ProSightPD-Software

Führen Sie mit der Thermo Scientific™ ProSightPD™ Software eine umfassende Analyse der Top-down-Proteomikdaten durch. ProSightPD verfügt über robuste proteomische Suchmaschinen für die Charakterisierung der Proteoform, einschließlich Proteoformen mit unbekannten PTMs oder Abschneidungen. Die ProSightPC-Software unterstützt proteomische Daten, die durch Fragmentierungstechniken in Thermo Scientific Massenspektrometern erzeugt wurden. ProSightPC ist die einzige Proteomik-Software, mit der Anwender ihre MS/MS-Daten mit den Daten aus Proteom-Bibliotheken vergleichen können, die die biologische Komplexität enthalten, die in UniProt zu finden ist.

• Enthält fünf verschiedene Datenbanksuchmodi – Sequenz-Tag, einzelnes Protein und genspezifische Suche – für eine außergewöhnliche Charakterisierung intakter Proteine.–
• Führt Berechnungen zur Fehlerkennungsrate auf der Ebene von Protein, Isoform, Proteoform und Proteoform-Treffern durch.
• Verarbeitet viele verschiedene Arten von Fragmentierungsdaten, einschließlich Daten, die mit ETD, HCD, EThcD, UVPD, ECD, IRMPD oder CID generiert wurden.
• Ermöglicht das Zusammenführen von grafischen Fragmentkarten, selbst von Karten mit unterschiedlichen Ionentypen.
• Umfasst das proprietäre ProSight mit allen bekannten posttranslationalen Modifikationen (PTMs), alternativen Spleißereignissen und Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs)
• Bietet eine robustere Analyse der Vorläufermasse mit FAIMS- und PTR-Daten, die jetzt mit der Software ProSightPD leicht analysierbar sind. Sowohl hoch- als auch niederauflösende Daten können mit den in der Software ProSightPD eingebetteten Xtract- und Respekt-Algorithmen verarbeitet werden, die die Analyse von Massen aus einem breiten Massenbereich (∼1 kDa bis >150 kDa) ermöglichen.
• Importiert FASTA-Datenbanken und aktualisiert diese mit allen möglichen Modifikationen
• Ermöglicht Anwendern eine unvergleichliche, vielseitige Visualisierung für die Überprüfung von Suchergebnissen und die Anpassung von Modifikationen, um bessere Ergebnisse zu finden.