Product Image
Thermo Scientific™

Pierce™ Magnetic ChIP Kit

Das Thermo Scientific Pierce Magnetic ChIP Kit bietet eine praktische Methode für die effiziente Isolierung von Chromatin-gebundener DNA durch ImmunpräzipitationWeitere Informationen
Have Questions?
KatalognummerMenge
261571 Kit
Katalognummer 26157
Preis (EUR)
816,65
Exklusiv online
878,00
Ersparnis 61,35 (7%)
Each
Menge:
1 Kit
Großbestellung oder individuelle Größe anfordern
Preis (EUR)
816,65
Exklusiv online
878,00
Ersparnis 61,35 (7%)
Each
Das Thermo Scientific Pierce Magnetic ChIP Kit bietet eine praktische Methode für die effiziente Isolierung von Chromatin-gebundener DNA durch Immunpräzipitation (Chromatin IP) für die anschließende Quantifizierung durch PCR.

Merkmale des Magnetic ChIP-Kits:

Schnell – Gereinigte für die quantitative PCR bereite DNA in ca. 8 Stunden
Effizient und reproduzierbar – Micrococcus-Nucleaseverdau und Kernlyse sind hochoptimiert
Empfindlich – Ergebnisse mit nur 10.000 Zellen (1 x 10^4) erzielen
Geringer Hintergrund – Pierce Protein A/G Magnetbeads mit niedrigem Hintergrund werden in einem nicht-DNA-haltigen Reagenz blockiert, um den Hintergrund zu minimieren
Komplett – Optimierte positive Kontrollreagenzien sind im Lieferumfang enthalten: RNA Polymerase II Antikörper und GAPDH Promoter PCR Primer

Das Pierce Magnetic ChIP Kit enthält Reagenzien und passende Kontrollen, die für 30 Chromatin-Immunpräzipitationen (ChIP) mit optimiertem Protokoll ausreichen. Im Kit enthalten sind Reagenzien für die Zelllyse, das Auffangen von Protein-DNA-Komplexen, die Aufhebung der Vernetzung und die Isolierung von DNA. Die blockierten Pierce Protein A/G Magnetbeads zeichnen sich durch ein hohes Bindungsvermögen sowie einen niedrigen unspezifischen Hintergrund aus und eignen sich für viele Antikörperarten. Diese Beads können manuell mit einem magnetischen Ständer oder mit einer automatisierten Plattform wie Thermo Scientific KingFisher Instrumenten verwendet werden. ChIP-validierte und qualitätsgesicherte Antikörper sind auch für die Verwendung mit dem Pierce Magnetic ChIP Kit erhältlich.

Enthält:
Kit enthält Reagenzien für die Chromatinvorbereitung, IP, DNA-Reinigung und Positivkontrollen (Antikörper und Primer)

Erfordert:
In-vivo -Crosslinker (z. B. Formaldehyd), Mikrotiterspitzensonator (z. B. Misonix™ Sonator 3000), ChIP-qualifizierter Antikörper der Wahl, PCR-Primer für die DNA-Sequenz von Interesse, PCR-Mastermix (mit Farbstoff wie SYBR™ Green, falls qPCR gewünscht) und ein qPCR-Gerät

Anwendungen:
• Bestimmen Sie Stellen spezifischer Protein-DNA-Interaktionen auf genomischer DNA durch PCR oder ChIP-Seq
• Überwachen Sie die Auswirkungen von Histonmodifikationen oder chemischen Wirkstoffen auf die DNA-Bindung

. Ein erfolgreicher ChIP-Assay erfordert eine Reihe kritischer Schritte (Vernetzung, Chromatinvorbereitung, Immunpräzipitation), bevor Sie die genomische Ziel-DNA nachweisen können. Die Optimierung dieser Einzelschritte des ChIP-Protokolls kann zeitraubend sein. Das Thermo Scientific Pierce Magnetic ChIP Kit vereinfacht den ChIP-Prozess und ermöglicht präzise und reproduzierbare Ergebnisse.

Protein-DNA-Komplexe werden zuerst in vivo mit Formaldehyd vernetzt. Das Kit enthält Reagenzien für die Lyse der Zellen sowie die Extraktion und Solubilisierung der quervernetzten Komplexe. Die Komplexe werden anschließend mit einem spezifischen Antikörper inkubiert und mit Pierce Protein A/G Magnetbeads isoliert. Nach der Umkehrung von Kreuzverbindungen und dem Proteinverdau werden die entstehenden DNA-Fragmente gereinigt und sind dann für die Standard- oder quantitative PCR bereit.

Weitere Produktdatenanalyse
Analyse der von Androgen-abhängigen und -unabhängigen Regulation transkriptioneller Aktivitäten

Ähnliche Produkte
Pierce™ Magnetic ChIP Kit
Pierce™ ChIP-Grade Protein A/G Magnetic Beads
Nur für Forschungszwecke. Nicht zur Verwendung bei diagnostischen Verfahren.
Specifications
BeschreibungPierce Magnetic ChIP Kit
FormatKit
Kitinhalt4 x 10^6 Zellen pro Reaktion
Menge1 Kit
Ausreichend für30 Reaktionen
Kapazität (metrisch)4 × 10^6 Zellen pro Reaktion
ProduktliniePierce
TypMagnetic Bead ChIP-Kit
Unit SizeEach
Inhalt und Lagerung
• Glycin-Lösung (10x), 15 ml; bei Raumtemperatur lagern
• PBS (20x), 15 ml; bei 4 °C
lagern • Halt™ Protease and Phosphatase Inhibitor Cocktail, EDTA-frei (100x), 1 ml; bei 4 °C
• Membran-Extraktionspuffer, 10 ml; bei 4 °C
lagern • MNase Verdauungspuffer, 10 ml; bei 4 °C
lagern • DTT (7,7 mg), lyophilisiert, 2 Fläschchen; bei Raumtemperatur oder 4 °C
lagern • MNase Stopperlösung, 1 ml; bei 4 °C
lagern• ChIP-Grade Protein A/G Magnetbeads, 0,7 ml; bei 4 °C
lagern • IP-Verdünnungs-/Waschpuffer (5x), 40 ml, bei 4 °C
lagern • Natriumchlorid (5 Mol), 6 ml lagern; bei 4 °C
lagern• IP-Elutionspuffer (2x), 4,5 ml; bei 4 °C
lagern • Mikrozentrifugenröhrchen, 1,5 ml, 75 Röhrchen; Lagerung bei Raumtemperatur oder 4 °C
lagern • DNA-Aufbereitungssäule und Reagenzien, 40 Aufreinigungen; Lagerung bei Raumtemperatur oder 4 °C
• DNA-Clean-Up-Säule, 40 Säulen
• DNA-Säulenbindungslösung, 30 ml
• DNA-Säulenwaschlösung, 6 ml
• pH-Indikator, 0,8 ml
• DNA Säulenelutionslösung, 5 ml
• Mikrococcus-Nuclease (ChIP-Klasse) (10 E/µl), 50 µl; bei -20 °C
lagern• Anti-RNA-Polymerase-II-Antikörper, 25 µl; bei -20 °C
lagern• normale Kaninchen-IgG (1 mg/ml), 10 µl; bei -20 °C
lagern • Proteinase K (20 mg/ml), 0,25 ml; bei -20 °C
lagern• ChIP-Positivkontrollprimer (GAPDH Promotor, speziell für den Menschen), 100 µl; bei -20 °C lagern

Häufig gestellte Fragen (FAQ)

With my ChIP assay (Agarose ChIP Kit/Magnetic ChIP Kit), the qPCR signal (cycle threshold) from my positive and negative controls show no difference or are very close. Why is this?

-Verify that your specific antibody (if not using the kit-provided RNA polymerase II antibody) is validated for IP. Ideally, a ChIP validated antibody is the best, but an antibody for IP has a good chance of working in ChIP.
-Ensure that your chromatin is properly digested (see Appendix A in the manual). Too much digestion as well as too little digestion will affect the success of the ChIP reaction.
-Ensure that all the chromatin has been released from the nuclei. When following the Magnetic ChIP kit instructions, MNase digestion of 4x106 cells followed by sonication to lyse the nuclei, yields about 20-50 µg for the IP. This same sequence can be used with the Agarose ChIP Kit as well. It is recommended that you start with 2–4 x 106 cells per ChIP reaction. Once a successful ChIP has been run at this cell number, it is possible to decrease the cell amount empirically. We have seen good results using as little at 10,000 cells, but this entirely depends on the cell line, target, and antibody.
-Ensure that enough DNA was used for qPCR. Typically, 30-80 ng of DNA is a good range.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the experimental IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient amount of antibody added to the IP: Add more antibody to the IP.
- Antibody did not function in an IP: Verify that the antibody is qualified for CHIP or IP applications and has been handled and stored properly.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause PCR signal of the positive and negative control IP samples to be equivalent?

Here are possible causes and solutions:

- Excess chromatin or antibody added to the IP: Add less chromatin or antibody.
- PCR amplification was measured outside the linear range of amplification: Decrease the number of amplification cycles used in the PCR reaction.
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Add more sample DNA to the PCR reaction.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the positive control IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient chromatin amount in the IP reaction: Use at least 25 µg of chromatin for each IP.
- Insufficient antibody incubation time: Incubate antibody overnight.
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis.
- Low-abundance target: Add more chromatin or magnetic beads (30 µL).

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the total input control samples?

Here are possible causes and solutions:

- PCR amplification conditions were not fully optimized: Optimize PCR conditions using samples known to contain the target amplicon; Check primer design
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Increase the amount of sample DNA added to the PCR reaction
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis