無償のクラウドアプリ（Quality Check）を用いてサンガーシーケンスデータを確認してみませんか？

サンガーシーケンスデータ（.ab1ファイル）は専用のソフトウエアのみで開き、結果を確認することができます。

しかしながら、
・キャピラリーシーケンサーが施設内で供用のため、その付属PCにインストールされた有償ソフトウエアでの解析をすぐに行えない
・自身のPCにサンガーシーケンスデータを閲覧できるソフトウエアがインストールされてない
といったような場合は、すぐにシーケンスデータを確認することができません。

サンガーシーケンスデータを自身のPCで確認したいと思ったことが一度はあるのではないでしょうか？

そこで今回は、無償のクラウドアプリでサンガーシーケンスデータを閲覧する方法について、ご紹介いたします。

▼こんな方におすすめです！
・サンガーシーケンスを実施している方
・サンガーシーケンスデータを開ける無償ソフトウエアをお探しの方
・ご自身のPCでサンガーシーケンスの結果を確認したい方

▼もくじ

無償で利用できるThermo Fisher Connectプラットフォームとは？

Thermo Fisher Connect™プラットフォームはThermofisher.comのアカウントがあれば、無償でご利用いただけるクラウド型のプラットフォームです。
詳しくは下記web pageをご覧ください。

Thermo Fisher Connect プラットフォームには下記リンクからサインインいただけます。

1. Thermo Fisher Connect プラットフォームのDashboard画面からQuality Checkを選択

＜図1＞

2. 「Create New Project」を選択後、プロジェクト名を入力し、「OK」をクリック

＜図2＞

3. 「Import From」をクリック後、「My Computer」をクリックし、該当の.ab1ファイルを選択し、「開く」をクリック

＜図3＞

4. サンプルファイルアップロード後に「QC」アイコンをクリック

＜図4＞

5. 任意のサンプルを選択し、「Actions」＞「View Details」をクリック

＜図5＞

6. 各サンプルの波形を確認

＜図6＞

モビリティファイルを間違って選択してしまった場合や、混合塩基として表示したい場合など、データファイルを基に再解析をすることができます。
・「Basecall」のボタンから設定を変更して再解析できます。

＜図7＞

また、波形を画像ファイルとして出力したり、塩基配列をテキストファイルとして出力することもできます。

・「Actions」＞「Export Traces」から形式を選択してファイルを出力することができます。

＜図8＞

まとめ

・Thermo Fisher Connect プラットフォームは無償で使用できます
・アプリの一つ“Quality Check”はサンガーシーケンスデータを閲覧することができます
・“Quality Check”では再解析や形式を変更してファイル出力ができます

研究用にのみ使用できます。診断目的およびその手続き上での使用はできません。

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