Bei der Integration in die DNA stellt 5-(3-Aminoallyl)-dUTP eine reaktive Gruppe für die Hinzufügung anderer chemischer Gruppen bereit
Have Questions?
Katalognummer
Menge
AM8439
50 μl
Katalognummer AM8439
Preis (EUR)
368,00
Each
Menge:
50 μl
Großbestellung oder individuelle Größe anfordern
Preis (EUR)
368,00
Each
Bei der Integration in die DNA stellt 5-(3-Aminoallyl)-dUTP eine reaktive Gruppe für die Hinzufügung anderer chemischer Gruppen bereit. Das modifizierte dUTP wird leicht durch reverse Transkriptase integriert. Die Aminoallyl-Modifikation ermöglicht eine Downstream-Reaktion mit aminreaktiven Verbindungen wie N-Hydroxysuccinimid-Estern (NHS); daher kann aminoallyl-modifizierte cDNA mit jedem aminreaktiven Gruppenteil markiert werden.
Verwendung dieser modifizierten Nukleotide: Verwenden Sie 5-(3-Aminoallyl)-dUTP, wie in Ihrem Protokoll für die reverse Transkription empfohlen. Die Substitution von 30 bis 80 % des dTTP durch 5-(3-Aminoallyl)-dUTP kann nützlich sein, aber der genaue Anteil hängt von den experimentellen Targets ab.
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
Specifications
ProduktlinieAmbion
ProdukttypNukleotide
ReinigungsverfahrenHPLC
Menge50 μl
VersandbedingungTrockeneis
Konzentration50 mmol
Zur Verwendung mit (Anwendung)Markierung von Nukleinsäuren
FormFlüssig
Marker oder FarbstoffAminoallyl
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
Bei mindestens -70 °C lagern Mehrere Gefrier- und Auftauzyklen vermeiden. Aliquoten des Produkts können kurzfristig bei -20 °C gelagert werden Nicht in frostfreien Gefriergeräten lagern.
Häufig gestellte Fragen (FAQ)
Why are there only two amino-modified nucleotides in the dNTP mix for cDNA indirect labeling (aminoallyl-dUTP and aminohexyl-dATP) intead of all four nucleotides being modified? Would more modified nucleotides have an adverse effect on the microarray?
Using four modified nucleotides rather than two can cause fluorescence quenching since the fluorophores are positioned very closely to one another. Use of two amino-modified nucleotides in the cDNA synthesis reaction (rather than one) results in a greater incorporation of fluorescent dye and higher signal intensity with small amounts of RNA starting material. Unbiased incorporation of amino-modified dNTPs and the high efficiency of the coupling reaction result in an even distribution of fluorescent signal and high overall levels of fluorescence, increasing the sensitivity and reproducibility of array hybridizations. In addition to quenching, a very high dye density on the cDNA will interfere with hybridization and, therefore, yield lower microarray fluorescence signals. We found that the use of 2 amino-modified nucleotides (at the appropriate concentration) results in optimal incorporation and high microarray signals.
Can dU-containing DNA produced by amplification with dUTP be cut by restriction enzymes?
You will need to confirm with the manufacturer of the restriction enzyme you are using to find out whether or not it can recognize dUTP-containing DNA.