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Thermo Scientific™

Pierce™ Magnetic ChIP Kit

Le kit de ChIP magnétique Pierce Thermo Scientific fournit une méthode pratique pour isoler efficacement l’ADN lié à la chromatineAfficher plus
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RéférenceQuantité
261571 kit
Référence 26157
Prix (EUR)
878,00
Each
Quantité:
1 kit
Grand volume ou format personnalisé
Prix (EUR)
878,00
Each
Le kit de ChIP magnétique Pierce Thermo Scientific fournit une méthode pratique pour isoler efficacement l’ADN lié à la chromatine par immunoprécipitation (IP de la chromatine) en vue de l’analyse quantitative ultérieure par PCR.

Caractéristiques du kit de ChIP magnétique :

Rapide : obtention d’ADN purifié prêt pour la PCR quantitative en environ 8 heures
Efficace et reproductible : digestion à la nucléase micrococcale et lyse nucléaire hautement optimisées
Sensible : obtention de résultats avec seulement 10 000 cellules (1 x 10^4)
Faible bruit de fond : microbilles magnétiques de protéine A / G bloquées dans un réactif exempt de toute trace d’ADN pour réduire le bruit de fond au minimum
Complet : réactifs de contrôle positif optimisés inclus : anticorps anti-ARN polymérase II et amorces pour PCR pour le promoteur GAPDH

Le kit de ChIP magnétique Pierce contient suffisamment de réactifs pour réaliser 30 dosages par immunoprécipitations de la chromatine (ChIP) avec les contrôles adéquats à l’aide d’un protocole optimisé. Le kit comprend des réactifs pour réaliser la lyse des cellules, la capture des complexes protéine-ADN, la déréticulation et l’isolement de l’ADN. Les microbilles magnétiques-protéine A / G bloquées de Pierce sont caractérisées par une forte capacité de liaison et un faible bruit de fond non spécifique. De plus, elles fonctionnent avec des anticorps issus d’un grand nombre d’espèces. Ces microbilles peuvent être utilisées manuellement avec un support magnétique ou bien avec une plateforme automatique telle qu’un appareil Thermo Scientific KingFisher. Des anticorps validés pour la ChIP et de qualité garantie sont également disponibles pour une utilisation avec le kit de ChIP magnétique Pierce.

Comprend :
Le kit contient des réactifs pour la préparation de la chromatine, l’immunoprécipitation, la purification de l’ADN et des contrôles positifs (anticorps et amorces).

Nécessite :
Agent de réticulation in vivo (comme le formaldéhyde), sonicateur à micro pointe (comme le sonicateur Misonix™ 3000), anticorps de spécificité souhaitée compatible avec la ChIP, amorces pour PCR pour la séquence d’ADN étudiée, Master Mix pour PCR (contenant un colorant tel le SYBR™ Green, en cas de qPCR) et un instrument de qPCR

Applications :
• Déterminer les sites d’interactions protéine-ADN spécifiques sur l’ADN génomique par PCR ou ChIP-Seq
• Surveiller les effets des modifications des histones ou des agents chimiques sur la liaison à l’ADN

Le succès des dosages par ChIP exige un certain nombre d’étapes cruciales (réticulation, préparation de la chromatine, immunoprécipitation) avant de détecter l’ADN génomique cible. L’optimisation de chacune de ces étapes peut prendre un temps considérable. Le kit de ChIP magnétique Pierce Thermo Scientific simplifie le processus ChIP pour permettre l’obtention de résultats précis et reproductibles.

Les complexes protéine-ADN sont tout d’abord réticulés in vivo dans le formaldéhyde. Le kit contient les réactifs nécessaires pour la lyse des cellules et l’extraction et la solubilisation des complexes réticulés. Les complexes sont ensuite incubés avec un anticorps spécifique puis isolés à l’aide des microbilles magnétiques protéine A/G Pierce. Après la déréticulation et la digestion des protéines, les fragments d’ADN obtenus sont purifiés pour pouvoir être analysés par PCR standard ou quantitative.

Plus de données sur le produit
Analyse de la régulation indépendante et dépendante de l’androgène de l’activité transcriptionnelle

Produits associés
Kit de ChIP magnétique Pierce™
Microbilles magnétiques de protéine A / G de qualité ChIP Pierce™
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.
Spécifications
DescriptionKit de ChIP magnétique Pierce
FormatKit
Contenus des kits4 x 10^6 cellules par réaction
Quantité1 kit
Suffisant pour30 réactions
Capacité (métrique)4 × 10^6 cellules par réaction
Gamme de produitsPierce
TypeKit ChIP pour microbilles magnétiques
Unit SizeEach
Contenu et stockage
• Solution de glycine (10X), 15 ml ; stocker à température ambiante
• PBS (20X), 15 ml ; stocker à 4°C
• Cocktail inhibiteur de protéases et de phosphatases Halt™, exempt d’EDTA (100X), 1 ml ; stocker à 4°C
• Tampon d’extraction de membrane, 10 ml ; stocker à 4°C
• Tampon de digestion MNase, 10 ml ; stocker à 4°C
• DTT (7,7 mg), lyophilisé, 2 flacons ; stocker à température ambiante ou à 4°C
• Solution d’arrêt MNase, 1 ml ; stocker à 4°C
• Microbilles magnétiques de protéine A / G de qualité ChIP, 0,7 ml ; stocker à 4°C
• Tampon de dilution / lavage IP (5X), 40 ml, stocker à 4°C
• Chlorure de sodium (5 M), 6 ml ; stocker à 4°C
• Tampon d’élution IP (2X), 4,5 ml ; stocker à 4°C
• Microtubes à centrifuger, 1,5 ml, 75 tubes ; stocker à température ambiante ou à 4°C
• Colonnes et réactifs de nettoyage de l’ADN, 40 purifications ; stocker à température ambiante ou à 4°C
• Colonne de nettoyage de l’ADN, 40 colonnes
• Solution de liaison de colonne ADN, 30 ml
• Solution de lavage de colonne ADN, 6 ml
• Indicateur de pH, 0,8 ml
• Solution d’élution pour colonne ADN, 5 ml
• Nucléase micrococcale (qualité ChIP) (10 U / µl), 50 µl ; stocker à -20°C
• Anticorps de l’ARN polymérase II, 25 µl ; stocker à -20°C
• IgG de lapin normale (1 mg / ml), 10 µl ; stocker à -20°C
• Protéinase K (20 mg / ml), 0,25 ml ; stocker à -20°C
• Amorces de contrôle positif pour ChIP (promoteur GAPDH, spécifique à l’homme), 100 µl ; stocker à -20°C

Foire aux questions (FAQ)

With my ChIP assay (Agarose ChIP Kit/Magnetic ChIP Kit), the qPCR signal (cycle threshold) from my positive and negative controls show no difference or are very close. Why is this?

-Verify that your specific antibody (if not using the kit-provided RNA polymerase II antibody) is validated for IP. Ideally, a ChIP validated antibody is the best, but an antibody for IP has a good chance of working in ChIP.
-Ensure that your chromatin is properly digested (see Appendix A in the manual). Too much digestion as well as too little digestion will affect the success of the ChIP reaction.
-Ensure that all the chromatin has been released from the nuclei. When following the Magnetic ChIP kit instructions, MNase digestion of 4x106 cells followed by sonication to lyse the nuclei, yields about 20-50 µg for the IP. This same sequence can be used with the Agarose ChIP Kit as well. It is recommended that you start with 2–4 x 106 cells per ChIP reaction. Once a successful ChIP has been run at this cell number, it is possible to decrease the cell amount empirically. We have seen good results using as little at 10,000 cells, but this entirely depends on the cell line, target, and antibody.
-Ensure that enough DNA was used for qPCR. Typically, 30-80 ng of DNA is a good range.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the experimental IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient amount of antibody added to the IP: Add more antibody to the IP.
- Antibody did not function in an IP: Verify that the antibody is qualified for CHIP or IP applications and has been handled and stored properly.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause PCR signal of the positive and negative control IP samples to be equivalent?

Here are possible causes and solutions:

- Excess chromatin or antibody added to the IP: Add less chromatin or antibody.
- PCR amplification was measured outside the linear range of amplification: Decrease the number of amplification cycles used in the PCR reaction.
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Add more sample DNA to the PCR reaction.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the positive control IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient chromatin amount in the IP reaction: Use at least 25 µg of chromatin for each IP.
- Insufficient antibody incubation time: Incubate antibody overnight.
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis.
- Low-abundance target: Add more chromatin or magnetic beads (30 µL).

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the total input control samples?

Here are possible causes and solutions:

- PCR amplification conditions were not fully optimized: Optimize PCR conditions using samples known to contain the target amplicon; Check primer design
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Increase the amount of sample DNA added to the PCR reaction
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis