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Invitrogen™

pENTR™/SD/D-TOPO™ Cloning Kit, with One Shot™ TOP10 Chemically Competent E. coli

Die pENTR™/SD/D-TOPO™ Cloning Kits nutzen eine äußerst effiziente 5-minütige Klonierungsstrategie (“TOPO™ Cloning”) für die direktionale Klonierung eines stumpfendigen PCR-Produkts inWeitere Informationen
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KatalognummerMenge
K24202020 Reaktionen
Katalognummer K242020
Preis (EUR)
1.026,00
Each
Menge:
20 Reaktionen
Preis (EUR)
1.026,00
Each
Die pENTR™/SD/D-TOPO™ Cloning Kits nutzen eine äußerst effiziente 5-minütige Klonierungsstrategie (“TOPO™ Cloning”) für die direktionale Klonierung eines stumpfendigen PCR-Produkts in einen Vektor zur Verabreichung in ein Gateway™ oder MultiSite Gateway™ System. Stumpfendige PCR-Produkte klonen bei einer Effizienz von über 90 % direktional in pENTR™/SD/D-TOPO™ Entry-Vektoren und enthalten eine vorgeschaltete Shine-Dalgarno-Sequenz zur Expression in Prokaryoten.

Das Kit enthält alles, was zum Klonen und Auswählen Ihres PCR-amplifizierten Gens von Interesse erforderlich ist:

Gateway™ System-tauglich – schneller Transfer geklonter Gene zwischen mehreren Vektorsystemen
Schnell und einfach – von der PCR bis zum Gateway™ Entry-Klon in nur 3 Schritten und nur 5 Minuten Bearbeitungszeit
Effizient – erzielen Sie über 90 % Klone mit dem Insert in der richtigen Orientierung
Bewährt – zuverlässige Leistung seit über 10 Jahren

Übersicht über pENTR™SD/D-TOPO™ Klonierungs-Kits

VEKTOR

pENTR™/SD/D-TOPO™ Vektor Direktionaler Klonierungsvektor für die Eingabe in das Gateway™ System mit Optimierung für die prokaryotische Expression

KLONIERUNGSMETHODE

Direktionale TOPO™ Klonierung Topoisomerase-I-basierte, ∼5 Minuten lange direktionale Ligation stumpfendiger, mit Proofreading-Polymerase amplifizierter PCR-Produkte mit dem Vektor

KOMPETENTE ZELLEN

Zwei Optionen Wählen Sie zwischen Kits für hohe Effizienz oder schnell wachsenden kompetenten Zellen
Einfacher Zugriff auf das Gateway™ System
Für einen Zugang zum Gateway™ System machen Sie eine PCR-Amplifikation des zu untersuchenden Gens und fügen das Produkt direkt dem mitgelieferten Topoisomerase-geladenen pENTR™/SD/D-TOPO™ Vektor hinzu. Danach müssen Sie 5 Minuten lang inkubieren und die mitgelieferten kompetenten E. coli-Zellen transformieren. Die daraus resultierenden Gateway™ Entry-attL-Klone sind nun für eine effiziente Rekombination mit den gewünschten Gateway™ Zielvektoren bereit.

Optimierter pENTR™/SD/D-TOPO™ Vektor
Der pENTR™/SD/D-TOPO™ Vektor (Abb. 1) enthält einen T7-Gen-10-translationalen Enhancer und eine Ribosombindungsstelle (RBS) für eine optimale Expression von nativem Protein nach der Rekombination mit einem prokaryotischen Gateway™ Zielvektor. Sie können den Vektor auch zur Expression in anderen Wirtssystemen durch Rekombination mit verschiedenen Zielvektoren verwenden. Der Vektor hat M13- und T7-Primer-Sequenzierungsstellen und attL-Rekombinationsstellen, die die PCR-Produkt-Insertionsstelle flankieren. Die Klone können deshalb problemlos in die Gateway™ Destination-attR-Vektoren Ihrer Wahl sequenzverifiziert und rekombiniert werden. Ein Kanamycin-Resistenz-Gen und ein pUC-Ursprung dienen der Selektion und hohen Kopiepropagation in E. coli.

Vereinfachte direktionale Klonierung
Bei der Technologie zur direktionalen TOPO™ Klonierung sind keine PCR-Aufreinigungen, Vektorvorbereitungen oder andere zeitintensive DNA-Manipulationsschritte erforderlich. Fügen Sie einfach Ihre PCR-Reaktion direkt dem mitgelieferten Topoisomerase-geladenen Vektor hinzu. Inkubieren Sie 5 Minuten lang, führen Sie die Transformation aus, und Sie erhalten bis zu 90 % direktional eingefügte Klone. Ein vierbasiger Überhang auf den Vektorpaaren mit einer vierbasigen Sequenz im Vorwärts-Primer in Ihrer PCR-Reaktion sorgt für Direktionalität zur Topoisomerase-Ligationsreaktion (Abbildung 2).

Die Leistungsfähigkeit der Gateway™ Rekombinations-Klonierungstechnologie
Die Gateway™ Rekombinations-Klonierungstechnologie umgeht die Einschränkungen der restriktionsbasierten Klonierung. Sie haben auf diese Weise Zugang zu praktisch jedem Expressionssystem dank einer einstündigen, bis 99 % effizienten und reversiblen Gateway™ Rekombinationsreaktion. Die Möglichkeit, dieselbe DNA-Sequenz zwischen verschiedenen Vektoren ohne Anwendung von Restriktionsenzymen, Ligase, Subklonierungsschritten, Screening von zahllosen Kolonien oder Resequenzierungen zu wechseln, hilft dabei, Zeit, Kosten und Aufwand zu sparen.

Führende Klonierungstechnologien
Wenn es um Klonierung geht, sind seit über zehn Jahren die TOPO™ Klonierungstechnologie und die Gateway™ Rekombinationsklonierung der zuverlässige Partner Tausender von Wissenschaftlern. Die schnelle, einfache und effiziente Rekombination der TOPO™-Klonierung und Gateway™-Rekombination ermöglicht ein schnelles Klonen und dem anschließenden Transfer von Genen zwischen einer Vielzahl von Gateway™-Expressionsvektoren.

Kit-Optionen
Das pENTR™/SD/D-TOPO™-Klonierungskit kann entweder mit TOP10-kompetenten Zellen zur Standardklonierung oder mit Mach1™-T1R-kompetenten Zellen für schnelles Wachstum erworben werden.
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
Specifications
KlonierungsmethodeDirektionales TOPO™
Anzahl Reaktionen20 reactions
ProduktlinieOne Shot
ProdukttypTOPO-Klonierungskit
Menge20 Reaktionen
VektorpENTR
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
Das pENTR™⁄SD-TOPO™ Cloning Kit enthält pENTR⁄SD-TOPO™ Vektor, dNTPs, Salzlösung, steriles Wasser, universelle M13-Sequenzierprimer, chemische OneShot™ TOP10 E. coli, S.O.C. Medium und ein pUC19 Kontrollplasmid. Lagerung kompetenter E. coli bei -80 °C. Alle anderen Komponenten bei –20 °C lagern.

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

Your Gateway-adapted TOPO vectors are supplied with a control template and control primers. Can I obtain the sequence of the control template?

The sequence of the control template is proprietary.

I am using a Directional TOPO Cloning vector for cloning my PCR product. I have screened a bunch of colonies but they all contain my insert cloned in the reverse direction. How can I solve this problem?

Here are possible causes and suggestions:

- Incorrect PCR primer design: Make sure that the forward PCR primer contains the sequence, CACC, at the 5' end. The 4 nucleotides, CACC, base pair with the overhang sequence, GTGG, in the Directional TOPO vector.
- Reverse PCR primer is complementary to the GTGG overhang at the 5' end: Make sure that the reverse PCR primer does not contain the sequence, CACC, at the 5' end.
- Use a thermostable, proofreading polymerase such as Accuprime Pfx DNA Polymerase (Cat. No. 12344024) to produce blunt-end PCR products.

What is the best molar ratio of PCR product:vector to use for TOPO TA cloning? Is there an equation to calculate the quantity to use?

We suggest starting with a molar ratio of 1:1 (insert:vector), with a range of 0.5:1 to 2:1. The quantity used in a TOPO cloning reaction is typically 5-10 ng of a 2 kb PCR product.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 (insert:vector ratio)

What is the best ratio of insert:vector to use for cloning? Is there an equation to calculate this?

The optimal ratio is 1:1 insert to vector. Optimization can be done using a ratio of 0.5-2 molecules of insert for every molecule of the vector.

Equation:

length of insert (bp)/length of vector (bp) x ng of vector = ng of insert needed for 1:1 insert:vector ratio

I am cloning my gene of interest into the pENTR/SD/D-TOPO vector, but plan on expressing my gene in both E.coli and mammalian cells. Will the Shine-Dalgarno sequence interfere with mammalian expression?

No, the Shine-Dalgarno sequence does not adversely affect mammalian expression when used in an appropriate mammalian DEST vector.

Zitierungen und Referenzen (1)

Zitierungen und Referenzen
Abstract
Pseudomonas syringae type III secretion system targeting signals and novel effectors studied with a Cya translocation reporter.
Authors:Schechter LM, Roberts KA, Jamir Y, Alfano JR, Collmer A,
Journal:J Bacteriol
PubMed ID:14702323
Pseudomonas syringae pv. tomato strain DC3000 is a pathogen of tomato and Arabidopsis: The hrp-hrc-encoded type III secretion system (TTSS), which injects bacterial effector proteins (primarily called Hop or Avr proteins) into plant cells, is required for pathogenicity. In addition to being regulated by the HrpL alternative sigma factor, most ... More