Collibri™ Stranded RNA Library Prep Kit for Illumina™ Systems

Le kit de préparation pour bibliothèque d’ARN mutlibrin pour systèmes Illumina est conçu pour la construction robuste de bibliothèques d’ADNc pour le séquençage d’ARN spécifique au brin sur les systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS) d’Illumina. Le kit regroupe les caractéristiques supérieures de la transcriptase inverse SuperScript IV, des particules magnétiques Dynabeads et de l’ADN polymérase Platinum SuperFi, permettant aux utilisateurs d’obtenir des bibliothèques prêtes à l’emploi pour le séquençage de haute qualité.

Le kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Collibri offre :
• Flux de travail court facile à automatiser— l’ARN total peut être converti en bibliothèque prête au séquençage en 6,5 heures
• Colorants inertes dans le réactif (voient l’avancement de la génération de la bibliothèque sans aucun effet négatif sur la qualité)
• Élimination d’ARNr supérieure
• Couverture de transcript uniforme et sensibilité de détection de transcript élevée
• Sensibilité élevée de détection d’expression génétique différentielle
• > 98 % de spécificité au brin
• Détection efficace de l’ARN non codant
• Préservation des informations de séquence à 3‘ extrémités

Ce kit de préparation de bibliothèque d’ARN multibrin Collibri est conçu pour une préparation rapide et pratique des bibliothèques à partir d’entrées d’échantillons de 100 ng à 1 µg d’ARN humain total, de souris ou de rat. Les réactions de ligature d’adaptateur à tube unique et de transcription inverse, ainsi que les étapes de déplétion d’ARNr à base de billes magnétiques et de purification de bibliothèque, permettent d’achever l’ensemble du flux de travail en environ 6,5 heures. Le kit convient aux échantillons d’ARN de qualité différente, y compris les échantillons de FFPE.

Signaux visuels d’intégrité du processus
Pour un maximum de commodité, des indices visuels de l’intégrité des processus sont inclus dans tout le flux de travail de préparation de la bibliothèque. Surveillez l’évolution de la génération de bibliothèque à l’aide des retours d’information visuelle des colorants dans les réactifs critiques. Le mélange de réaction change de couleur en réponse à l’ajout de composants critiques à chaque étape afin de s’assurer que la préparation de la bibliothèque a les plus grandes chances de succès. Les colorants inertes n’interfèrent pas avec les réactions enzymatiques et ne compromettent pas les résultats de séquençage.

Fonctionnement
Le kit de préparation de la bibliothèque d’ARN multibrin Collibri avec le kit de déplétion d’ARNr humain / souris / rat comprend des réactifs de déplétion d’ARN ribosomique (ARNr) pour permettre une vue complète du transcriptome grâce à une élimination supérieure de l’ARNr humain, de souris et de rat. Les adaptateurs entièrement compatibles avec Illumina sont introduits par amplification PCR à l’aide de l’ADN polymérase Platinum SuperFi pour construire des bibliothèques indexées individuellement ou à double indexation unique compatibles avec le séquençage à lecture simple ou à extrémité appariée. Le kit contient 24 ou 96 amorces PCR à code-barres (i7) indexées individuellement pré-mélangées avec un amorceur i5 universel ou des amorces PCR à double indexation uniques qui permettent le multiplexage de 96 bibliothèques maximum. Les étapes de nettoyage optimisées éliminent efficacement les amorces résiduelles et les dimères d’adaptateur / d’amorce tout en préservant les rendements élevés de la bibliothèque.

Un produit associé Le kit de quantification de la bibliothèque Collibri, est recommandé pour les quantifications de bibliothèques basées sur la qPCR avant de procéder au séquençage.

Applications
Le kit de préparation pour bibliothèque d’ARN multibrin Collibri est recommandé pour :
• Études sur l’expression génétique
• Analyse de l’épissage alternatif
• Détection d’ARN non codant et découverte
• Identification de sites de polyadénylation alternatifs
• Détection de fusion génétique
• Détection d’isoformes de transcription