Pierce™ Magnetic ChIP Kit
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Pierce™ Magnetic ChIP Kit

El kit ChIP magnético Thermo Scientific Pierce proporciona un método conveniente para el aislamiento eficaz de ADN unido a cromatinaMás información
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Número de catálogoCantidad
261571 kit
Número de catálogo 26157
Precio (MXN)
-
Cantidad:
1 kit
Pedido a granel o personalizado
El kit ChIP magnético Thermo Scientific Pierce proporciona un método conveniente para el aislamiento eficaz de ADN unido a cromatina mediante inmunoprecipitación (IP de cromatina) para la posterior cuantificación mediante PCR.

Características del kit de ChIP magnético:

Rápido: se obtiene ADN purificado que está listo para PCR cuantitativa en aproximadamente 8 horas
Eficaz y reproducible: la digestión de la nucleasa microcócica y la lisis nuclear están altamente optimizadas
Sensible: se obtienen resultados con tan solo 10.000 células (1 x 10^4)
Fondo bajo: los gránulos magnéticos de proteína A/G Pierce están bloqueados en un reactivo que no contiene ADN para minimizar el fondo
Completo: se incluyen reactivos de control positivo optimizados: Anticuerpo frente a la ARN polimerasa II y primers de PCR para el promotor de GAPDH

El kit de ChIP magnético contiene suficientes reactivos para realizar 30 ensayos de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) con los controles apropiados usando un protocolo optimizado. El kit incluye reactivos para la lisis celular, para la captura de los complejos proteína-ADN, la reversión del entrecruzamiento y el aislamiento del ADN. Las microesferas magnéticas Pierce con proteína A/G bloqueadas proporcionan alta capacidad de unión, bajo fondo no específico y trabajan con muchos tipos de anticuerpos. Estas microesferas pueden usarse manualmente con un soporte magnético o con plataformas automáticas, como los aparatos Thermo Scientific KingFisher. También se dispone de anticuerpos ChIP validados y de calidad garantizada para su uso con el kit de ChIP magnético Pierce.

Incluye:
El kit contiene reactivos para la preparación de la cromatina, IP, purificación de ADN y controles positivos (anticuerpo y primers)

Requiere:
Agente de entrecruzamiento in vivo (como formaldehído), sonicador de micropunta (como Misonix™ Sonicator 3000), anticuerpo de elección cualificado para ChIP, primers de PCR para la secuencia de ADN de interés, mezcla patrón para PCR (contiene un colorante como SYBR™ Green, si se desea realizar una qPCR) y un termociclador para qPCR

Aplicaciones:
• Determina los sitios de interacciones proteína-ADN específicas en el ADN genómico mediante PCR o Chip-Seq
• Supervisa los efectos de las modificaciones de histonas o agentes químicos sobre la unión a ADN

Un ensayo de ChIP satisfactorio requiere la realización de una serie de pasos clave (entrecruzamiento, preparación de la cromatina e inmunoprecipitación) antes de detectar el ADN genómico diana. A nivel individual, la optimización de cada paso del protocolo ChIP puede ser laboriosa. El kit de ChIP magnético Thermo Scientific Pierce simplifica el proceso de ChIP, lo que permite resultados precisos y reproducibles.

Los complejos proteína-ADN se entrecruzaran primero in vivo con formaldehído. El kit contiene reactivos para la lísis celular y la extracción y solubilización de los complejos entrecruzados. A continuación, los complejos se incuban con un anticuerpo específico y se aíslan usando gránulos magnéticos Pierce de proteína A/G. Tras revertir los entrecruzamientos y digerir la proteína, los fragmentos de ADN resultantes se purificarán y estarán listos para PCR estándar o cuantitativa.

Más datos del producto
Análisis de la regulación independiente y dependiente de andrógenos de la actividad transcripcional

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Kit de ChIP magnético Pierce™-gránulos magnéticos proteínas A/G grado ChIP
Para uso exclusivo en investigación. No apto para uso en procedimientos diagnósticos.
Especificaciones
DescripciónPierce Magnetic ChIP Kit
FormatoKit
Contenido del kit4x10^6 células por reacción
Cantidad1 kit
Suficiente para30 reacciones
Capacidad (métrico)4×10^6 células por reacción
Línea de productosPierce
TipoKit ChIP de partícula magnética
Unit SizeEach
Contenido y almacenamiento
• Solución de glicina (10X), 15 ml; almacenar a temperatura ambiente
• PBS (20X), 15 ml; almacenar a 4 ° C
• Cóctel inhibidor de proteasa y fosfatasa Halt™, sin EDDTA (100X), 1 ml; almacenar a 4 ° C
• Tampón de extracción de membrana, 10 ml; almacenar a 4 ° C
• Tampón de digestión MNasa, 10 ml; almacenar a 4 °C
• DTT (7,7 mg), liofilizado, 2 viales; almacenar a temperatura ambiente o 4 ° C
• Solución de parada Mnasa, 1 ml; almacenar a 4 °C
• Gránulos magnéticos proteínas A/G grado ChIP, 0,7 ml; Almacenar a 4 ° C
• Tampón de dilución/lavado IP (5X), 40 ml, almacenar a 4 ° C
• Cloruro sódico (5M), 6 ml; almacenar a 4 °C
• Tampón de elución IP (2X), 4,5 ml; almacenar a 4 ° C
• Tubos de microcentrífuga, 1,5 ml, 75 tubos; almacenar a temperatura ambiente o 4 ° C
• Columna de limpieza de ADN y reactivos, 40 purificacioones; almacenar a temperatura ambiente o a 4 °C
• Columna de limpieza de ADN, 40 columnas
• Solución vinculante de columnas de ADN, 30 ml
• Solución de lavado de columnas de ADN, 6 ml
• Indicador de pH, 0,8 ml
• Solución de elución de columnas, 5 ml
• Nucleasa de micrococos (grado ChIP) (10U/µL) 50 µl; almacenar a - 20 ° C
• Anticuerpo anti-ARN polimerasa II, 25 µl; almacenar a - 20 ° C
• IgG de conejo normal (1 mg/ml), 10 µl; almacenar a - 20 ° C
• Proteinasa K (20 mg/ml), 0,25 ml; almacenar a - 20 ° C
• Primers de control positivo de ChIP (promotor GAPDH, específico humano), 100 µl; almacenar a - 20 ° C.

Preguntas frecuentes

With my ChIP assay (Agarose ChIP Kit/Magnetic ChIP Kit), the qPCR signal (cycle threshold) from my positive and negative controls show no difference or are very close. Why is this?

-Verify that your specific antibody (if not using the kit-provided RNA polymerase II antibody) is validated for IP. Ideally, a ChIP validated antibody is the best, but an antibody for IP has a good chance of working in ChIP.
-Ensure that your chromatin is properly digested (see Appendix A in the manual). Too much digestion as well as too little digestion will affect the success of the ChIP reaction.
-Ensure that all the chromatin has been released from the nuclei. When following the Magnetic ChIP kit instructions, MNase digestion of 4x106 cells followed by sonication to lyse the nuclei, yields about 20-50 µg for the IP. This same sequence can be used with the Agarose ChIP Kit as well. It is recommended that you start with 2–4 x 106 cells per ChIP reaction. Once a successful ChIP has been run at this cell number, it is possible to decrease the cell amount empirically. We have seen good results using as little at 10,000 cells, but this entirely depends on the cell line, target, and antibody.
-Ensure that enough DNA was used for qPCR. Typically, 30-80 ng of DNA is a good range.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the experimental IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient amount of antibody added to the IP: Add more antibody to the IP.
- Antibody did not function in an IP: Verify that the antibody is qualified for CHIP or IP applications and has been handled and stored properly.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause PCR signal of the positive and negative control IP samples to be equivalent?

Here are possible causes and solutions:

- Excess chromatin or antibody added to the IP: Add less chromatin or antibody.
- PCR amplification was measured outside the linear range of amplification: Decrease the number of amplification cycles used in the PCR reaction.
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Add more sample DNA to the PCR reaction.

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the positive control IP samples?

Here are possible causes and solutions:

- Insufficient chromatin amount in the IP reaction: Use at least 25 µg of chromatin for each IP.
- Insufficient antibody incubation time: Incubate antibody overnight.
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis.
- Low-abundance target: Add more chromatin or magnetic beads (30 µL).

With my Magnetic ChIP Kit, what can cause no or low PCR signal in the total input control samples?

Here are possible causes and solutions:

- PCR amplification conditions were not fully optimized: Optimize PCR conditions using samples known to contain the target amplicon; Check primer design
- Insufficient amount of sample DNA added to the PCR reaction: Increase the amount of sample DNA added to the PCR reaction
- Nuclei not fully lysed: Monitor sonication of nuclei by microscope to ensure full lysis