung ein visuelles Feedback liefern: Die Reaktionsgemische ändern nach dem Hinzufügen entscheidender Komponenten in jedem Schritt ihre Farbe. Die Inertfarbstoffe haben keine Auswirkungen auf die enzymatischen Reaktionen und beeinträchtigen die Sequenzierungsergebnisse nicht.

Das Collibri PS DNA-Bibliothek-Vorbereitungskit bietet durchgehend zuverlässigere SNP- und INDEL-Calls, da schwierige genomische Regionen von verschiedensten äußerst verschiedensten Eingaben (1 ng bis 1 µg) physisch gescherter doppelsträngiger DNA besser erfasst werden (siehe Abbildung unten). Zusätzlich ist eine PCR-freie Version für Eingaben ab 500 ng DNA erhältlich. Das gesamte Protokoll für die Bibliothek-Vorbereitung dauert für den PCR-Arbeitsablauf etwa 3,5 Stunden. Das Kit enthält Adapter mit eindeutigen Doppelindizes (UDIs) oder kombinatorischen Doppelindizes (CDs), die das Pooling von bis zu 24 oder 96 verschiedenen Proben vor der Sequenzierung ermöglichen.

Anwendungen
Das Collibri PS DNA-Bibliothek-Vorbereitungskit wird für folgende Zwecke empfohlen:
• Sequenzierung ganzer Genome
• Resequenzierung
• De-novo-Zusammensetzung